ChemComp-87Z: [(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-4-acetamido-6-methyl-3,5-bis(oxi...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 87Z
• 名称: 名称: [(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-4-acetamido-6-methyl-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl] [[(2~{R},3~{S},5~{R})-5-[5-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] hydrogen phosphate; 日化辞名称: 二りん酸α-(5′-チミジル)β-[3-(アセチルアミノ)-3,6-ジデオキシ-α-D-ガラクトピラノシル]

Chemical information

組成

組成式: C₁₈H₂₉N₃O₁₅P₂ / 原子数: 67 / 化学式量: 589.381 / 形式電荷: 0

その他

7s42

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 87Z / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7S42

履歴

作成	2021年9月9日
公開	2021年9月22日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: CC1=CN(C(=O)NC1=O)C1CC(O)C(O1)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC1OC(C)C(O)C(NC(C)=O)C1O
• CACTVS 3.385: C[CH]1O[CH](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH](C[CH]2O)N3C=C(C)C(=O)NC3=O)[CH](O)[CH](NC(C)=O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC1C(C(C(C(O1)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(CC(O2)N3C=C(C(=O)NC3=O)C)O)O)NC(=O)C)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@H]1O[C@H](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2O)N3C=C(C)C(=O)NC3=O)[C@H](O)[C@@H](NC(C)=O)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C[C@@H]1[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@H](O1)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N3C=C(C(=O)NC3=O)C)O)O)NC(=O)C)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C18H29N3O15P2/c1-7-5-21(18(27)20-16(7)26)12-4-10(23)11(34-12)6-32-37(28,29)36-38(30,31)35-17-15(25)13(19-9(3)22)14(24)8(2)33-17/h5,8,10-15,17,23-25H,4,6H2,1-3H3,(H,19,22)(H,28,29)(H,30,31)(H,20,26,27)/t8-,10+,11-,12-,13+,14+,15-,17-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: CWQDRZJUANNJKC-HYPDDMKDSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R,3R,4S,5R,6R)-4-acetamido-3,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-4-acetamido-6-methyl-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl] [[(2~{R},3~{S},5~{R})-5-[5-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-7s42:
Crystal structure of an N-acetyltransferase from Helicobacter pullorum in the presence of Coenzyme A and dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-D-galactose