ChemComp-87E: (2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 87E
• 名称: 名称: (2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-6-(hydroxymethyl)-5-oxidanyl-oxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]-3-oxidanyl-propanoic acid; 別称: Uridine-5'-diphosphate-n-acetylmuramoyl-L-Serine

Chemical information

組成

組成式: C₂₃H₃₆N₄O₂₁P₂ / 原子数: 86 / 化学式量: 766.494 / 形式電荷: 0

その他

7w1g

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 87E / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7W1G

履歴

作成	2021年11月26日
公開	2021年12月29日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: C[CH](O[CH]1[CH](O)[CH](CO)O[CH](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O)[CH]1NC(C)=O)C(=O)N[CH](CO)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC(C(=O)NC(CO)C(=O)O)OC1C(C(OC(C1O)CO)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)NC(=O)C

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@@H](O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O)[C@@H]1NC(C)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)O[C@@H]1[C@H]([C@H](O[C@@H]([C@H]1O)CO)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)NC(=O)C

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C23H36N4O21P2/c1-8(19(35)25-10(5-28)21(36)37)44-18-14(24-9(2)30)22(46-11(6-29)16(18)33)47-50(41,42)48-49(39,40)43-7-12-15(32)17(34)20(45-12)27-4-3-13(31)26-23(27)38/h3-4,8,10-12,14-18,20,22,28-29,32-34H,5-7H2,1-2H3,(H,24,30)(H,25,35)(H,36,37)(H,39,40)(H,41,42)(H,26,31,38)/t8-,10+,11-,12-,14-,15-,16-,17-,18-,20-,22-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: IACRIBHKJKCIBJ-KWWGHZHGSA-N

PDBエントリ

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PDB-7w1g:
Crystal structure of YfiH with C107A mutation in complex with UDP-MurNAc-L-Serine