ChemComp-9JJ: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: 9JJ
名称	名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-3-oxidanyl-4-[[1-oxidanyl-6-[4-(trifluoromethyl)phenoxy]-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl- ...名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-3-oxidanyl-4-[[1-oxidanyl-6-[4-(trifluoromethyl)phenoxy]-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: 9JJ

名称

名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-3-oxidanyl-4-[[1-oxidanyl-6-[4-(trifluoromethyl)phenoxy]-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl- ...

組成

組成式: C₃₅H₃₇BF₃N₇O₁₇P₂ / 原子数: 102 / 化学式量: 957.459 / 形式電荷: 1

その他

5vrm

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 9JJ / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5VRM

履歴

作成	2017年5月15日
Modify charge	2017年5月15日
公開	2018年5月16日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

CACTVS 3.385	NC(=O)c1ccc[n+](c1)[CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]3O[CH]([CH](O)[CH]3O)n4cnc5c(N)ncnc45)[CH](O)[CH]2O[B]6(O)OCc7ccc(Oc8ccc(cc8)C(F)(F)F)cc67
OpenEye OEToolkits 2.0.6	B1(c2cc(ccc2CO1)Oc3ccc(cc3)C(F)(F)F)(O)OC4C(C(OC4[n+]5cccc(c5)C(=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC6C(C(C(O6)n7cnc8c7ncnc8N)O)O)O

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	NC(=O)c1ccc[n+](c1)[C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n4cnc5c(N)ncnc45)[C@@H](O)[C@H]2O[B]6(O)OCc7ccc(Oc8ccc(cc8)C(F)(F)F)cc67
OpenEye OEToolkits 2.0.6	B1(c2cc(ccc2CO1)Oc3ccc(cc3)C(F)(F)F)(O)O[C@@H]4[C@@H]([C@H](O[C@H]4[n+]5cccc(c5)C(=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]6[C@H]([C@H]([C@@H](O6)n7cnc8c7ncnc8N)O)O)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C35H36BF3N7O17P2/c37-35(38,39)19-4-7-20(8-5-19)59-21-6-3-18-12-56-36(51,22(18)10-21)62-29-27(48)24(61-34(29)45-9-1-2-17(11-45)31(41)50)14-58-65(54,55)63-64(52,53)57-13-23-26(47)28(49)33(60-23)46-16-44-25-30(40)42-15-43-32(25)46/h1-11,15-16,23-24,26-29,33-34,47-49,51H,12-14H2,(H5-,40,41,42,43,50,52,53,54,55)/p+1/t23-,24-,26-,27-,28-,29-,33-,34-/m1/s1

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InChIKey

InChI 1.03	OXCOGEVNJKHXNX-IUNYWBDYSA-O

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SYSTEMATIC NAME

OpenEye OEToolkits 2.0.6	[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-ium-1-yl)-3-oxidanyl-4-[[1-oxidanyl-6-[4-(trifluoromethyl)phenoxy]-3~{H}-2,1$l^{4}-benzoxaborol-1-yl]oxy]oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate

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PDB-5vrm:
CRYSTAL STRUCTURE OF THE INHA FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN COMPLEX WITH AN12855, EBSI 4333.

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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