ChemComp-9JM: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: 9JM
名称	名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-4-[[5-[4-cyano-2-[(~{E})-hydroxyiminomethyl]phenoxy]-1-oxidanyl-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl] ...名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-4-[[5-[4-cyano-2-[(~{E})-hydroxyiminomethyl]phenoxy]-1-oxidanyl-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: 9JM

名称

名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-4-[[5-[4-cyano-2-[(~{E})-hydroxyiminomethyl]phenoxy]-1-oxidanyl-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl] ...

組成

組成式: C₃₆H₃₈BN₉O₁₈P₂ / 原子数: 104 / 化学式量: 957.495 / 形式電荷: 1

その他

5vrn

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 9JM / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5VRN

履歴

作成	2017年5月15日
公開	2018年5月16日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

CACTVS 3.385	NC(=O)c1ccc[n+](c1)[CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]3O[CH]([CH](O)[CH]3O)n4cnc5c(N)ncnc45)[CH](O)[CH]2O[B]6(O)OCc7cc(Oc8ccc(cc8C=NO)C#N)ccc67
OpenEye OEToolkits 2.0.6	B1(c2ccc(cc2CO1)Oc3ccc(cc3C=NO)C#N)(O)OC4C(C(OC4[n+]5cccc(c5)C(=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC6C(C(C(O6)n7cnc8c7ncnc8N)O)O)O

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	NC(=O)c1ccc[n+](c1)[C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n4cnc5c(N)ncnc45)[C@@H](O)[C@H]2O[B]6(O)OCc7cc(Oc8ccc(cc8/C=N/O)C#N)ccc67
OpenEye OEToolkits 2.0.6	B1(c2ccc(cc2CO1)Oc3ccc(cc3/C=N/O)C#N)(O)O[C@@H]4[C@@H]([C@H](O[C@H]4[n+]5cccc(c5)C(=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]6[C@H]([C@H]([C@@H](O6)n7cnc8c7ncnc8N)O)O)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C36H37BN9O18P2/c38-10-18-3-6-24(20(8-18)11-44-52)60-22-4-5-23-21(9-22)13-57-37(23,51)63-31-29(48)26(62-36(31)45-7-1-2-19(12-45)33(40)50)15-59-66(55,56)64-65(53,54)58-14-25-28(47)30(49)35(61-25)46-17-43-27-32(39)41-16-42-34(27)46/h1-9,11-12,16-17,25-26,28-31,35-36,47-49,51H,13-15H2,(H6-,39,40,41,42,50,52,53,54,55,56)/p+1/b44-11+/t25-,26-,28-,29-,30-,31-,35-,36-/m1/s1

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InChIKey

InChI 1.03	FIJWIPIHKAAZRO-KPRSXZNCSA-O

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SYSTEMATIC NAME

OpenEye OEToolkits 2.0.6	[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-4-[[5-[4-cyano-2-[(~{E})-hydroxyiminomethyl]phenoxy]-1-oxidanyl-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate

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PDB-5vrn:
CRYSTAL STRUCTURE OF THE INHA FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH AN12855, EBSI 4333.

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新型コロナ情報

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