ChemComp-AD4: (3S,3AR,4S,6S,6AR,7S,8S,9BS)-6-(ACETYLOXY)-3,3A-DIHYDROXY-3,6,9-T...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: AD4
名称	名称: (3S,3ar,4S,6S,6ar,7S,8S,9bs)-6-(acetyloxy)-3,3A-dihydroxy-3,6,9-trimethyl-8-{[(2Z)-2-methylbut-2-enoyl]oxy}-7-(octanoyloxy)-2-oxo-2,3,3A,4,5,6,6A,7,8,9B-decahydroazuleno[4,5-B]furan-4-yl 12- ...名称: (3S,3ar,4S,6S,6ar,7S,8S,9bs)-6-(acetyloxy)-3,3A-dihydroxy-3,6,9-trimethyl-8-{[(2Z)-2-methylbut-2-enoyl]oxy}-7-(octanoyloxy)-2-oxo-2,3,3A,4,5,6,6A,7,8,9B-decahydroazuleno[4,5-B]furan-4-yl 12-[(tert-butoxycarbonyl)amino]dodecanoate 別称: ((((3'-DEOXY-3'-THYMIDINYL)-AMINO)CARBONYL)METHYL)

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: AD4

名称

名称: (3S,3ar,4S,6S,6ar,7S,8S,9bs)-6-(acetyloxy)-3,3A-dihydroxy-3,6,9-trimethyl-8-{[(2Z)-2-methylbut-2-enoyl]oxy}-7-(octanoyloxy)-2-oxo-2,3,3A,4,5,6,6A,7,8,9B-decahydroazuleno[4,5-B]furan-4-yl 12- ...
別称: ((((3'-DEOXY-3'-THYMIDINYL)-AMINO)CARBONYL)METHYL)

組成

組成式: C₄₇H₇₅NO₁₄ / 原子数: 137 / 化学式量: 878.097 / 形式電荷: 0

その他

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: AD4

履歴

作成	2006年10月19日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 10.04	O=C(OC(C)(C)C)NCCCCCCCCCCCC(=O)OC2CC(OC(=O)C)(C1C(=C(C(OC(=O)\C(=C/C)C)C1OC(=O)CCCCCCC)C)C3OC(=O)C(O)(C)C23O)C
CACTVS 3.341	CCCCCCCC(=O)O[CH]1[CH](OC(=O)C(C)=CC)C(=C2[CH]3OC(=O)[C](C)(O)[C]3(O)[CH](C[C](C)(OC(C)=O)[CH]12)OC(=O)CCCCCCCCCCCNC(=O)OC(C)(C)C)C
OpenEye OEToolkits 1.5.0	CCCCCCCC(=O)OC1C2C(=C(C1OC(=O)C(=CC)C)C)C3C(C(CC2(C)OC(=O)C)OC(=O)CCCCCCCCCCCNC(=O)OC(C)(C)C)(C(C(=O)O3)(C)O)O

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.341	CCCCCCCC(=O)O[C@@H]1[C@@H](OC(=O)\C(C)=C/C)C(=C2[C@@H]3OC(=O)[C@@](C)(O)[C@@]3(O)[C@H](C[C@](C)(OC(C)=O)[C@@H]12)OC(=O)CCCCCCCCCCCNC(=O)OC(C)(C)C)C
OpenEye OEToolkits 1.5.0	CCCCCCCC(=O)O[C@H]1[C@H]2C(=C([C@@H]1OC(=O)/C(=C\C)/C)C)[C@H]3[C@]([C@H](C[C@]2(C)OC(=O)C)OC(=O)CCCCCCCCCCCNC(=O)OC(C)(C)C)([C@](C(=O)O3)(C)O)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C47H75NO14/c1-11-13-14-20-23-27-35(51)58-39-37-36(31(4)38(39)59-41(52)30(3)12-2)40-47(56,46(10,55)42(53)60-40)33(29-45(37,9)61-32(5)49)57-34(50)26-24-21-18-16-15-17-19-22-25-28-48-43(54)62-44(6,7)8/h12,33,37-40,55-56H,11,13-29H2,1-10H3,(H,48,54)/b30-12-/t33-,37+,38-,39-,40-,45-,46+,47+/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	IBTNJSDBPZIGKM-GGGDSPQJSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	(3S,3aR,4S,6S,6aR,7S,8S,9bS)-6-(acetyloxy)-3,3a-dihydroxy-3,6,9-trimethyl-8-{[(2Z)-2-methylbut-2-enoyl]oxy}-7-(octanoyloxy)-2-oxo-2,3,3a,4,5,6,6a,7,8,9b-decahydroazuleno[4,5-b]furan-4-yl 12-[(tert-butoxycarbonyl)amino]dodecanoate
OpenEye OEToolkits 1.5.0	[(3S,3aR,4S,6S,6aR,7S,8S,9bS)-6-acetyloxy-3,3a-dihydroxy-3,6,9-trimethyl-8-[(Z)-2-methylbut-2-enoyl]oxy-7-octanoyloxy-2-oxo-4,5,6a,7,8,9b-hexahydroazuleno[4,5-b]furan-4-yl] 12-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]dodecanoate

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PDB-2by4:
SR Ca(2+)-ATPase in the HnE2 state complexed with the thapsigargin derivative Boc-12ADT.

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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