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- EMDB-52844: Cryo-EM structure of the kinetoplastid post-catalytic trans-splic... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-52844
タイトルCryo-EM structure of the kinetoplastid post-catalytic trans-spliceosome (P complex)
マップデータComposite map
試料
  • 複合体: Leishmania tarentolae post-catalytic trans-spliceosome (P complex)
    • タンパク質・ペプチド: x 47種
    • RNA: x 7種
  • タンパク質・ペプチド: x 1種
  • リガンド: x 6種
キーワードTrans-spliceosome / Spliceosome / SPLICING
機能・相同性
機能・相同性情報


U2-type post-spliceosomal complex / spliceosomal complex disassembly / pre-mRNA 3'-splice site binding / Lsm1-7-Pat1 complex / U6 snRNP / generation of catalytic spliceosome for first transesterification step / post-mRNA release spliceosomal complex / U12-type spliceosomal complex / pICln-Sm protein complex / U2-type catalytic step 1 spliceosome ...U2-type post-spliceosomal complex / spliceosomal complex disassembly / pre-mRNA 3'-splice site binding / Lsm1-7-Pat1 complex / U6 snRNP / generation of catalytic spliceosome for first transesterification step / post-mRNA release spliceosomal complex / U12-type spliceosomal complex / pICln-Sm protein complex / U2-type catalytic step 1 spliceosome / small nuclear ribonucleoprotein complex / SMN-Sm protein complex / spliceosomal tri-snRNP complex / P granule / snRNP binding / U4 snRNP / U2-type catalytic step 2 spliceosome / mRNA cis splicing, via spliceosome / U1 snRNP / U2 snRNP / U2-type prespliceosome / generation of catalytic spliceosome for second transesterification step / precatalytic spliceosome / pre-mRNA intronic binding / spliceosomal complex assembly / Prp19 complex / spliceosomal tri-snRNP complex assembly / U5 snRNP / U2 snRNA binding / U5 snRNA binding / U1 snRNA binding / nuclear-transcribed mRNA catabolic process / U6 snRNA binding / U4/U6 x U5 tri-snRNP complex / RNA processing / protein K63-linked ubiquitination / spliceosomal snRNP assembly / catalytic step 2 spliceosome / spliceosomal complex / RNA splicing / helicase activity / peptidylprolyl isomerase / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / mRNA splicing, via spliceosome / RING-type E3 ubiquitin transferase / mRNA processing / metallopeptidase activity / regulation of gene expression / ubiquitin protein ligase activity / nucleic acid binding / RNA helicase activity / RNA helicase / ribosome / ribonucleoprotein complex / DNA repair / hydrolase activity / mRNA binding / chromatin binding / GTPase activity / GTP binding / DNA binding / RNA binding / ATP binding / nucleus / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
NF-kappa-B-activating protein, C-terminal / NF-kappa-B-activating protein / NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain / Cactin, C-terminal / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / Prp18 / Pre-mRNA-splicing factor 18 / Prp18 domain / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / cwf21 ...NF-kappa-B-activating protein, C-terminal / NF-kappa-B-activating protein / NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain / Cactin, C-terminal / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / Prp18 / Pre-mRNA-splicing factor 18 / Prp18 domain / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / cwf21 / Pre-mRNA-splicing factor Isy1 / Pre-mRNA-splicing factor Isy1 superfamily / Isy1-like splicing family / Sm-like protein Lsm4 / U6 snRNA-associated Sm-like protein Lsm1/8 / Helix hairpin bin domain superfamily / : / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / mRNA splicing factor Cwf21 domain / Pre-mRNA-processing factor 17 / Pre-mRNA-splicing factor 19 / Pre-mRNA-processing factor 19 / : / : / Prp19/Pso4-like / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin A-like / Myb-like domain profile. / : / Pre-mRNA-splicing factor Syf1/CRNKL1 C-terminal HAT repeat / U-box domain / WD repeat Prp46/PLRG1-like / G10 protein / : / Pre-mRNA-splicing factor BUD31 / Initiation factor eIF-4 gamma, MA3 / : / : / MA3 domain / Pre-mRNA-splicing factor Syf1/CNRKL1 N-terminal HAT repeat / MI domain profile. / Domain in DAP-5, eIF4G, MA-3 and other proteins. / MIF4G domain / U2 small nuclear ribonucleoprotein A' / Middle domain of eukaryotic initiation factor 4G (eIF4G) / MIF4G-like, type 3 / Brr2, N-terminal helicase PWI domain / N-terminal helicase PWI domain / : / Winged Helix-turn-helix domain / Sec63 Brl domain / U-box domain profile. / Leucine-rich repeat / : / Pre-mRNA-splicing factor Syf1-like / Snu114, GTP-binding domain / Modified RING finger domain / U-box domain / Sec63 domain / Sec63 Brl domain / : / Nucleolar protein 10-like, N-terminal domain / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 / Small nuclear ribonucleoprotein E / Small nuclear ribonucleoprotein F / : / Helicase associated domain (HA2), ratchet-like / DEAD-box helicase, OB fold / Oligonucleotide/oligosaccharide-binding (OB)-fold / Helicase associated domain (HA2), winged-helix / Helicase-associated domain / Helicase associated domain (HA2) Add an annotation / Sm-like protein Lsm7/SmG / Like-Sm (LSM) domain containing protein, LSm4/SmD1/SmD3 / Sm-like protein Lsm6/SmF / LSM domain / LSM domain, eukaryotic/archaea-type / snRNP Sm proteins / Myb-type HTH DNA-binding domain profile. / HAT (Half-A-TPR) repeat / HAT (Half-A-TPR) repeats / Myb domain / : / Sm domain profile. / Myb-like DNA-binding domain / Elongation Factor G, domain II / Elongation Factor G, domain III / DNA/RNA helicase, ATP-dependent, DEAH-box type, conserved site / DEAH-box subfamily ATP-dependent helicases signature. / LSM domain superfamily / Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G C-terminus / Elongation factor EFG, domain V-like / Elongation factor G C-terminus / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain profile. / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain / Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD / Cyclophilin-like domain superfamily / PROCT domain
類似検索 - ドメイン・相同性
CWF21 domain-containing protein / Sm domain-containing protein / Sm domain-containing protein / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / G10 protein / Uncharacterized protein / Cell division control protein / ATP-dependent RNA helicase, putative / Uncharacterized protein / LSM domain-containing protein ...CWF21 domain-containing protein / Sm domain-containing protein / Sm domain-containing protein / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / G10 protein / Uncharacterized protein / Cell division control protein / ATP-dependent RNA helicase, putative / Uncharacterized protein / LSM domain-containing protein / Uncharacterized protein / Pre-mRNA-splicing factor 18 / Pre-mRNA-splicing factor Syf1-like N-terminal HAT-repeats domain-containing protein / Small nuclear ribonucleoprotein, putative / peptidylprolyl isomerase / Lsm7p protein, putative / Sm domain-containing protein / Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein / Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein / RRM domain-containing protein / Pre-mRNA-processing factor 19 / Small nuclear ribonucleoprotein E / U2 small nuclear ribonucleoprotein 40K, putative / Lsm5p, putative / Uncharacterized protein / Sm protein G / U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 / Sm protein B / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 / LSM domain-containing protein / Small nuclear ribonucleoprotein component-like protein / Uncharacterized protein / Splicing factor Cactin C-terminal domain-containing protein / Prp8 protein homologue, putative / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 / Sm protein F / Pre-mRNA-splicing factor Syf1/CRNKL1-like C-terminal HAT-repeats domain-containing protein / RNA helicase / Nucleolar protein 10-like N-terminal domain-containing protein / Unspecified product / Uncharacterized protein / MI domain-containing protein / NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain-containing protein / Small nuclear ribonucleaoprotein, putative
類似検索 - 構成要素
生物種Leishmania tarentolae (真核生物)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å
データ登録者Nadenoen T / Vanden Broeck A
資金援助 ベルギー, European Union, 2件
OrganizationGrant number国
Fonds National de la Recherche Scientifique (FNRS)MISU F.6005.25 ベルギー
European Research Council (ERC)TranSplice 101162011European Union
引用ジャーナル: To Be Published
タイトル: Structural basis for kinetoplastid SL trans-splicing
著者: Nadenoen T / Vanden Broeck A
履歴
登録2025年2月17日-
ヘッダ(付随情報) 公開2026年9月2日-
マップ公開2026年9月2日-
更新2026年9月2日-
現状2026年9月2日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_52844.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_52844.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Composite map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.07 Å/pix.
x 400 pix.
= 426. Å		1.07 Å/pix.
x 400 pix.
= 426. Å		1.07 Å/pix.
x 400 pix.
= 426. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.065 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.8
最小 - 最大0.0 - 10.251597
平均 (標準偏差)0.11484691 (±0.19539194)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 426.00003 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Leishmania tarentolae post-catalytic trans-spliceosome (P complex)

全体名称: Leishmania tarentolae post-catalytic trans-spliceosome (P complex)
要素
  • 複合体: Leishmania tarentolae post-catalytic trans-spliceosome (P complex)
    • タンパク質・ペプチド: Prp8 protein homologue, putative
    • タンパク質・ペプチド: ATP-dependent RNA helicase, putative
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein component-like protein
    • タンパク質・ペプチド: PRKR-interacting protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Splicing factor Cactin C-terminal domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: RNA-binding motif protein
    • タンパク質・ペプチド: Splicing regulator SDE2-like protein
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
    • タンパク質・ペプチド: G10 protein
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
    • タンパク質・ペプチド: Spliceosome-associated CWC15-like protein
    • タンパク質・ペプチド: Cell division control protein
    • タンパク質・ペプチド: CWF21 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Crooked neck-like protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SYF1
    • タンパク質・ペプチド: RNA helicase
    • タンパク質・ペプチド: U2 small nuclear ribonucleoprotein 40K, putative
    • タンパク質・ペプチド: RRM domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: MI domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SLU7
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor 18
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: PRP19-related complex protein 3
    • タンパク質・ペプチド: Unspecified product
    • タンパク質・ペプチド: SNW domain-containing protein 1
    • タンパク質・ペプチド: peptidylprolyl isomerase
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor ISY1 homolog
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SPF27
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-processing factor 19
    • タンパク質・ペプチド: Probable RNA helicase
    • RNA: Unidentified protein
    • タンパク質・ペプチド: LSM domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Sm domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
    • タンパク質・ペプチド: LSM domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Sm domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Lsm7p protein, putative
    • RNA: Y-branched pre-mRNA
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2
    • タンパク質・ペプチド: Lsm5p, putative
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleaoprotein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein E
    • タンパク質・ペプチド: Sm protein F
    • タンパク質・ペプチド: Sm protein G
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3
    • タンパク質・ペプチド: Sm protein B
    • RNA: SL-ligated pre-mRNA
    • RNA: SL RNA outron
    • RNA: U2 snRNA
    • RNA: U5 snRNA
    • RNA: U6 snRNA
  • タンパク質・ペプチド: Sm domain-containing protein
  • リガンド: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE
  • リガンド: 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine

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超分子 #1: Leishmania tarentolae post-catalytic trans-spliceosome (P complex)

超分子名称: Leishmania tarentolae post-catalytic trans-spliceosome (P complex)
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#39, #41-#55
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)

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分子 #1: Prp8 protein homologue, putative

分子名称: Prp8 protein homologue, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 278.149188 KDa
配列文字列: MSVSVPPGFE DDDDTVAVDP ALLAEMEEEE QKESRKQQIL TWQRMNTERY GFRAAYRAAV GEKDLMPPEF IRKVVKDNGD LGGKRFKSE RKLCVGMLPY IPLALFKLLE NMPMPWEEAR YVTVVYHVGG VLTIVDDTPT VAEPLYVSQW GSVWTKMRAN K VELLQEGG ...文字列:
MSVSVPPGFE DDDDTVAVDP ALLAEMEEEE QKESRKQQIL TWQRMNTERY GFRAAYRAAV GEKDLMPPEF IRKVVKDNGD LGGKRFKSE RKLCVGMLPY IPLALFKLLE NMPMPWEEAR YVTVVYHVGG VLTIVDDTPT VAEPLYVSQW GSVWTKMRAN K VELLQEGG GFRRAVHKGD ENEPPLDFAD YLMDRVPPPP VLDDLDEEDN AGIVGWFYDP FPRLVAPNQI RGSRRPNGYY FT LDVMEAL YRNASPILPT LDDRNYFYLW DLKSFYAAKA MHLSIPRGPK FEAPPSICTK KDEDDDWTEF NDLRRIIHRD NPR KPRFTM LTERQIAFPF LYGSVVDGVE LAPYHYPATV RVENDDPELP CFTFHPSLNA IKAVEKKYTD VPHSQAALCS STWH RADCQ CLENAADVSL ELPDDFEPFL SALPLEQPNT KTALALLFAP PPYNSFEGGM KRRIDVPLCD KWYQDPPDLL TTDDR DKIL RSYTQLLKHH VKRSLQHRVR LRSSAAAAAA RAEGAVTMDM NAMQEKSRLE KMAEMRYFSK TRMEWLEAAL QVMRQG HNM LVQLINMKCL PYVHIDYNFE AKPTRTLTTK EIKKSRLGPA FHMVRELLGF MKRLVDMHVM YRLGSIDALQ LADATQY LF SHVGVLTGVY RYKLRAMRQI KRSRDLKHML YSKFNVGGVP SGPGNGFWGP AWRVWVFFMR GMTPLLQRYL SNLTDRVL H GRLQKGKTAG KKITRQRIEP DKDVNIKEAF RRELREMLPD NVKASVIVTM DQHMNEAFRH WRAGLPWSVP GLAKPLTDL VCKYVKLRSE EYIRTTQLQR RRISEGDTVD KQAFMKNLGR LTRLKLMDEQ RRQRRYMTGE DASTIMAPTE ATEIYRMMAN WLNDRGFKK ISFPDPSKTA ELSLLQLSLN RLRDQHNIAN RLTANQREEQ ARIEESFNAP HEALSRIVDA LAHQRRFKNV E VEYMDNFS HLYPLYTVVP QDKMVDSFLD QYLWYKAMNV QRLFPNWVKP SDVEPLPQLV YKWCEGINNI PDIWDVSHDE SV VLLHSNL QDAFYDNVDW NFFRPMLELI MDKSLVDYIV SRHDVVVEFK DMSYHQYKGL IRGFMFSSFL AQYWGLVMDV LLL GTQRSK EIAGTALKPN PFMSFLRDPY LATSHPIRAY CRYKNEVYIV LRYTKTEADE VRRRYLEETK SDPEMRAINA SVYG FKNAK EWPRDARMRL FLSDVNLARA VLWEFRSRLP PSMATINDAN SFVSVYSKDN PNLLFDMAGF SVRLLPVVRT EADIL ESES MWSLRNHTTK DISCRAFLQV TKEHINIIRN KARRTVMMVG SSTFHSIAAK WNALITEIVP YYREAILGTE ELQAIL ARA EHRMQARVMM ALNSRAKSRF PPAMFYAPSD LGGLGMLSVG HSLIPAKDTI YSKTTSTGVQ FFYAGLTNEE GIPIPNV LQ YYTPWETEVK ESEKAWLEFR TREREAKARG GRVSLDDIED IIDKGIPRIR VRFSRHAPLF HFDTGFRARM EFQRYLAG K YLKNWWFHME HDGNICGGVM ERYRADMNNA LGGVEAILEH SLFKGTGFPS WEGIEFDRSG GFENSKKDTK LAKQQRAGL SKVPNQRFAL WWSPTINRSD IQAGFESKVE TTGVFMCGKL ETIKKSLIKI FSGSLWEKSH GAVVNDLASK LKDSLMDLGA ASITLQQQH PQKSYTFTSS AADVILVSAA RWSVSSKPTS LSDEVGDVYQ HNTTSKFWID VQLRWGNYDS HNIAEYARKK F YEYSTARM YPFPAGIVVA IDLAYNCHSA FGYWIPGMKP FVTKLMPAIM KNNITLNTLR DRMKRDLGLF SSAPTEASLS DT NIAELFS SGMRTWIVDD SATYVTSEQP TPDGGKKFKS ENGAVLVFEP VSGSLKMSVV HRSVFSGQKR RSKLAREKAA EEI ASWLRS CPPSERPSKI IVTRSRFRQT LHNMLVLDYP NIIIGQSDLN LPLPMVLRHS RLVELRIAAM ESKGWEFCIY DDWQ QSLQF QPITCFNLLN LVLRGYHINL QRTRQILVPD LHVEVSVSHF WPTYATRQEW EQVSIRLQEM IIADAARRMN VSPKD FTEK EKEGILLGKR MANVEIQQEE MKEIEAMRRT KLTETQTVNV VTSSGDVVKR KVKAAFDFGA TALNNNWRPR SLADAA FLD ENTPITFDAA GATGASDQLI FSEDVIQKLL ACCDVKVQCC AYMFGHALPD SPNIKEVLCV MIPPQFGTAV EARTPPR IP FGAAALQEAN LSFLGLMRIG ESEAQLTSHD LALQARALIT NEGMVPQGFV TAVLEMSEEG VVVRCYSTTA DGIAWAQS E YEGLLKKTPA ATDPSFSSPC RGSLSSEARG FFLVPADRVW NYFFKGALWR ENTEYDVVVD VPLPFFDALH RPDHFLNFT RIGDGSELVD EADPNDVFEN ESGLRGE

UniProtKB: Prp8 protein homologue, putative

+
分子 #2: ATP-dependent RNA helicase, putative

分子名称: ATP-dependent RNA helicase, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 261.270281 KDa
配列文字列: MHFVNRLGVS SLATHYVPHS DLTKSHYERL LLDVRRYLPP GVEDDVEEIA EQVLDIVCST ASGASSSAGT LNEQHQSLER LLDTRLSRD ARDHLLQYGK LITDYVSSDK AEEANGKYGL PASSSGALGV QDLNFAGPSS SDSDSDNSDD AARSDAEERR N VELLTGGA ...文字列:
MHFVNRLGVS SLATHYVPHS DLTKSHYERL LLDVRRYLPP GVEDDVEEIA EQVLDIVCST ASGASSSAGT LNEQHQSLER LLDTRLSRD ARDHLLQYGK LITDYVSSDK AEEANGKYGL PASSSGALGV QDLNFAGPSS SDSDSDNSDD AARSDAEERR N VELLTGGA SSSAAERKER RRKRKALMKA DQNLTQYAFA EEGGIADTVE EAQAWRDAAP PGADGTAGTE MSGDEYDEDG AL TRGAVDT PRIPFEEVSC NAQFLKDTVR RLFPAHDADT CHHLAQRVLN FLSEKEEDDF TLETQLTTCL GGYEDEAVMD WIG DVVQSR WSVVYGLRYA QCATQKERHA VMDSMQHHAL DDPRVEHLYQ SITGKEVDPL NTEQSQQRRE AAAAGGDEEA ASKF ASTAS RQPLLRRVNL QACAFQDERA PHLHVRATVP QGTQRLTYET HDEVLLPPTS SYNTSNPFIQ VGTSFPDWAM PAFAG VEEL NAMQSKVYDC AFHSDENMLV SAPTGAGKTN VAMMAMLRTI AASRNPKTGV IDGHNLKMVY VAPMKALVHE VVRTFS KRL ESLGLTVCEL SGDATMTQQQ MATTQLIVTT PEKWDIVTRK SVELGVASLL KLLIIDEVHL LHNERGPVLE AIVARTM LQ QQLRGEGGIR LVGLSATLPN HADVAAFLQV NRQRGLFVFD NSYRPIPLEQ TYCAIKKIKG MAQSAVMNLV AYDKVLQT V QAEEQVMIFV HSRRETEHTA RYLQKRAAEE RRGYYFVRPD SDSHKALLEA SSGAGGAVLR RSLQQLLPDG FGIHHAGLS RDERNTVEQL FADGHIKVLV CTSTLAWGVN LPANRVIIKG TRVFNGSKGK SELLSALDVL QMFGRAGRAG YGAAVGRATI ITSPDDLHY YLSVLNQQLP IESQMMRRVV DMLNAEITLG HVETVEEGVQ WLQRSYLYVR MRQVPEVYGI RPSASDPLLL H HLANVVHT ACEELKESKM VDYDARSRKV AGTAYGCIAS YCYITVTSMA TYLGLMSNAM QDVELFRVFA SSSEFVNIGV RA EEQAQLK ELLESAPVAV RESRYTPMAK INILLQCYIS QKGLEGLPLM SEMVYVKDSA QRILRALYEI CLVREYGRTA RQF LELYLM TVHRQWAVQS PLRQVRSYLP SKHFDAILPA LERVRVPWEE VRRWSVEDLA EKLSDDRRAQ SAYEAIHAVP HYAV DAAVR PLTRGMLYVD IDILPDFDYV ESLHGRSVCE VVLLIEHTNG RLLHHESLQI PLANVLEKAT YACPPVVVPM VKPAP THLF VRVVSPHWLA ATAFTSVCLL NTLLPPVAAP LREVDQRPPS QDANITSVAE RLAPFQLHTV GEMLFPFQDF TALQSD LID PIFLDHPHNL LVGVPPGGGK TVIAELFVLQ FLLEEALKEK ERASEMQQQN QQEEEVSAAQ STVLLPGKLL YLTSNRD VV HRRALDWRYK FGEVLKQRVV ELAGGEDDGT DTDNAGAVNN AVEVASAAIV LTTGENLIRL VRRGDPALAG VTHIVVDH L HLLRAPEGQA VEECMARLNS EPFLVRRGAG RARVLGLTYP LISTAELGRW LKVSVSHQYN YGVSYRQLRV RMVGMELPG PRSRYESGVI AALKLLRRPS YAAVPTVVFV PTARHARDVA QRILLRCRDN YIAETTAQAT DDPRLAVFLA AGVAYMHKGT SELDALAIQ ELVDTPAVYP TTQTVLPLRL VCAFDAAWRL PAALFTNAIV CCGERLTAFE SDDGERGMSY QDCSAVELMQ M ASRAMNEA VLCTRTPRVW VLGKLLNEPL PLESSLRYAD DFRDTVNTAI AQTRAHNRID VLRVLSSHYF LYHVKSNLHF YG VPTASDV SLYASSFASH VVTSLKELKC IEELQLPRHH VKGDDDANEN GGENSAETGE VQEDEDPHAP LRPTARGMAL AHH CIAVST VENLVRVLPV SLKTEKAALY DSTTYLWQIL SHHCVELTPA HLGDAARVTE AAEYRALHSI ARALPESIGV RYID LDFGA TGTKIYVLVL AYCSRLFPAI YFHAAGSASS VEEDNAATAA FDKHFGHSLY HAAVPPATRD ALCSAVSDEV AQRFV QDLR SILPTVRRVV TAVVELLDGD TQAWAVARLI RFVACLQQQE WDSDPPVAQL PCWRASRWAS VEARQAIQSS CTLQDL QTN RAEAASKLEP ALRGVLTTDD AALVVPRVLA SAAQDAAGVP QVVSISAKGR VEEMNGVLAM VVSVTAQLRW SPPATLK LP EGSNGAECTP QTDFIEDAAP ALKWWVRCVI LHRPSATLRA GPSESTRQLA LRVSTAKGVA GAEATSLYEV SSDLFFSL A RLEAEDLDAV EMCAVLTSMA YCGVEATAAV LFEADGEEEA EDEGNT

UniProtKB: ATP-dependent RNA helicase, putative

+
分子 #3: Small nuclear ribonucleoprotein component-like protein

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein component-like protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 110.616109 KDa
配列文字列: MDFGYDEYGN RTSAGNGDGR RGEEGHAEGR SAQGSRATSP SNSHGAEEDH QRRVLDSSDS ESRSDFSDDV ELVIGEEGTQ ALHQPLVEQ SELQSQGRRG MGWSREAQFL LENRYAGRDG KASSELLLLA GNRRHQRAQD ASASRSYLDI LSTLPDRMRN V VVAGSLHH ...文字列:
MDFGYDEYGN RTSAGNGDGR RGEEGHAEGR SAQGSRATSP SNSHGAEEDH QRRVLDSSDS ESRSDFSDDV ELVIGEEGTQ ALHQPLVEQ SELQSQGRRG MGWSREAQFL LENRYAGRDG KASSELLLLA GNRRHQRAQD ASASRSYLDI LSTLPDRMRN V VVAGSLHH GKTSVVELLL NERSYHKRQD EVDREMTLKS HVLTTITGGA VLQPTSRQVT VIDTPGHPDL IGETASGMRL AD AVLFCVD AAESLSDHSE RLLRHAIVNE QLPIVLVITK VDRLMIDIKL PPLDAYRKLR MVVDAVNNVI AGCGTTYDTF LVS PERGTV CFSSAKLGLF FSLETFAMKY AVVYPSISAG ALATKLWGQV TYEKKEFKKI VNFRQRPTFV QFVLEPLYKI VAHS VTGEA EQTLSPNLAK LPRSPLAALQ EAMRYFCGAP AGETLDAILS VLPTPLSRSQ WLSEKYGAGA LCSMTRDAVA AAVER GEAG AAAATADDLV IAVASLQRVF DAQDTLAAVV RVVQGTLRVN SSSTSKNTSV PSSRHGDPSR LRLIAFDEFS SDADPY YEV EVQGLYLRTV EDGFVPVQRA TAGQTVYATG LPARSGSHIV LVGGAAVAAV LAEDEGAPSP PEAFGMTSEW VVSIKVR SL GFPHPLLHVS MEVRDPGKAN SVQEGLGVLL RTSPGLDVHK EETGEYTISG FGELQLDTAL HELRHGLCPN VPVGISQP F VTFAETVHDT EGLLAMTGTR NNSVGFVSGA LPRAFTQAIE YEQLRLFSTT LDEDRQPRKL WTVLRRDYGF DALDAQHVL AAGPDGTKGP SILIDDTLEE EAHYPLKAAH QRAIVSAFRS TMAAGPLVGE MVRGVAAKLI FANIDASTRD AVVLSNARTA LRHSLFGAR PRLMEPVMAV EILCAPECVS QLGDILQQRR GTMLGEEFIS ATTLIRARGL VPAMDSFGVE TQIRMLTHGQ A FPLFRFHQ WDVVPGDPFD ANIHVGPLEP ARGHQLARDF VLKTRFRKGL PQNMLTDL

UniProtKB: Small nuclear ribonucleoprotein component-like protein

+
分子 #4: PRKR-interacting protein 1

分子名称: PRKR-interacting protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 18.26634 KDa
配列文字列:
MSIPSSSGKS HGGNAPPPLT PEEKAARDAR LQREHESYIR GIATMRSLPR LRSTIAGAGG KTNTNTRIAE EREEVRQQHL RAAAASAAE LQQRRQAHQE KVQKLESTQA KKRKRRAAKK LKKQQRLEEK LRSRLDSHSD SSSACSAFSS SVSASSSNES G RDDVDA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #5: Splicing factor Cactin C-terminal domain-containing protein

分子名称: Splicing factor Cactin C-terminal domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 78.806461 KDa
配列文字列: MDWDRPSGKR RRTDEDEACE ALGGLLRQTA SRAMERVRLQ RQQRGWESQL TILSSSAAAA VVRSVKPMDV LVIRFCLYYL DCSTVAAAN HFVRLAQEVV TSSIERVLVP QLFSRDGSSL PALCEGLVTE HTAEEIQVTV KEVSEFVEAR GALGAWIADA T ATRGDRDD ...文字列:
MDWDRPSGKR RRTDEDEACE ALGGLLRQTA SRAMERVRLQ RQQRGWESQL TILSSSAAAA VVRSVKPMDV LVIRFCLYYL DCSTVAAAN HFVRLAQEVV TSSIERVLVP QLFSRDGSSL PALCEGLVTE HTAEEIQVTV KEVSEFVEAR GALGAWIADA T ATRGDRDD DDYDDYDDAD NYGGGYDDYS RSRDRDDGYS RLTNEEGEGD GEGDHGSPAS PHKDTNDFAL AITLYQACEF WA RVQAFLN SLSLHSAHLH VFAMPPRYER ELLLLLYTVT RGGGDHDEAS VEAVALAGGS ASRVGKGNNA GITPAEGASV SLS ANAVAA KVKKKEAIKQ ESMWDSDDEV AAPVAGENCT DVEGAENTDV VEGPRQPQQL YRASALLADV LALSRCPDVP TASS SPPAG TTSEVALISS PLSAAAPRIS AEATQRLQGL SPKFYKMVYA RLGVMVARDR LHRFDRVSAI TPPEFTVQQR NLQEQ LLQQ EQQQQYKADL MSAALGIPGQ PEAGLPAAYV PDDTYYEKLL HQQHDTIDED EEVYKGEVMD YYLSHPNRPG AATESS SSY SRARSHHRGS SARNGEAEPL MKPHRFCKVK MGFTWTQYNR THYDSRTNPP PRTEMWYEFT LFYPALAHTK RDMRHIF RI EDTPEGPNDQ YCLLVFSVGP PYADVAYRIR KKQWDTRRGG VRISFDQYGR YKLFFRFTNS NYRR

UniProtKB: Splicing factor Cactin C-terminal domain-containing protein

+
分子 #6: RNA-binding motif protein

分子名称: RNA-binding motif protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 8.723855 KDa
配列文字列:
MVTVIRIRNL PATYSAEKLL RLCACFGEVT AFTAVGEEGA GGHSAATADV SFAEKSDALA AAQNMEGMEF DGVFLQVFVR QE

+
分子 #7: Splicing regulator SDE2-like protein

分子名称: Splicing regulator SDE2-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 17.569488 KDa
配列文字列:
MPAGLPRALC CTLLPVQKVI SLTVLQATKD AILEALSKQT DSSPQTFELY VKENNKLVAL RENISSYDSI FALVRCRGGG KGGFRKQLE KKGRGFARAK MKEKRNSTKA APEEEKSQQK KCDTVAVKKR LAKAEPSTTR TLVKQGLAFV INSFQRGNHA

+
分子 #8: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 55.427645 KDa
配列文字列: MNQTSMEKLL AANAAAAQEL RGVGVLNVPA FDVDALLRTP KSNKNDGSAM MSEAMRCRAN VLWRALYPST APPTTAAVAT CSNADGEAD ALPHTDPSRC DVVRQGILTV VSSTSRDAPS KGMAPCSSGV LTHKRGRDRD DVLSVDPEQL KARSALVVSR A AAEEAEAR ...文字列:
MNQTSMEKLL AANAAAAQEL RGVGVLNVPA FDVDALLRTP KSNKNDGSAM MSEAMRCRAN VLWRALYPST APPTTAAVAT CSNADGEAD ALPHTDPSRC DVVRQGILTV VSSTSRDAPS KGMAPCSSGV LTHKRGRDRD DVLSVDPEQL KARSALVVSR A AAEEAEAR KYAAPPKWKL SKVLVGHQGW VWATAVEPGN KWFATGSFDA IIKVWDLETG ALKMNLTGHK EAVRAIALSK LS PYMFSGS DDHSVKCWDL ERNEVVREFF GHKSAVHCVA AHPSLDVVIS GSRDKTVRVF DLRSRAVVHT MLGHTDSVMS LVL QQEEPQ VISGGSDGFI YLWDLASGKA IQRLTRHKKP VRGLAFTAAG DALVSCGADE VRVWKLPSGD FVTNASTRVV HDPQ SRAAT KASTSGTDEQ EEYSYRWSCC AMSPRNVLAV GSQDGELAFY DWNIPQPRRV AGRHYAPYQW TKTKSLPGTL RGEGG INAI TYDVSGTRLI TGESDKSVKI WRMRD

UniProtKB: Nucleolar protein 10-like N-terminal domain-containing protein

+
分子 #9: G10 protein

分子名称: G10 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 35.590562 KDa
配列文字列: MPAPPPSSPS HLAHTSLPPP FPPLLFHLTV ACPNGLPIQH TRRPVEKQKR STMPLIRPGM PKPPKGFDVV LAKLEEYDEQ MKLATQEES KGVVGVTTRP RHNDRSGGCG ARKRPRDDNN AEDGAMVPPA EASSTIAATE SEVGASTAGE DNVEGPEDKP M PPLWRMAA ...文字列:
MPAPPPSSPS HLAHTSLPPP FPPLLFHLTV ACPNGLPIQH TRRPVEKQKR STMPLIRPGM PKPPKGFDVV LAKLEEYDEQ MKLATQEES KGVVGVTTRP RHNDRSGGCG ARKRPRDDNN AEDGAMVPPA EASSTIAATE SEVGASTAGE DNVEGPEDKP M PPLWRMAA INRARTRYVF LAYYKQHIIS KEVYDYCVDM RLIDGGLARR WRLPGYERLC CTACGVPGAA SLAANITSKY AL RDRQERR LSTTASQQRI HDTATCICRV PAAQRKSKYF VACAVCGCHG CCSADAVKGV TEGDNGEQMS KTREEPPMSA PGQ GETSKQ

UniProtKB: G10 protein

+
分子 #10: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 33.586711 KDa
配列文字列: MALTVTSSSS PPGGAEAVYW NLHGHSEDVL SAAAHGRVCA TGDVDGAILL WRFSGEVPEH VCSMNTGGPA AVDAAWSGAA TLLVAQGDG CATIWDVEKG ARLRIISRYA VRGRCAWPVV NCIEATARDS FVFGGDDGYL VTADKRSDKV VVGAHMGVPL T SATTAGFS ...文字列:
MALTVTSSSS PPGGAEAVYW NLHGHSEDVL SAAAHGRVCA TGDVDGAILL WRFSGEVPEH VCSMNTGGPA AVDAAWSGAA TLLVAQGDG CATIWDVEKG ARLRIISRYA VRGRCAWPVV NCIEATARDS FVFGGDDGYL VTADKRSDKV VVGAHMGVPL T SATTAGFS LFAGDVCGTL HWFDTRAGSR EMERIVCGST GITSIMADPL HDRVVTYSMS GSVQVIDTQP FALSSADRLL GA RELGVNE RQALLRGAWG PRGDTVVMPN GKGSVVSVPA NDIMGGATRT VHAGRSGSAM NVSVCVEDEY VVCSGDGGEV AAY RW

UniProtKB: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

+
分子 #11: Spliceosome-associated CWC15-like protein

分子名称: Spliceosome-associated CWC15-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 22.580836 KDa
配列文字列: MPLMSGIIHK ETLPGQSAIK RRRLHTQATT NPCEEGENGD DNEKHVADVL KCVAGENDAI SSSVAQCSPL HSADKSSAKA AHVRSSSSD DDEQIERENA RLAKLREQRS RRQREQQSTG DASPASSAQP SANMPDGVST ASCAASKAQE GAVHTNSYDH D VLFRNPAW ...文字列:
MPLMSGIIHK ETLPGQSAIK RRRLHTQATT NPCEEGENGD DNEKHVADVL KCVAGENDAI SSSVAQCSPL HSADKSSAKA AHVRSSSSD DDEQIERENA RLAKLREQRS RRQREQQSTG DASPASSAQP SANMPDGVST ASCAASKAQE GAVHTNSYDH D VLFRNPAW CNPSKAATPA EKRKQKWDSV LNRTQDSAAF GHFMKNFFK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #12: Cell division control protein

分子名称: Cell division control protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 89.110742 KDa
配列文字列: MSRLHFKGGA WTNAEDEVMK AALAQYGLRD WERVASMLTK KTAMQCRERW ENYLDPRLNI HEAWSLEEEE KLVELQALFP HKWRLISEQ LTRRTPNHYI RPAWLCEQRY LELKDEQEYY LKQQQHQLKD APGGAAGEKQ SLESFMAERR RRRIARKTHE E RASRADTV ...文字列:
MSRLHFKGGA WTNAEDEVMK AALAQYGLRD WERVASMLTK KTAMQCRERW ENYLDPRLNI HEAWSLEEEE KLVELQALFP HKWRLISEQ LTRRTPNHYI RPAWLCEQRY LELKDEQEYY LKQQQHQLKD APGGAAGEKQ SLESFMAERR RRRIARKTHE E RASRADTV SGERSEREMI DMATSRLANQ DQKKGLRKER QQQLAEAAFL AKLESNREGI ESGTLSLRQT RKMEKALEED RQ KPNLVDE IEEAGEEDDT GSEGRDSGEN DEQFEAIDMY EDQKQAGLVK KQRILMKDLT EQQRLIQQRQ INSAADADGD EEA SVSPSG GSRARTALTG VNQDLLKQLT SAPTSASPSL LECNALGTRA ITAAGKPVTG ANSIAAAAAA EAKEELKSTL DNLF ATLPS ASRAAPAPTL TSPSAELQSP FPLPPLKRPR QASRPASVAE GEDGNASHSR EVAQVQVPEV PSRSAGRDSI ETKRT DNNI PEDLFGILDI PAPRKIAKTE ATATAATDSS NGASRSEEPR APIHANADSS DPGASRTSAS NAQYGISFTE SEAEMY MQD ARRWVSVECE RETAASATGT TSDDEPPTPA EIYAAQRLVE QELCSAGCTA VDGTSMANGR GTTRTTQLQH SSSIAEA VR AHTSASGLQA YGAHVNVQQA LHQLSQRVAT QVREANAILR PLRQEWEQVM STAMLSPQDR HALHGFLRDD GQLKGSPS V GDNAEEDEGG GVAPPSVAAY VCERIAGQLQ RARLASRFTK ELRDREVLKM RRDLDEVEHD LQQLQSRERT LQDMYRHKR AQQL

UniProtKB: Cell division control protein

+
分子 #13: CWF21 domain-containing protein

分子名称: CWF21 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 21.499027 KDa
配列文字列: MYNGVEAAAV KGTGLSGYVQ RSRVNVSAAG RAPAEEGAEP VEGGASINPL EQRRAQGENR EMAARLESHH ALRDVRLRVM LYREEREAA GVDPVTIDRE CDELYNSLLV AAKRRLKAQQ KTENAKTAAK FAAAFGVKST ATMTTAGSGG VGSGSAFDRS V QEVEKRRS ...文字列:
MYNGVEAAAV KGTGLSGYVQ RSRVNVSAAG RAPAEEGAEP VEGGASINPL EQRRAQGENR EMAARLESHH ALRDVRLRVM LYREEREAA GVDPVTIDRE CDELYNSLLV AAKRRLKAQQ KTENAKTAAK FAAAFGVKST ATMTTAGSGG VGSGSAFDRS V QEVEKRRS EEERRRHQEA QLVEHLKRMR REGSDAAAP

UniProtKB: CWF21 domain-containing protein

+
分子 #14: Crooked neck-like protein 1

分子名称: Crooked neck-like protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 93.722797 KDa
配列文字列: MKRSRQDNRR LGPAAAAMRR RDVYRDGRQA EEQVSVQKLF QDAVAMQKFH SPNQSGAGAR VMIHSREELA LYRQKRRAEL EESVRRGFK AIGNWIRYAR WEAQQHDFDR MRAVMERAVP VHGENSNLWR DYAELEESNG FTEHARQVWS RGVTALPSSV D LWVKYLAM ...文字列:
MKRSRQDNRR LGPAAAAMRR RDVYRDGRQA EEQVSVQKLF QDAVAMQKFH SPNQSGAGAR VMIHSREELA LYRQKRRAEL EESVRRGFK AIGNWIRYAR WEAQQHDFDR MRAVMERAVP VHGENSNLWR DYAELEESNG FTEHARQVWS RGVTALPSSV D LWVKYLAM EQAAGQDQRV RDVFHRWLAG DAVPPCAYAL AALYEAQQRR QAGCRDILRR CVERFNTPES WLLYGATEQQ VF GDHERAV KVLETAMQAL PDEDIWGLDE CRVPLALAEA HIAARNIVQA RNIFHNALEH VADRPLLLEK VLASYSRFER LHG DGVHSE QAARLCTIQL YEERLRKNKN DFDAYLTLYS LYRDQEGDSQ PCARGQNNTV PETVVGGSAA MMSTALVTSP AAAA SRSRQ VLERALQIPA RDPYGAQQRA VLVMEYARAC EADSELDLAR RTLAQEIKNF PFDAALCPRL WVEAAKIEER HGDTT QARR LLRAGSQVTK DVCLFEEAIQ FEERQRETVI EAMHAAAQET TPPSARELEE ACAPYVVELR TDYQNAIQAF PFSVQW WLR YAKLEEQQQE ILRADALYGA CIRTFNAEAE RVRSFSRRYD LLGHVDAAWA HRIHLHTRRA RALQRQLLRG KVSATEA ET ARAELATRQE ELSRLYTTLL QDVWNAYKHE ALAWFSRYFE TGEGSGTGVL AGAAPKTLPS SLTPATARWS EAVEAVAG Y MERMGASKTG QGAPEGATAA LRGILKSMVE AERHAIRRSL GWTEQTTQFD AVQRAREWGE LLLSPLLEEW SKFEVTHGG SLEAVVASME KPVKRRTRLF KTRP

UniProtKB: Pre-mRNA-splicing factor Syf1/CRNKL1-like C-terminal HAT-repeats domain-containing protein

+
分子 #15: Pre-mRNA-splicing factor SYF1

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SYF1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 89.299875 KDa
配列文字列: MNGDPRVNAL EWEVVKEATT SPKTWAELAR ITAAAPAADP VERANAVTLV YERALRAFSS SYKLWTLYIS YRQHETSKLC GTNEWFQAV REVYERALEE LPKMPMLWVG YMQFVVGSEV PRVTMTRHIL ARALSSLPAT QHHHLWKVAK RWCAMPFVPS A TVRAVWRL ...文字列:
MNGDPRVNAL EWEVVKEATT SPKTWAELAR ITAAAPAADP VERANAVTLV YERALRAFSS SYKLWTLYIS YRQHETSKLC GTNEWFQAV REVYERALEE LPKMPMLWVG YMQFVVGSEV PRVTMTRHIL ARALSSLPAT QHHHLWKVAK RWCAMPFVPS A TVRAVWRL YLSFQRSLHA KREYFQVLVQ KGDFNGFLQE CVHLGLPNKR NTGAAEENDL LLSDVSFWET VQTALQGKGW RF TGGIGPL RDLVSLGKQR CASPVELSMA FAVFLYGQGH MQEGRQELRQ LLEEAPEAHT FMSLYHLAVE VEDQLVESFA VDP DVRHLD DDAYKGIVQH LFGDGDPLSH LERLAREFPL RLNQAQLRNT PHNAALWLKR VELVQENVYA GLSTFDDLIA LYRQ AIQQC TAGMSRVDGA AAQLFYSCAQ ALIRGGRLDS AISVLSEGAW CVPFSSAALN VQLVGLLVEV QLMSSTSPLS VRDAL AERL TSGARNGALK RNRNGLLQSS VALPHVIHHP HTWIIWCDVC AAYDSSNTAA WRHLVESLVS SPAFSAEAAC YVAHKA YVC GQESTAAMML ERAVAATGQN PTAQLFVLEQ YLSFLYVRYG QRVPLHQFRE VFSLVQQVTP VAIRIVPSAV IDLHVSC AY MEATIGLYGT AVRMMQEISF VATAALRGRD EHLRVLQAIL EHSITFTEQR RGYDSVRTYC GALVQRLQNT LLLQRVAL H WAAIEKRSGN TAQAHLILDA CGDSQDPSTE HGEVYWRLWE SLCTSVEEFE KVARRRQQAL IRFSKRENAK RAE

UniProtKB: Pre-mRNA-splicing factor Syf1-like N-terminal HAT-repeats domain-containing protein

+
分子 #16: RNA helicase

分子名称: RNA helicase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: RNA helicase
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 123.210883 KDa
配列文字列: MNAVGSTVGL VDSDDDAIAE QQNMSFLMKL QELYCKTVLY DQLEQMMGHP ATQEESDGYL DDVEGLVKLY YSEMEAAKKM VPKGEEPST AAQREVTEQH ILHSLSVAIN GGAEADEEPD VPISSIQKLY HVLHGCLTTD TVETGLAVGS LLLADDAKRS A EEAARLAY ...文字列:
MNAVGSTVGL VDSDDDAIAE QQNMSFLMKL QELYCKTVLY DQLEQMMGHP ATQEESDGYL DDVEGLVKLY YSEMEAAKKM VPKGEEPST AAQREVTEQH ILHSLSVAIN GGAEADEEPD VPISSIQKLY HVLHGCLTTD TVETGLAVGS LLLADDAKRS A EEAARLAY QQQQRHMHGG VDTASMNTST VERKNAMKVS PEEMFRLAQH VRSGLADEAE LLKLRSEDNE ENGDGAQDVE LN DEEPRFL RNMGFSSMLH RRINYRAPLP SQQLRDARTP QHRQAILDRL AQRQQGDTSK LNSMEAVAQM QEKINMDRRV IAR KAQRAQ QQSREYDFGA AISGREGKLV LDEGRYGRRG EALESEEYSV QPTLLHSELN ALPEEGGFRP QDLPTKLAPW MKHS FGNKP RFGLPETMQT IQEQRVSLPI YAKKEALLNF VDAHRVTVLV GETGSGKTTQ IPQYLAEHGY ADRGMIACTQ PRRVA AETL AMRVAEEYGC RLGEEVGYTV RFRDVTSSLT KIKYMTDGML LREALLDDSF QRYSVIILDE AHERSISTDL LFAIVR QAL RKNEVLKVMV TSATLETEKF CAYFGASEPF RIEGRTFPVE TYYLTDPTTD YVRTALQTVM MIHLQEPPGD VLVFFTG QE EIELGGEQLF RWMEMLRRQV STPLPDLMVL PLTATMPQEV QSKVFEPTPP GCRKVVLATN VAETSITITN LYYVVDSG F CKQNIFDAKH GIDQLKVMPV SQAQAKQRSG RAGRIGPGKC YRMYTEKQFT TDMVPETVPD IMRTSLFHVT LQLKAMGLD LLSLELMDCP PKGAIVSALE KLRYLEALDD DGLLTPLGSR MAQLSIDPSQ SKTLLTAVDL GCSEPVLTIV SMLAVQKRGV FYRPRDQQD ASDAARRQFM QPEGDQLTLM AVYDAWVENG MSEDWCKHNF LKHRMLVEAR DTRDQLKEML ARRNQHISHE N DTNLDEVR KSITAGYFFN AARRVDSHTR SYVTLSDRRE VYVHPSSVLI DDPPKYVLYD DLRMTKREYM TELLAIEPKW LV ELAPAFY AKPKEGRLTK EQAAERFTPI LKSWETGSSW RISRLKKQRR

UniProtKB: RNA helicase

+
分子 #17: U2 small nuclear ribonucleoprotein 40K, putative

分子名称: U2 small nuclear ribonucleoprotein 40K, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 34.821762 KDa
配列文字列: MRLTIDLVRL APQFTNTMLQ REIDLRGLRI SSLDEHVLVL LENNFDAVNL SSNALTALEY FPTKSAVGNS DKDVRMSRVT TLIVHRNEI QRVSVASCVS ALPNVVHFLA DRNRLACVRD LYFLKQWKKL EVVSLEDNPV WESNSNNFDS DKLRAFLVFL C PRLKLINY ...文字列:
MRLTIDLVRL APQFTNTMLQ REIDLRGLRI SSLDEHVLVL LENNFDAVNL SSNALTALEY FPTKSAVGNS DKDVRMSRVT TLIVHRNEI QRVSVASCVS ALPNVVHFLA DRNRLACVRD LYFLKQWKKL EVVSLEDNPV WESNSNNFDS DKLRAFLVFL C PRLKLINY QRVTKADRER AQKAKEEFKK LVQSWEVPLT PCAATPLQLP CNVEGKKMRK RGRDGRTAAA AAVASNVITP DE PKNGETS ATSVSVNVNA DDDTALQVRL DQLEERLLSD DVTAEEIAQL EEEMTEISER MIAARKRKRH

UniProtKB: U2 small nuclear ribonucleoprotein 40K, putative

+
分子 #18: RRM domain-containing protein

分子名称: RRM domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 13.295335 KDa
配列文字列:
MDEPKQTLYI RGLPDKSSAN ELRRALYLYC TQFGPVKAVL YSKSKNFYGQ AFVVFSDVGT ATTARRSLHD RMFYGRQIQA FYAHKQAFC VAPAERRRRD LAREKKLLNT IQKKE

UniProtKB: RRM domain-containing protein

+
分子 #19: NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain-containing protein

分子名称: NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 43.596113 KDa
配列文字列: MSNSVWALAV STTSPSDLPA GDEVEQIVCR SLEENAYSVQ GFWLWQSNFI QSRRRREQRR RRQRNDVASP TKEGSGESAP TRSEAEEAS LQRADEIRGY VSAVLHATGY PYPFASTADD AREGADDPAP STVTDAETAV TSDGLTPASL CSTITDSAAV S GEPPLKVN ...文字列:
MSNSVWALAV STTSPSDLPA GDEVEQIVCR SLEENAYSVQ GFWLWQSNFI QSRRRREQRR RRQRNDVASP TKEGSGESAP TRSEAEEAS LQRADEIRGY VSAVLHATGY PYPFASTADD AREGADDPAP STVTDAETAV TSDGLTPASL CSTITDSAAV S GEPPLKVN RGEGTGATAR IPARPASALA KFVAKARAQH CDLVEHAPVV VATVPARWAE LDEPGTQPGM GRKRIQFSDE PP LVKTPQL SSRGHIRRDN GDNDDDDSFT VQLPAHMGLQ SSSNKDKSDG HSMDAGAGGA GGAEAVAAKH PSQMTRAEFL SQF KRAPRR GEVGQTAEEI AAAEKLGYVM SGSRSVASRM YVDRIQRQLH EHEAAKLQQQ FRKVEDERMD DQLVLGLAQF INSK AKS

UniProtKB: NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain-containing protein

+
分子 #20: MI domain-containing protein

分子名称: MI domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 65.686367 KDa
配列文字列: MSRYVPPHRR QAVASSSEEL SSTSSVAFQQ EAWRALSRSI TGVVNRLNKD NLEQSAVELF RENLIRGRGL LARSMMRTQQ VDPDLTPVL AALTSRINKD LPTVVELLCR RLVVQWNRAY LRKDWRYVEN ASRYLGWLFL LNVVDVDIIY QLLLKHLMSE K RCDEDIDQ ...文字列:
MSRYVPPHRR QAVASSSEEL SSTSSVAFQQ EAWRALSRSI TGVVNRLNKD NLEQSAVELF RENLIRGRGL LARSMMRTQQ VDPDLTPVL AALTSRINKD LPTVVELLCR RLVVQWNRAY LRKDWRYVEN ASRYLGWLFL LNVVDVDIIY QLLLKHLMSE K RCDEDIDQ AAKLFRETFK VMSLKERRSF HEQILTPFRD LLAMDDEELR LSTRSQAVLE SCLKEVQEWE RRKEKEEAIP DH LILFELE TQQRHEMDLD AKYSTEDTLD RYAFDAEYDT HEEQYEAVRK AILGEDWEVE LLQQVAEAEE DEEKGGDEGD DEA ADGPLA EAGTDVSEAA SFPTGAALDT SKTLIDAEER KLRREVYLAM RSSIRADEAV HKILRQMQPQ TERTICFMVI EGCC EERAY RKMYSMAAER LCKSNARFQA FFVEAFHARY ESASDLTLKQ IEYTCKVYSH LLRTNSVYWS RCLSCLDIVE NNESQ RLMI QYLFKGLAEE IGMPRIMERF QKDEELRWHT QQLFPVNRGV EALKSAVNLY VAMGLPEMST GLRAALEEER AAHKRT RLD Y

UniProtKB: MI domain-containing protein

+
分子 #21: Pre-mRNA-splicing factor SLU7

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 46.469113 KDa
配列文字列: MDPNADEPKK ASSVRQLLRQ QRELQEMRKF GLAPLAVDTE THQEISPNIP EFISRAPWYY GATGPTLVHQ RKQGNGATEA PDEVLDEKV DRVVVKGQAT RFTAGACKNC GSRTHKTNEC FQAKKKVGSV YTNRVTGSDI ETHQEPKTYS QKRDRFVGEV G IDLMRGVR ...文字列:
MDPNADEPKK ASSVRQLLRQ QRELQEMRKF GLAPLAVDTE THQEISPNIP EFISRAPWYY GATGPTLVHQ RKQGNGATEA PDEVLDEKV DRVVVKGQAT RFTAGACKNC GSRTHKTNEC FQAKKKVGSV YTNRVTGSDI ETHQEPKTYS QKRDRFVGEV G IDLMRGVR QDQEDDSVDV AAPATARHRP EDVFGSRTAQ HGGVEVKELP KYLHNLDQQD SLFFDPKTGS MRANPNAEDS TK TFRGDLE RYRTGDYYNY VESQYRFLTG QSRSFVDFEF DDVMRRAREQ QQQQEQDNTG EPVAKVLTET PQDVLLRSLY GTS TPKFDS DVPPSSTKES KTPVPSSSPA STTDALTATA TATATATAHS SVQVASLSWV PTRNGHTAVY GSYFDPIHFR WGYA CCKKT DKDATGCNAT HA

UniProtKB: Pre-mRNA-splicing factor SLU7

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分子 #22: Pre-mRNA-splicing factor 18

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor 18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 59.023402 KDa
配列文字列: MSFEGLQGLL KKKKQEQRKG VSDGLAAAAV VDTNASAHTH AIASSVATTH KSATPTTPAH ATCSGGSRSG GSPSTAYDPY AAALQSVQT LQQQQEQQGA LSNTTVGQKR PREEMVQEST LVGALHTPNG SSAAEESDNL DIKSGALVST PPNASLGTPA A PSMKSDDD ...文字列:
MSFEGLQGLL KKKKQEQRKG VSDGLAAAAV VDTNASAHTH AIASSVATTH KSATPTTPAH ATCSGGSRSG GSPSTAYDPY AAALQSVQT LQQQQEQQGA LSNTTVGQKR PREEMVQEST LVGALHTPNG SSAAEESDNL DIKSGALVST PPNASLGTPA A PSMKSDDD VLAQREMGVL ALQMCLTKLA HYWAAERVST KSLSAAAHLA TATAPASAVL YPQHQLSSAE ALLESGDSRT PS ASLLSMP RALHKYLLDR FLAPNSAAPH ATGLPEMMVV DREFELLAQL KAEMEAELHN EATDSVNTAD TKMHTVSEEQ RQL AELLHA LWYLVALLWL HSLDPHQRNG QTCAQSATMP REGTLAPAQQ GWSHAVYLGL QNALPADVRL LQGRAIAEEV DRWR ALART RQDALELLSY VCSDYHTSAA ASLSTTATDF IIPSDLRKNL HTMVVRHLQQ ERNFMAVRQD YVDITMGTAN WKLGL FSGG EVHMRRSMER VERNRIAHLL NNEHATKLLQ AVRELTIFVE RNALAGASTF FCSACSACTM AV

UniProtKB: Pre-mRNA-splicing factor 18

+
分子 #23: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 27.783264 KDa
配列文字列: MSDERRGPPN SHGHLASNVR HSHHSSSQFD QPQQRPYGGA SCNSSAASFN ASYPRRGGAT EERGRGQRPG IHNEQEGRAG QRVWSGERR PFHAGRPNSG PTSLMEDAPR TKLSSYVTPH DAVQDQPAQH GATVVRSGSS ATEGGSILFF SSVQKKGGAF T ASERETYA ...文字列:
MSDERRGPPN SHGHLASNVR HSHHSSSQFD QPQQRPYGGA SCNSSAASFN ASYPRRGGAT EERGRGQRPG IHNEQEGRAG QRVWSGERR PFHAGRPNSG PTSLMEDAPR TKLSSYVTPH DAVQDQPAQH GATVVRSGSS ATEGGSILFF SSVQKKGGAF T ASERETYA QLHRSRAIPN VNRGRNAGNV MGSGVSAKSV ARQYADLERD REAIAIEKAK TAVVGSKRSR FALDDSLSED DG EEVADAE VMGKRPKTSS N

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #24: PRP19-related complex protein 3

分子名称: PRP19-related complex protein 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 45.326121 KDa
配列文字列: MASTSASGPS SSTPLPRQWG SDLLLRKVPF YAQARQYGAA DPDDPQSEGN TLSYGPSSYP LLAAVRSCYE MLNRADVATE TSNLGATTA VVDRSPFSGI DRAAYCLVPP QRKWTSNEGL PADSTSPSSE QSTTLVHPAA AAALLDDTIG PATLTEVLEP W FGIIEDRF ...文字列:
MASTSASGPS SSTPLPRQWG SDLLLRKVPF YAQARQYGAA DPDDPQSEGN TLSYGPSSYP LLAAVRSCYE MLNRADVATE TSNLGATTA VVDRSPFSGI DRAAYCLVPP QRKWTSNEGL PADSTSPSSE QSTTLVHPAA AAALLDDTIG PATLTEVLEP W FGIIEDRF CADEHQEQVE ELARSGKQNT RTKALNQSHS GAAGVLKDGD MVKKDSLRVV DAEVSRMLRR KRICERDEET HG AVYTRLE RSILHYSAAT QEEKEVLHST RVATNDPSTE ALVRGEGMTA PSQSQETWGS RMLSLVTSTV AADTASGYPR RSD EEVNQQ QKVLAYLRRV RWIATQWNST TSKIAFKDAE ASVPLWSQMT EAQRVKAEMH HAQGQRRRFR RPRRDGDGGP TGNS VDADA ALRDSLGSA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #25: Unspecified product

分子名称: Unspecified product / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 18.754662 KDa
配列文字列:
MSTRDQSEVA AAAASTPIPP PSSPSPLPAP SSVGTLPACC PEAFKELYRR GEVPRFGCYD PVYLRQALDT TSTFDSAMHD PEHASFFPP FSLLVRTDAD HSAASSSSLL ASRTADAPAV DEDADQDVAT PTKNRGQHVL GWEHITSAED MWNGPPLTTK V PPASDYER ILLDRAA

UniProtKB: Unspecified product

+
分子 #26: SNW domain-containing protein 1

分子名称: SNW domain-containing protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 57.655543 KDa
配列文字列: MSLQFHDGGS FADCPYIQYP HGMGTQRAPA MVLAAAAAAA VSQVEARVRR LPGTPGSAQV SKGSPLATAC PPSQPSASQA LTVVPHATS EKLYGSCALA TTEVPSTASE TAEEATARTA QMLQETLTAA RQTTEVFDSH SLVVQSRLRA ASNKPNRQAL T LTITAAGG ...文字列:
MSLQFHDGGS FADCPYIQYP HGMGTQRAPA MVLAAAAAAA VSQVEARVRR LPGTPGSAQV SKGSPLATAC PPSQPSASQA LTVVPHATS EKLYGSCALA TTEVPSTASE TAEEATARTA QMLQETLTAA RQTTEVFDSH SLVVQSRLRA ASNKPNRQAL T LTITAAGG DATGVDAAVS DPGPIVR(SEP)PT KKTSLITEAL RLRPGGGNHN KRQRAGDGGS ASGDLAASTS SSSMMLAA V SEGSTGGRGA AAASASSNTV VVPFCVSSWQ NRKKLIVPVE QRLAQQQDDR LDADGGIGDA VMDLAVAMQQ ASKEVAAEL AEKERAKAEE EERRQAALEA AEAEKARQLL EQKAAELAAH AQRRETREQR MERIRLEREL REQEKLAKQQ QRLRERAATR LNITVEDLD ADEQLLRSVE EASVYANSGS GAMASVAPTT ASSSKEKQEA FGGSSRQVPG NDLEDDGDGT LGGSRKAAVR G GVFASAVI SNEGIQREMQ ALAEVEQQQQ QQHHDGIRLR EDDEASAAGD DDDDDGGSFQ LNKFKKKQRL

+
分子 #27: peptidylprolyl isomerase

分子名称: peptidylprolyl isomerase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: peptidylprolyl isomerase
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 20.554562 KDa
配列文字列: MERAARVVQL QSTAGPFSIE LYDNFCADSF WQLARSGQLR RLTFRQLLGG FALLGEVDSV QGHLATVSEV DTAAQSPDNV PLLHVGAGL LSCRPTVGAV TASCFLITLS PQPQLDKTHV VFGRVYSGIH TLEQMSHMQV DADFILYSPV AVMKCSSAVL V RGTAPPGT ...文字列:
MERAARVVQL QSTAGPFSIE LYDNFCADSF WQLARSGQLR RLTFRQLLGG FALLGEVDSV QGHLATVSEV DTAAQSPDNV PLLHVGAGL LSCRPTVGAV TASCFLITLS PQPQLDKTHV VFGRVYSGIH TLEQMSHMQV DADFILYSPV AVMKCSSAVL V RGTAPPGT TAKAVPTSCA VKSLYPTSIL ETLE

UniProtKB: peptidylprolyl isomerase

+
分子 #28: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 68.007312 KDa
配列文字列: MRLRRHACGA HLQYHHQLRL FFLCCTPTWA QVNATTRLFS PFPRHPLVGV LLGRMTSPRA HTLMCAPGAG SRRYNHFLCP SSLSDPVSK LALTKRPPLP WMFPTDRPPT PADIARLKAF RADGRAEAEP ATEVYLHTVM KPRNDRVAEL LALYTSPEDA R KAYPDPPP ...文字列:
MRLRRHACGA HLQYHHQLRL FFLCCTPTWA QVNATTRLFS PFPRHPLVGV LLGRMTSPRA HTLMCAPGAG SRRYNHFLCP SSLSDPVSK LALTKRPPLP WMFPTDRPPT PADIARLKAF RADGRAEAEP ATEVYLHTVM KPRNDRVAEL LALYTSPEDA R KAYPDPPP SLLEVSDGTL SANKEKASGA ATGTGGLTSG TIAQALKRAR RENATAALSV SSGAAAAVTR TARPVSSVDG SP TALFVDG VERVNYLGKS FLEPPSSVLE HEQSTKQKVC QPPRTMRGVF KVPEGYETAT KAASAPTSSS ALVDQSGNSG GEQ RAGKAS GVQQLRWAPP AYGHLLFSGD IGGECRLWNS STRQLLATFA AHTQPIKSLE VTTNAAIMST GSVDGTVAMW DVEA GACTH VLTNPERLPV VQHLHHPSDE AHLLLAAVDK KVVLYDVRVG CRKYQREYTG HMGTIFNLTL LSDGSKMLTT SEDRT LRTW DYRSPVQIKQ FADAAMHAIT HVLHHPTQPE FLAAQSLNNK VIVFRDDGGG RLRLLHEREF TGHTISGTRC QLSFSH DGR YLSSGDIGGK LYVWDWATKK LEKSFKAHAQ MLVSHLWHPI EPTKVVTAAW DGHIKSWV

UniProtKB: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

+
分子 #29: Pre-mRNA-splicing factor ISY1 homolog

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor ISY1 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 31.012246 KDa
配列文字列: MQDRLREIEG TLARAKERKN TILYKLSKRR QEEERLAKLG VAKLPTIPNE VNDEKVIKYV LFKLKQEIGD KTAQLRDQKL LSIDRDGEA VIRAKNDEVN KLLSRKYQWE SRLAFLAGEP MVPRARKKIF FGCAKELPEA ATTQKRQRVE GTKEPGEDEV A ESSDEEEL ...文字列:
MQDRLREIEG TLARAKERKN TILYKLSKRR QEEERLAKLG VAKLPTIPNE VNDEKVIKYV LFKLKQEIGD KTAQLRDQKL LSIDRDGEA VIRAKNDEVN KLLSRKYQWE SRLAFLAGEP MVPRARKKIF FGCAKELPEA ATTQKRQRVE GTKEPGEDEV A ESSDEEEL VGDEAETEEP LTRNNEYLEG VKWLGSSAAD TDLVRFEREA EAKMRAKGDT ALSRSGTKTL ILSYRKEGEI VI PSEEHFK QELVNNRKRE LKERLNALRE KS

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #30: Pre-mRNA-splicing factor SPF27

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 31.636879 KDa
配列文字列: MFDGVVLPFG DAPLGRASST AEEVRWMAFA RDLVLQELQS TPSTAQEWAD ATASSQVAQR GHYQTYLDFI RHMQERLPCD IGLGSPSPI SGAVRPTPGR YRCGPLDRVE VAEPPASLRC AATPSVSTRC APRLRIHEGP MNEDGEKEEP LLSSSSTSLT D GMTQMVAS ...文字列:
MFDGVVLPFG DAPLGRASST AEEVRWMAFA RDLVLQELQS TPSTAQEWAD ATASSQVAQR GHYQTYLDFI RHMQERLPCD IGLGSPSPI SGAVRPTPGR YRCGPLDRVE VAEPPASLRC AATPSVSTRC APRLRIHEGP MNEDGEKEEP LLSSSSTSLT D GMTQMVAS QTSLDGIFFE GLLSQELNLA LWRRCSLPQE ALRCALEEVQ RLDRAACEED AVLRYLNTMR FTEQRAYKRR RA ELQSQLN KTREKVVALE RLVGVETAGL VRREVGTGER LRACMLE

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #31: Pre-mRNA-processing factor 19

分子名称: Pre-mRNA-processing factor 19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO / EC番号: RING-type E3 ubiquitin transferase
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 53.716508 KDa
配列文字列: MLRCNISQRV PTHPVVSTKS GLVFERSLIE KYLDEHGRCP VTGDPLHKED LMTVQGAAPD VSIVSSGGLG AASVPTLLER LQMEWEGVA LEQFSLRQQL TQLQLELAHA LQQYDAACRV IARLSKELDS LRGGKGVAAE EADKGPDAVV VPAAVVRRMD A AEKAARHA ...文字列:
MLRCNISQRV PTHPVVSTKS GLVFERSLIE KYLDEHGRCP VTGDPLHKED LMTVQGAAPD VSIVSSGGLG AASVPTLLER LQMEWEGVA LEQFSLRQQL TQLQLELAHA LQQYDAACRV IARLSKELDS LRGGKGVAAE EADKGPDAVV VPAAVVRRMD A AEKAARHA RKQRKDAAGS AASAPSKLTE EAQWMLTSSS SVSASSVRSA VRLAAAAENS SPGVFVSAIT GDHAIVRYSS DG FSEVARG IGHSAAVHTL VSQPGDILLS AAEDQTVRVW STKGAALTVM HTLRYASGVA AMSQRTVDGA YILSGAADGV LTF SDLESG VHVVETAPLT LDTASRALTC VELHPYSSLA AVAFQPTELQ LWDARELRAD TFISHVRGAA PRTHICSASF SADC VSLAA GLTDGSVYVW DLRQVSAPVA MLPPNTEAIP ATVRYAPDGR SLIVGGRGVV LYDCARLSVS SGAVDAVATA GLQTG GVCD VCWTTSGRDV LCGTVDGVIR LYSTAASAG

UniProtKB: Pre-mRNA-processing factor 19

+
分子 #32: Probable RNA helicase

分子名称: Probable RNA helicase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 128.35375 KDa
配列文字列: MDFSFPHFTR ASTDMVYTQP PLKSLLELVI EAKGRLGLVP QRDVVRHHPS SSPFSHFSDS DEEGEGADRN ANKAEVRQDA VLTTRTSWV PPSYLLDYFF SGEFLSVFLT LHGISASRPV SMLVPPLFTV RDAQLHPLVE AGLCSVLQDA LHSSSRQHRS G GGGGWREG ...文字列:
MDFSFPHFTR ASTDMVYTQP PLKSLLELVI EAKGRLGLVP QRDVVRHHPS SSPFSHFSDS DEEGEGADRN ANKAEVRQDA VLTTRTSWV PPSYLLDYFF SGEFLSVFLT LHGISASRPV SMLVPPLFTV RDAQLHPLVE AGLCSVLQDA LHSSSRQHRS G GGGGWREG VRGGRGGGGD GGGEGSYMES NAAGTSGGGP FMPYWKGPRQ HHLQGGVLGA GEGNDNEAAE QSASGAAHPR CV YAQHRVD DPAFILPPQR FLFRGLQQVA LPALLLGDHV LMGGPRGIGK RTAALLSVGA NVLAFTSNVD SGTAEETDAP PAL VEGEGG AAADGASAAV TGPVPISPAD AEALQQEAVE DTRDAATSRP EPVSPPAPRA LIVLSSYPEV LSAAHWLRSV FGAE AFTPY TFEKEGTALR PLFEVDTAEQ QPAALDGGSK AASSSDAFGH VGAMNTFPET TGTRRFIGPP VSLPFITDTI GAARA PELL LVDPTQTDSA PLHSETTAPA LAELAALVMN VPLPAQAADT AQATAGERAS GGDSKLKRRR HREDEVDSDV EADEEH VET RSSRTHRRHH RHRSERDEVE SEDDEIRRGR HREKRSPHSR SRHRHHSRHG DRRDRREEEG SRGERNASGH RSHRRHH RR SYESDDSDSD RDKGKWPIED EDTHSPRHSR HQRGCRDHRH HSSGGSVSRR HRSRSDERRS RHGSSRHRHH RSRHHRDH H DEDQRSVSSS STATSSPSSP GFQLARPPSL MPTNVEAELP MMPGNHVAPP AADELRALAL DSIVPPAVAN ETSAPSEKP QEAAEEDRRA ELSDVLHQRI PLLITTYHAL GMALGMVQGE ASALPPLEHV RVALLANLER VLMPPLKMSF AHSWWLSLVN ALDVECQFV VTADRMGNEV RGFLDSTIIP DAGERFVHFD QRDASIWAMM NVQVCAVPVD VPVSAAPPNG GSEGRPRISG S DIDAAKVA HVFSTIAEHM LRTGGHATHG KDDVAFQADC GGRGACVAVV CSTRREQSLV VTQLQRLFQD QANDTQAAKG VR VTEKVEL FRAAEAEVLV LTDAQLADPR VLRDLHQCTE VDLILHFSLS RTVMAQLKKE EIIDLLAQRG RAILGGSKQF CAR RWWRGT AMTSAAGGGA AFGVPSNAVD FEPVKVECQL LLTEHNVHGR VGSCVMEALR EVSDS

+
分子 #34: LSM domain-containing protein

分子名称: LSM domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 20.523877 KDa
配列文字列: MVFAGAVYSN ASHVCPHFTL APPIAAFPLL ARPGASHLQR RLGHFALPWP AAHKGAPTLT LERMSESLTT LPGVLARGPA LHALVRVEL TNGTMVVGRL LEMDAATMNI KVDAITHTAV RRRCGRTRKD APAARMAEDT IEVNPIALRC IQSIVVRGTC I RYLDFIHE ...文字列:
MVFAGAVYSN ASHVCPHFTL APPIAAFPLL ARPGASHLQR RLGHFALPWP AAHKGAPTLT LERMSESLTT LPGVLARGPA LHALVRVEL TNGTMVVGRL LEMDAATMNI KVDAITHTAV RRRCGRTRKD APAARMAEDT IEVNPIALRC IQSIVVRGTC I RYLDFIHE TKDSGTSYGE VLVAAEQVRP SG

UniProtKB: LSM domain-containing protein

+
分子 #35: Sm domain-containing protein

分子名称: Sm domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 14.153898 KDa
配列文字列:
MDSPAGCDLG VGPSSSDAKV PGVGTSSSSA PADPFKYLAE HIHKRVSISL LPVDNDDNGV VVCGTLLSVD DLCNVMLQHW SSTDTMRLN RSVGNGLQQQ PRKRARLDIT GGEDAEESVR LIRGAQIVSI SLLPA

UniProtKB: Sm domain-containing protein

+
分子 #36: U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4

分子名称: U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 12.885872 KDa
配列文字列:
MSFARRPITP IEILRNCRGK EVSIELADGE TVNGTVMRTD RAMNVVIKQC TRTGSDGESF WKSRECFVRG ASVKNVRMTD SALVAVPVS SKRKSAGGKN TDARKERYTA GRKRPPK

UniProtKB: U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4

+
分子 #37: LSM domain-containing protein

分子名称: LSM domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 15.939741 KDa
配列文字列:
MSANVNFSTG VQTTKAAPSA QASSPSAKSK SHMILPYEVL FNLVGRRVTV LLTKGSQELE GNLQSVDSDK GDMLLSDVVR YTWAPSRSS DEEGTAVEAA GNGQGTLGGA TEEEGCYTCF GGGQRRELSR CSQAMINSAF VALVTPTLFI PE

UniProtKB: LSM domain-containing protein

+
分子 #38: Sm domain-containing protein

分子名称: Sm domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 8.616604 KDa
配列文字列:
MSVSLESLLH QSVCCHLAHG EEYRGQLEAL DGAFDVVLSK CTRSRAAPGQ PAEPLIFLRG ENIVYIGFDE SSRGEDGATA

UniProtKB: Sm domain-containing protein

+
分子 #39: Lsm7p protein, putative

分子名称: Lsm7p protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 9.968572 KDa
配列文字列:
MSAEAAHVLK KKEGILSLEK YLDRKIVVSQ KAHEVHGVLK GFDNNVNLVL ADAQLWHRNT HIRTIGACVV RGGPVNVILS GDTTVISNP FI

UniProtKB: Lsm7p protein, putative

+
分子 #40: Sm domain-containing protein

分子名称: Sm domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 14.105954 KDa
配列文字列:
(ACE)MLSQYLRKR VSVVTVDGRN LVGVLHAADQ LLNIVLTSCV ERIGAPYDVD DNAAAEEVST VADEVSTAIN RNDTAR STL PPLEEVQLGV MMLRGADVVS IAVIDVYEEA GTNVKDWRGR DMPPVTAVGK SW

UniProtKB: Sm domain-containing protein

+
分子 #42: Small nuclear ribonucleoprotein, putative

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 11.214814 KDa
配列文字列:
MASVSPSETG GTLITFLQQL RGTLVEIELK NASIVSGEIA YVDANMNTYM SHAKITSKGR NPVEVEEYMV RGSTIRYIIM PESLNTYEI LKQASTKKNG ASK

UniProtKB: Small nuclear ribonucleoprotein, putative

+
分子 #43: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 11.798734 KDa
配列文字列:
MDSEQPKKVP RTETKTKELL RTTVADGPFN LLDTAMKEKK RVFIQCRNSK ALLAHVIAFD KHFNLVLKGV QEITESHGSE QKQRSIENV FLRGESVIFI VKLP

UniProtKB: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

+
分子 #44: Lsm5p, putative

分子名称: Lsm5p, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 13.888849 KDa
配列文字列:
MTAAAASSAV VAVEKRNLVM YVGNRVKVTL DDASLLTGRL VSLSSCGNLI LTDVERQRIL KRRRNRDGLH ETSRECYAAV LFVRGSSVV SVGYDRGITT DKSVIDHIGG RESSTSRMVQ LANASPSTR

UniProtKB: Lsm5p, putative

+
分子 #45: Small nuclear ribonucleaoprotein, putative

分子名称: Small nuclear ribonucleaoprotein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 16.127685 KDa
配列文字列:
MADTSNICKD IPSSLVFEAL HSRVTVETVE GDLYIGKLSA FDVTRGNIEL VDVRHQGKDS SYGFYERATV RGSKIRIILL PPEMRAAPS LQWYRESVQQ ELKKSLKHVP SLRPVTRAPR PARIKKAEPK NDKSKQLRRK LR

UniProtKB: Small nuclear ribonucleaoprotein, putative

+
分子 #46: Small nuclear ribonucleoprotein E

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 9.926351 KDa
配列文字列:
MSVHTRQMEN PTGVVHRFMQ DHQRVCVWLV HDPQTRLEGN LLGYDEFMNV VLGDTTETNL RNNKTYRLGK ILLRSDNVGV IHPIGV

UniProtKB: Small nuclear ribonucleoprotein E

+
分子 #47: Sm protein F

分子名称: Sm protein F / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 8.533749 KDa
配列文字列:
MEANVPGAFL HSLVGKKVFV KSKWGPVYEG NLVSCDTFMN LQLRNAVEHA KQDTELGEML LRNNNILYIR EEASAS

UniProtKB: Sm protein F

+
分子 #48: Sm protein G

分子名称: Sm protein G / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 8.810194 KDa
配列文字列:
MPPHKTLPNL NHFMEKRIVV KIQGGRSISG VLRGVDEHMS IVLHEAIDET RNAAANEEPK MALGTTVIRG SAIVEIVSAD V

UniProtKB: Sm protein G

+
分子 #49: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 12.345234 KDa
配列文字列:
MAESIPIKVL FDALHLKVSI EVATGEVYHG TLEDLQNNMN VLLKDAIKIV RGGKETRMES VFVRGSNIVF FQLPDALQTS PALLRAGEV VSKAKDTRGD GKGFGASRKR ARNS

UniProtKB: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

+
分子 #50: Sm protein B

分子名称: Sm protein B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 11.87281 KDa
配列文字列:
MGKYTMLHNI NKVLCVVLDD GRNITGKLLV FDKHMNVVLG DAVEERPQSK KMAEEGVSSK RQLGLILLRG EHVVSVTVMK DGESGGSGA AANFSSAPKS SKATAVKRKR GA

UniProtKB: Sm protein B

+
分子 #33: Unidentified protein

分子名称: Unidentified protein / タイプ: rna / ID: 33 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 1.742244 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #41: Y-branched pre-mRNA

分子名称: Y-branched pre-mRNA / タイプ: rna / ID: 41 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 8.998547 KDa
配列文字列:
A(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)AG

+
分子 #51: SL-ligated pre-mRNA

分子名称: SL-ligated pre-mRNA / タイプ: rna / ID: 51 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 17.067559 KDa
配列文字列:
AACUAACGCU AUAUAAGUAU CAGUUUC(PSU)GU ACUUUAUUG(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)

+
分子 #52: SL RNA outron

分子名称: SL RNA outron / タイプ: rna / ID: 52 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 18.331889 KDa
配列文字列:
GUAUGCGAAA CUUCCGGAAC CUGUCUUCCG GCAAGAUUUU GGAAGCGCGC AGGCGCU

GENBANK: GENBANK: X73121.1

+
分子 #53: U2 snRNA

分子名称: U2 snRNA / タイプ: rna / ID: 53 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 45.393723 KDa
配列文字列:
AUAUCUUCUC GGCUAUUUAG CUAAGAUCAU GUUUAUAAAC UGUUCUUAUC AGAGUAACUC CUGAUACUGC CUUCGGGCAA AGGAAUAGA AAUUAUAACU CAAGGUUGUU UCCCUGGAGU UCCACGUUUC CAGGGGAGCA ACU

GENBANK: GENBANK: AY007788.1

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分子 #54: U5 snRNA

分子名称: U5 snRNA / タイプ: rna / ID: 54 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 22.591439 KDa
配列文字列:
AACCGCUGCU UCGACUUUUA CUAAGCAGCG CUCCCUACCC UACGCACCAA UUUUGAGGCC CAAAAGGGCA U

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分子 #55: U6 snRNA

分子名称: U6 snRNA / タイプ: rna / ID: 55 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Leishmania tarentolae (真核生物)
分子量理論値: 32.113098 KDa
配列文字列:
GAGCCCCUUC GGGGGACAUC CACAAACUGG AAAUUCAACA GAGAAGAUUA GCACUCUCCC UGCGCAAGGC UGAUGUCAAU CUUCGAGAG AUAUAGCUUU U

GENBANK: GENBANK: X82228.1

+
分子 #56: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE

分子名称: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 56 / コピー数: 1 / 式: IHP
分子量理論値: 660.035 Da
Chemical component information

ChemComp-IHP:
INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE

+
分子 #57: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 12 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #58: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 1 / 式: GTP
分子量理論値: 523.18 Da
Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM

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分子 #59: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 4 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #60: 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE

分子名称: 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 1 / 式: GTG
分子量理論値: 803.44 Da
Chemical component information

ChemComp-GTG:
7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE

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分子 #61: 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]ox...

分子名称: 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine
タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 1 / 式: G5J
分子量理論値: 537.207 Da
Chemical component information

ChemComp-G5J:
5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.8
グリッドモデル: Quantifoil R3.5/1 / 材質: GOLD / メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - Film thickness: 2 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 30 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 283 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
特殊光学系エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
撮影したグリッド数: 2 / 実像数: 31410 / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 64000
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 1214398
CTF補正ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6.0) / タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: OTHER
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6.0) / 使用した粒子像数: 141035
初期 角度割当タイプ: OTHER / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6.0)
最終 角度割当タイプ: OTHER / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6.0)
最終 3次元分類ソフトウェア: (名称: cryoSPARC (ver. 4.6.0), RELION (ver. 5.0))

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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