ChemComp-AD7: octyl 3-amino-3-deoxy-2-O-(2,6-dideoxy-alpha-L-lyxo-hexopyranosyl...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: AD7
• 名称: 名称: octyl 3-amino-3-deoxy-2-O-(2,6-dideoxy-alpha-L-lyxo-hexopyranosyl)-beta-D-galactopyranoside; 別称: 2-deoxy-Fuc-3-amino-Gal-H-antigen disaccharide; amino-deoxy-acceptor; 日化辞名称: オクチル2-O-(2,6-ジデオキシ-α-L-lyxo-ヘキソピラノシル)-3-アミノ-3-デオキシ-β-D-ガラクト(以下略)

Chemical information

組成

組成式: C₂₀H₃₉NO₈ / 原子数: 68 / 化学式量: 421.526 / 形式電荷: 0

その他

2rj4

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: AD7 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 2RJ4

履歴

作成	2008年1月4日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O(CCCCCCCC)C2OC(C(O)C(N)C2OC1OC(C)C(O)C(O)C1)CO
• CACTVS 3.341: CCCCCCCCO[CH]1O[CH](CO)[CH](O)[CH](N)[CH]1O[CH]2C[CH](O)[CH](O)[CH](C)O2
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CCCCCCCCOC1C(C(C(C(O1)CO)O)N)OC2CC(C(C(O2)C)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CCCCCCCCO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](N)[C@H]1O[C@H]2C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O2
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CCCCCCCCO[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O1)CO)O)N)O[C@H]2C[C@@H]([C@@H]([C@@H](O2)C)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C20H39NO8/c1-3-4-5-6-7-8-9-26-20-19(16(21)18(25)14(11-22)28-20)29-15-10-13(23)17(24)12(2)27-15/h12-20,22-25H,3-11,21H2,1-2H3/t12-,13-,14+,15-,16-,17+,18-,19+,20+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: GHTLMVRROQXELT-HTYYFBMYSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: octyl 3-amino-3-deoxy-2-O-(2,6-dideoxy-alpha-L-lyxo-hexopyranosyl)-beta-D-galactopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2S,3S,4S,6S)-6-[(2R,3R,4S,5R,6R)-4-amino-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-2-octoxy-oxan-3-yl]oxy-2-methyl-oxane-3,4-diol

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-2rj4:
B-specific alpha-1,3-galactosyltransferase \ G176R +UDP+ADA

PDB-2rj9:
B-specific alpha-1,3-galactosyltransferase (GTB) + UDP+ Amino-deoxy-acceptor