登録情報 | データベース: PDB / ID: 8d9a |
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タイトル | Crystal Structure of Danio rerio histone deacetylase 6 catalytic domain 2 complexed with fluorinated inhibitor 8 |
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要素 | Hdac6 protein |
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キーワード | HYDROLASE/INHIBITOR / Hydrolase / histone deacetylase / inhibitor / metallohydrolase / HYDROLASE-INHIBITOR complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation / epigenetic regulation of gene expression ...tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation / epigenetic regulation of gene expression / angiogenesis / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / zinc ion binding類似検索 - 分子機能 Ubiquitin Carboxyl-terminal Hydrolase-like zinc finger / Zinc finger, UBP-type / Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein / Zinc finger UBP-type profile. / : / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily / Histone deacetylase domain / Ureohydrolase domain superfamily / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type類似検索 - ドメイン・相同性 : / 2,3,5-trifluoro-N-hydroxybenzamide / Hdac6 protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Danio rerio (ゼブラフィッシュ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.75 Å |
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データ登録者 | Watson, P.R. / Christianson, D.W. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM49758 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2022 タイトル: Aromatic Ring Fluorination Patterns Modulate Inhibitory Potency of Fluorophenylhydroxamates Complexed with Histone Deacetylase 6. 著者: Watson, P.R. / Bai, P. / Wang, C. / Cragin, A.D. / Hooker, J.M. / Christianson, D.W. |
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履歴 | 登録 | 2022年6月9日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2022年9月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年10月5日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2023年10月18日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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