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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5g3w
タイトル
Structure of HDAC like protein from Bordetella Alcaligenes in complex with the photoswitchable inhibitor CEW65
要素
HISTONE DEACETYLASE-LIKE AMIDOHYDROLASE
キーワード
HYDROLASE / HDAH / HDAC / HDLP
機能・相同性
機能・相同性情報
加水分解酵素; ペプチド以外のCN結合加水分解酵素; 鎖状アミドに作用 / histone deacetylase activity / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能
解像度: 1.6→125.57 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.977 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.962 / SU B: 3.126 / SU ML: 0.048 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.089 / ESU R Free: 0.072 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.16662
9836
5 %
RANDOM
Rwork
0.12496
-
-
-
obs
0.12701
187354
99.6 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK