ChemComp-5GS: 2'-C-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 5GS
• 名称: 名称: 2'-C-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate)

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₆N₂O₁₂P₂ / 原子数: 42 / 化学式量: 418.188 / 形式電荷: 0

その他

4wtf

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 5GS / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4WTF

履歴

作成	2014年10月30日
公開	2015年2月11日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OCC2OC(N1C(=O)NC(=O)C=C1)C(O)(C2O)C
• CACTVS 3.385: C[C]1(O)[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[CH]1N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: CC1(C(C(OC1N2C=CC(=O)NC2=O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@@]1(O)[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[C@H]1N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: C[C@]1([C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=CC(=O)NC2=O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16N2O12P2/c1-10(16)7(14)5(4-22-26(20,21)24-25(17,18)19)23-8(10)12-3-2-6(13)11-9(12)15/h2-3,5,7-8,14,16H,4H2,1H3,(H,20,21)(H,11,13,15)(H2,17,18,19)/t5-,7-,8-,10-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: LFWWNDZBFDONAW-VPCXQMTMSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-C-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: [(2R,3R,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-methyl-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-4wtf:
CRYSTAL STRUCTURE OF HCV NS5B GENOTYPE 2A JFH-1 ISOLATE WITH S15G E86Q E87Q C223H V321I MUTATIONS AND DELTA8 BETA HAIRPIN LOOP DELETION IN COMPLEX WITH GS-639475, MN2+ AND SYMMETRICAL PRIMER TEMPLATE 5'-CAAAAUUU