登録情報 | データベース: PDB / ID: 5x1k |
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タイトル | Vanillate/3-O-methylgallate O-demethylase, LigM, 3-O-methylgallate complex form |
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要素 | Vanillate/3-O-methylgallate O-demethylase |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / Lignin / Sphingobium sp.SYK-6 |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
vanillate/3-O-methylgallate O-demethylase / lignin catabolic process / methyltransferase activity / methylation / cytosol類似検索 - 分子機能 Aminomethyltransferase-like / Aminomethyltransferase, folate-binding domain / Aminomethyltransferase folate-binding domain / GTP-binding protein TrmE/Aminomethyltransferase GcvT, domain 1類似検索 - ドメイン・相同性 3-methoxy-4,5-bis(oxidanyl)benzoic acid / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / Vanillate/3-O-methylgallate O-demethylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Sphingobium sp. SYK-6 (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.15 Å |
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データ登録者 | Harada, A. / Senda, T. |
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資金援助 | 日本, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Japan Society for the Promotion of Science | 14J04356 | 日本 | the Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology | Platform for Drug Discovery, Informatics, and Structural Life Science | 日本 | Japan Agency for Medical Research and Development (AMED) | Platform for Drug Discovery, Informatics, and Structural Life Science | 日本 |
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引用 | ジャーナル: FEBS J. / 年: 2017 タイトル: The crystal structure of a new O-demethylase from Sphingobium sp. strain SYK-6 著者: Harada, A. / Kamimura, N. / Takeuchi, K. / Yu, H.Y. / Masai, E. / Senda, T. |
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履歴 | 登録 | 2017年1月26日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2017年5月17日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年5月31日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年6月28日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.country / _citation.journal_volume ..._citation.country / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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