PDB-5sb5: Tubulin-todalam-9-complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5sb5

タイトル

Tubulin-todalam-9-complex

要素

Stathmin-4
Tubulin alpha-1B chain
Tubulin beta-2B chain
Tubulin-Tyrosine Ligase

キーワード

CELL CYCLE / TUBULIN FOLD / CYTOSKELETON / MICROTUBULE

機能・相同性

機能・相同性情報

tubulin-tyrosine ligase activity / positive regulation of axon guidance / microtubule depolymerization / microtubule-based process / regulation of microtubule polymerization or depolymerization / tubulin binding / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / protein modification process / spindle microtubule / structural constituent of cytoskeleton ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Rattus norvegicus (ドブネズミ)

Gallus gallus (ニワトリ)

Bos taurus (ウシ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

フーリエ合成 / 解像度: 2.31 Å

データ登録者

Muehlethaler, T. / Milanos, L. / Ortega, J.A. / Blum, T.B. / Gioia, D. / Prota, A.E. / Cavalli, A. / Steinmetz, M.O.

資金援助

イタリア,

スイス, 3件

引用

ジャーナル: Angew.Chem.Int.Ed.Engl. / 年: 2022
タイトル: Rational Design of a Novel Tubulin Inhibitor with a Unique Mechanism of Action.
著者: Muhlethaler, T. / Milanos, L. / Ortega, J.A. / Blum, T.B. / Gioia, D. / Roy, B. / Prota, A.E. / Cavalli, A. / Steinmetz, M.O.

履歴

登録	2021年7月8日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2022年4月27日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2022年5月11日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.page_first / _citation.page_last ..._citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.2	2022年6月22日	Group: Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.journal_volume
改定 1.3	2024年5月22日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5sb5.cif.gz	905.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5sb5.ent.gz	745.5 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5sb5_validation.pdf.gz	1.9 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5sb5_full_validation.pdf.gz	1.9 MB	表示
XML形式データ	5sb5_validation.xml.gz	83.4 KB	表示
CIF形式データ	5sb5_validation.cif.gz	115.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sb/5sb5 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sb/5sb5	HTTPS FTP

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グループ登録

ID	G_1002214 (5エントリ) 5sb3 5sb4 5sb5 5sb6 5sb7
タイトル	Todalam compounds complexed with T2R-TTL
解説	Crystal structures of Tubulin-todalam-compound complexes

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関連構造データ

関連構造データ	5lxtS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#175 - 2014年7月微小管 (Microtubules) 類似性 (28) #176 - 2014年8月ダイニン (Dynein) 類似性 (19) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (19) #118 - 2009年10月ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump) 類似性 (1) #168 - 2013年12月 DNAヘリカーゼ (DNA Helicase) 類似性 (1) #195 - 2016年3月 RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#175 - 2014年7月
微小管 (Microtubules)
類似性 (28)
#176 - 2014年8月
ダイニン (Dynein)
類似性 (19)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (19)
#118 - 2009年10月
ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump)
類似性 (1)
#168 - 2013年12月
DNAヘリカーゼ (DNA Helicase)
類似性 (1)
#195 - 2016年3月
RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Tubulin alpha-1B chain

B: Tubulin beta-2B chain

C: Tubulin alpha-1B chain

D: Tubulin beta-2B chain

E: Stathmin-4

F: Tubulin-Tyrosine Ligase

ヘテロ分子

265 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	104.810, 157.711, 180.536
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 4種, 6分子 ACBDEF

#1: タンパク質	Tubulin alpha-1B chain / Alpha-tubulin ubiquitous / Tubulin K-alpha-1 / Tubulin alpha-ubiquitous chain 分子量: 50204.445 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 器官: Brain / 参照: UniProt: P81947
#2: タンパク質	Tubulin beta-2B chain 分子量: 49999.887 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 器官: Brain / 参照: UniProt: Q6B856
#3: タンパク質	Stathmin-4 / Stathmin-like protein B3 / RB3 分子量: 16844.162 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rattus norvegicus (ドブネズミ) / 遺伝子: Stmn4 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63043
#4: タンパク質	Tubulin-Tyrosine Ligase 分子量: 44378.496 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 遺伝子: TTL / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: E1BQ43

-
非ポリマー , 8種, 760分子

#5: 化合物	ChemComp-GTP / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP 分子量: 523.180 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₄P₃ / コメント: GTP, エネルギー貯蔵分子*YM
#6: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#7: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#8: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
#9: 化合物	ChemComp-MES / 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸分子量: 195.237 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₃NO₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#10: 化合物	ChemComp-4CJ / N-{4-[2-(3-fluoroanilino)-1,3-thiazol-4-yl]phenyl}acetamide 分子量: 327.376 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₇H₁₄FN₃OS / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#11: 化合物	ChemComp-ACP / PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER / ADENOSINE-5'-[BETA, GAMMA-METHYLENE]TRIPHOSPHATE / β,γ-メチレンATP 分子量: 505.208 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₈N₅O₁₂P₃ コメント: AMP-PCP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM
#12: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 744 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.8 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.6 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 2% PEG 4K, 4% glycerol, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 0.1 M MES/Imidazole, 5 mM L-tyrosine

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SLS

/ ビームライン: X06DA / 波長: 1.00003 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS 2M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2021年2月23日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.00003 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.31→49.55 Å / Num. obs: 131912 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 13.716 % / B_iso Wilson estimate: 41.39 Å² / CC_1/2: 0.998 / R_merge(I) obs: 0.19 / R_rim(I) all: 0.197 / Χ²: 0.792 / Net I/σ(I): 11.45 / Num. measured all: 1809337 / Scaling rejects: 112

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. possible	Num. unique obs	CC_1/2	R_rim(I) all	% possible all
2.31-2.37	14.019	1.858	1.45	134593	9653	9601	0.583	1.927	99.5
2.37-2.43	14.257	1.571	1.76	134548	9437	9437	0.672	1.629	100
2.43-2.5	14.224	1.268	2.21	130509	9176	9175	0.76	1.315	100
2.5-2.58	14.1	1.084	2.6	125149	8876	8876	0.809	1.124	100
2.58-2.66	13.945	0.893	3.19	120635	8652	8651	0.866	0.927	100
2.66-2.76	13.79	0.755	3.73	115479	8378	8374	0.892	0.783	100
2.76-2.86	13.293	0.591	4.68	107169	8062	8062	0.927	0.615	100
2.86-2.98	12.775	0.469	5.77	99746	7809	7808	0.95	0.489	100
2.98-3.11	14.039	0.349	8.11	104676	7456	7456	0.977	0.362	100
3.11-3.26	13.638	0.274	10.02	97691	7163	7163	0.984	0.285	100
3.26-3.44	12.824	0.206	12.47	87104	6792	6792	0.99	0.215	100
3.44-3.65	14.227	0.154	17.21	92090	6473	6473	0.995	0.16	100
3.65-3.9	14.184	0.119	21.61	86153	6074	6074	0.997	0.124	100
3.9-4.21	13.969	0.096	25.4	79525	5693	5693	0.997	0.099	100
4.21-4.61	13.632	0.08	29.32	71443	5241	5241	0.998	0.083	100
4.61-5.16	12.878	0.074	29.75	60899	4729	4729	0.998	0.078	100
5.16-5.96	13.123	0.085	27.26	55706	4245	4245	0.998	0.088	100
5.96-7.29	12.855	0.081	27.76	46316	3603	3603	0.998	0.084	100
7.29-10.32	13.931	0.056	39.59	39314	2822	2822	0.999	0.058	100
10.32-49.55	12.579	0.049	42.41	20592	1658	1637	0.998	0.051	98.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.19.1_4122	精密化
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.28	データ抽出
XDS		データ削減
PHENIX	1.19.1_4122	位相決定

精密化

構造決定の手法:

フーリエ合成
開始モデル: 5LXT

5lxt

解像度: 2.31→49.55 Å / SU ML: 0.31 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 22.2 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2204	6596	5 %
R_work	0.1882	125303	-
obs	0.1898	131899	99.94 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 175.97 Å² / B_iso mean: 55.0259 Å² / B_iso min: 22.26 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.31→49.55 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	17299	0	195	744	18238
B_iso mean	-	-	47.42	48.62	-
残基数	-	-	-	-	2187

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.31-2.33	0.3181	215	0.2995	4095	4310	99
2.33-2.36	0.326	217	0.2969	4117	4334	100
2.36-2.39	0.3431	217	0.2788	4133	4350	100
2.39-2.42	0.3158	217	0.2649	4108	4325	100
2.42-2.45	0.2742	218	0.2595	4154	4372	100
2.45-2.48	0.2779	218	0.2373	4143	4361	100
2.48-2.52	0.304	218	0.2419	4143	4361	100
2.52-2.56	0.2583	220	0.2346	4165	4385	100
2.56-2.6	0.2663	216	0.2171	4116	4332	100
2.6-2.64	0.25	219	0.2235	4163	4382	100
2.64-2.69	0.2625	218	0.2235	4141	4359	100
2.69-2.73	0.279	217	0.2175	4123	4340	100
2.73-2.79	0.2566	219	0.2187	4159	4378	100
2.79-2.84	0.2548	219	0.2221	4156	4375	100
2.84-2.91	0.2764	219	0.235	4164	4383	100
2.91-2.97	0.2549	219	0.2298	4153	4372	100
2.97-3.05	0.2765	218	0.2094	4150	4368	100
3.05-3.13	0.2033	219	0.1958	4163	4382	100
3.13-3.22	0.261	220	0.1941	4176	4396	100
3.22-3.33	0.2075	219	0.1916	4163	4382	100
3.33-3.45	0.2315	220	0.1904	4177	4397	100
3.45-3.58	0.2282	221	0.1851	4204	4425	100
3.58-3.75	0.223	221	0.1761	4200	4421	100
3.75-3.94	0.2017	220	0.1612	4173	4393	100
3.94-4.19	0.1901	221	0.1545	4211	4432	100
4.19-4.51	0.1736	223	0.1478	4221	4444	100
4.51-4.97	0.173	222	0.1399	4225	4447	100
4.97-5.69	0.1832	224	0.1668	4249	4473	100
5.69-7.16	0.2326	226	0.1842	4293	4519	100
7.16-49.55	0.1548	236	0.1645	4465	4701	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.4236	-0.2651	-0.1862	3.0721	0.1307	1.6997	0.065	0.0493	0.2437	-0.4518	0.1514	-0.2845	-0.9419	0.2576	-0.2343	0.7262	-0.1154	0.1412	0.4175	-0.1239	0.4262	28.9533	97.5071	53.8325
2	1.1416	0.4096	0.3597	2.6739	1.1564	2.4735	-0.0806	0.1387	0.0912	-0.6014	0.3183	-0.3384	-0.6172	0.4592	-0.2439	0.4578	-0.1476	0.1286	0.4811	-0.1802	0.4468	34.8597	83.3056	48.7651
3	0.9459	0.2959	-0.9948	2.9957	0.2459	1.2238	-0.0322	-0.009	-0.1149	0.3753	0.2593	-0.1057	0.2522	0.1971	-0.1467	0.3757	0.0141	-0.0203	0.4218	-0.1427	0.3969	29.7979	73.8375	58.7969
4	1.9071	-0.5175	0.3116	3.0547	0.7969	3.3761	0.131	-0.0287	-0.0911	0.2575	-0.0486	0.0761	-0.0758	0.0438	-0.0433	0.3274	0.0069	0.0655	0.2832	-0.0729	0.3163	21.4446	84.3385	64.7419
5	1.0107	0.5823	-0.1486	1.7911	1.0244	3.9618	0.1183	-0.047	-0.0231	0.4306	-0.2125	0.8591	-0.0951	-0.6914	0.0106	0.4714	-0.0048	0.1338	0.4617	-0.1269	0.5392	9.2436	84.672	71.5784
6	0.579	-0.0318	0.1854	2.9956	1.5773	2.5908	0.0129	-0.1133	0.0003	0.6542	0.0628	0.0629	0.2253	0.1231	-0.0906	0.3893	-0.0169	0.0587	0.3615	-0.0695	0.3513	23.0674	76.8407	69.8869
7	2.8056	-1.0522	-1.2742	2.0468	-0.415	3.0356	0.0289	0.0275	0.3472	-0.0377	0.0744	0.3257	-0.5474	-0.1934	-0.0277	0.3683	0.0415	0.0458	0.3399	-0.0409	0.4427	16.1931	65.1987	22.2075
8	2.392	-0.6756	-0.9233	2.6986	0.1189	2.2855	0.342	0.1627	0.4575	-0.3521	-0.1872	0.0413	-0.9309	-0.1837	-0.1597	0.5729	0.0813	0.0292	0.3253	-0.0134	0.476	16.2855	72.4106	18.0273
9	1.3081	-0.1685	-0.2576	2.4046	0.8135	2.773	0.0831	0.268	0.1363	-0.3027	0.1037	-0.2445	-0.5747	0.3377	-0.1838	0.3745	-0.0397	0.0598	0.4949	-0.046	0.3631	29.1827	56.4481	14.5687
10	1.0934	-0.1555	-0.2201	2.491	1.1957	2.9163	-0.0066	-0.1352	0.0472	0.0238	-0.1029	0.1266	-0.0347	-0.1928	0.0153	0.2128	0.0002	0.0273	0.321	-0.0998	0.3275	17.5268	53.3613	26.5064
11	1.0545	-0.2021	1.5984	0.8967	0.1284	2.8858	-0.0554	-0.2014	0.0779	0.2983	0.0076	0.1549	-0.633	0.0004	0.0361	0.5009	0.0156	0.1037	0.4634	-0.1484	0.5314	19.3017	68.4196	38.4904
12	1.9306	-0.6368	0.3111	1.9887	-0.2547	2.7718	-0.0884	-0.2883	-0.1304	0.0371	-0.057	0.4893	-0.0799	-0.8036	0.1897	0.3461	0.0126	-0.0157	0.4939	-0.2166	0.4248	5.5114	58.8601	38.5363
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14	1.1093	-0.2115	0.2987	0.7515	1.1668	2.1323	-0.0449	-0.16	0.1779	0.3848	-0.1926	0.2269	0.1823	-0.3786	0.2163	0.2855	-0.0453	0.0816	0.3818	-0.0774	0.3556	12.1347	52.2555	39.2083
15	1.0136	-0.495	0.6852	2.7231	1.1418	3.1648	-0.0151	-0.1253	-0.159	0.5894	0.0843	-0.1939	0.5657	0.5237	-0.0657	0.3295	-0.0021	-0.0231	0.3299	-0.0103	0.3199	25.8295	37.8949	30.4825
16	1.0776	-0.2481	0.0942	2.7649	0.1974	1.7053	-0.0364	0.1275	0.0921	-0.2813	0.0817	-0.0325	-0.1474	0.1672	-0.0372	0.2547	-0.0649	0.0362	0.3412	-0.029	0.2916	20.199	33.0904	-11.9966
17	0.836	-0.4025	0.4661	1.2654	0.8048	2.2737	0.0469	0.0048	0.0308	0.0332	-0.1471	0.2224	0.0687	-0.3274	0.1195	0.2134	-0.0432	0.0353	0.3278	-0.0206	0.328	3.873	28.9306	0.4114
18	1.8964	-0.3389	0.756	2.1188	0.7021	2.1771	-0.0813	-0.1885	0.1796	-0.091	-0.1208	0.3108	0.0355	-0.4644	0.1099	0.1968	-0.0427	0.0546	0.2919	-0.0841	0.3328	0.8814	34.9962	8.8402
19	0.7758	-0.6402	-0.4942	2.0408	1.3637	1.8544	-0.052	0.0599	-0.0199	0.3025	0.125	-0.0843	0.3643	0.1706	-0.1409	0.2896	-0.0007	-0.0018	0.2872	-0.0353	0.3329	20.0834	13.474	2.7189
20	2.8851	-0.4504	0.7396	2.6617	0.2682	2.3899	-0.2524	0.4448	0.1904	-0.4543	0.2927	0.1845	-0.0214	-0.1924	-0.0372	0.512	-0.0813	0.0193	0.6511	-0.0065	0.3276	15.2534	12.1453	-41.273
21	1.8262	-0.8224	-0.6123	2.2725	0.0673	1.3573	-0.1476	0.7891	0.1799	-0.6605	0.2177	-0.386	0.09	0.3032	-0.1516	0.6964	-0.1093	0.1771	0.8563	-0.2157	0.4068	28.5701	1.9115	-46.2781
22	1.9124	-0.0426	-0.4228	1.2844	-0.1798	2.0811	-0.1757	0.3217	-0.2065	-0.3282	0.1775	-0.1155	0.3433	-0.0128	-0.0641	0.5655	-0.0401	0.0585	0.5411	-0.1882	0.4255	20.8437	-5.3458	-34.2024
23	1.7702	-0.7403	0.0955	2.2352	0.6072	2.9245	0.0861	0.1971	-0.0422	-0.3426	-0.1196	0.1839	0.2025	-0.3293	0.0191	0.3692	-0.0399	0.009	0.4507	-0.0895	0.316	10.5002	2.7496	-25.1346
24	1.7749	-0.4809	-0.3691	1.2762	0.4505	2.2638	-0.1752	0.2445	-0.204	0.0088	0.0815	0.1528	0.2928	-0.293	0.0457	0.3962	-0.1041	0.0306	0.3811	-0.1034	0.3302	8.4562	-3.0703	-20.9766
25	2.0141	-0.2557	-0.2894	1.9799	0.0531	1.814	-0.2065	0.075	-0.7253	0.0673	0.0596	-0.1043	0.6891	0.4316	-0.0517	0.6767	0.0525	0.0645	0.474	-0.2131	0.5932	30.3018	-17.2267	-24.5039
26	2.3892	-0.6717	-0.186	1.5503	0.6161	0.6925	-0.1578	-0.1668	0.0999	0.7341	0.308	-0.6025	0.2035	0.588	-0.2077	0.9637	-0.029	0.0119	0.6169	-0.1717	0.5044	27.6043	92.7166	82.0196
27	0.1882	-0.4738	-0.587	0.3237	0.3602	0.682	0.0229	-0.0294	-0.0334	0.2015	0.3936	-0.5188	0.3039	0.5208	-0.5179	0.3943	0.0667	0.0353	0.6866	-0.2261	0.6049	43.0858	27.9554	4.137
28	2.3145	0.1692	-2.3012	1.2987	0.1439	2.3379	-0.4178	0.3192	-0.5127	-0.3213	0.0437	-0.1951	0.9953	-0.2558	0.2628	0.7993	-0.0827	0.1329	0.4456	-0.0816	0.5454	7.6054	56.4781	74.2349
29	2.7535	0.0288	0.1448	0.5096	0.0672	1.9542	-0.0136	-0.4743	-0.2316	0.4039	-0.6058	-0.9258	0.0844	1.761	0.6205	0.8053	0.1333	-0.1039	1.5236	0.3995	0.9333	18.8858	58.6027	105.3875
30	1.417	0.3996	-1.3721	0.9666	-0.0716	1.4814	-0.488	-0.227	-0.6346	-0.0042	0.0097	-0.1583	1.1115	0.0179	0.0647	0.9905	0.1179	0.235	0.466	0.1734	0.7669	-0.4282	51.223	99.4008
31	1.6294	0.7028	2.0117	2.2379	-1.1439	4.5667	-0.3989	0.1921	-0.8209	-0.4004	-0.2949	-1.0358	0.7124	0.7325	0.4459	1.8372	0.2597	0.49	0.5945	0.2362	1.4721	4.1512	38.0593	101.6473
32	2.1581	-0.0271	-1.795	0.4324	0.5512	2.653	-0.3982	0.0642	-0.4691	0.0198	0.2368	0.0823	0.6686	-0.1108	0.134	0.7775	-0.0036	0.1245	0.3914	0.0478	0.5403	-2.7743	56.9618	93.083
33	2.3842	-0.4422	-0.5118	0.5784	-1.2501	4.2348	-0.0801	0.6561	-0.1914	-0.0869	0.2048	0.31	-0.0222	-1.0504	-0.1886	0.5396	-0.0989	0.059	0.7695	-0.0651	0.6314	-7.6554	61.9854	78.3482

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 71 )	A	1 - 71
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 72 through 160 )	A	72 - 160
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 161 through 197 )	A	161 - 197
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 198 through 273 )	A	198 - 273
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 274 through 311 )	A	274 - 311
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 312 through 438 )	A	312 - 438
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 1 through 27 )	B	1 - 27
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 28 through 88 )	B	28 - 88
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 89 through 127 )	B	89 - 127
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 128 through 238 )	B	128 - 238
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 239 through 259 )	B	239 - 259
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 260 through 296 )	B	260 - 296
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 297 through 338 )	B	297 - 338
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 339 through 401 )	B	339 - 401
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 402 through 437 )	B	402 - 437
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 1 through 197 )	C	1 - 197
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 198 through 311 )	C	198 - 311
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 312 through 372 )	C	312 - 372
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 373 through 440 )	C	373 - 440
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 1 through 59 )	D	1 - 59
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 60 through 127 )	D	60 - 127
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 128 through 238 )	D	128 - 238
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 239 through 295 )	D	239 - 295
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 296 through 399 )	D	296 - 399
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 400 through 441 )	D	400 - 441
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 6 through 46 )	E	6 - 46
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 47 through 143 )	E	47 - 143
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 1 through 83 )	F	1 - 83
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 84 through 184 )	F	84 - 184
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 185 through 236 )	F	185 - 236
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 237 through 257 )	F	237 - 257
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 258 through 353 )	F	258 - 353
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 354 through 380 )	F	354 - 380

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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