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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7dxb | |||||||||||||||
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タイトル | Structure of TRPC3 at 2.7 angstrom in high calcium state | |||||||||||||||
![]() | Short transient receptor potential channel 3 | |||||||||||||||
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機能・相同性 | ![]() positive regulation of cardiac muscle hypertrophy in response to stress / Role of second messengers in netrin-1 signaling / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||
![]() | Chen, L. / Guo, W. | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural mechanism of human TRPC3 and TRPC6 channel regulation by their intracellular calcium-binding sites. 著者: Wenjun Guo / Qinglin Tang / Miao Wei / Yunlu Kang / Jing-Xiang Wu / Lei Chen / ![]() 要旨: TRPC3 and TRPC6 channels are calcium-permeable non-selective cation channels that are involved in many physiological processes. The gain-of-function (GOF) mutations of TRPC6 lead to familial focal ...TRPC3 and TRPC6 channels are calcium-permeable non-selective cation channels that are involved in many physiological processes. The gain-of-function (GOF) mutations of TRPC6 lead to familial focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) in humans, but their pathogenic mechanism remains elusive. Here, we report the cryo-EM structures of human TRPC3 in both high-calcium and low-calcium conditions. Based on these structures and accompanying electrophysiological studies, we identified both inhibitory and activating calcium-binding sites in TRPC3 that couple intracellular calcium concentrations to the basal channel activity. These calcium sensors are also structurally and functionally conserved in TRPC6. We uncovered that the GOF mutations of TRPC6 activate the channel by allosterically abolishing the inhibitory effects of intracellular calcium. Furthermore, structures of human TRPC6 in complex with two chemically distinct inhibitors bound at different ligand-binding pockets reveal different conformations of the transmembrane domain, providing templates for further structure-based drug design targeting TRPC6-related diseases such as FSGS. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 599 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 488.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
-タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD
#1: タンパク質 | 分子量: 96118.227 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-非ポリマー , 5種, 32分子 ![](data/chem/img/POV.gif)
![](data/chem/img/Y01.gif)
![](data/chem/img/ZN.gif)
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![](data/chem/img/98R.gif)
![](data/chem/img/Y01.gif)
![](data/chem/img/ZN.gif)
![](data/chem/img/CA.gif)
![](data/chem/img/98R.gif)
#2: 化合物 | ChemComp-POV / ( ![]() #3: 化合物 | ChemComp-Y01 / #4: 化合物 | ChemComp-ZN / #5: 化合物 | ChemComp-CA / #6: 化合物 | ChemComp-98R / [( |
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-詳細
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: ![]() |
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試料調製
構成要素 | 名称: human transient receptor potential channel 3 tetramer タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色![]() ![]() |
急速凍結![]() | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源![]() ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
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解析
CTF補正![]() | タイプ: NONE |
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3次元再構成![]() | 解像度: 2.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 35441 / 対称性のタイプ: POINT |