ChemComp-4R2: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidany...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 4R2
• 名称: 名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{S})-5-[5-[(~{E})-4-carbamimidamidobut-2-enoyl]-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-1~{H}-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₃₂H₄₂N₁₂O₁₆P₂ / 原子数: 104 / 化学式量: 912.694 / 形式電荷: 0

その他

7rdf

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 4R2 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7RDF

履歴

作成	2021年7月13日
公開	2021年12月22日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: N=C(N)NC\C=C\C(=O)N1c2cc(C)c(C)cc2N(CC(O)C(O)C(O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2OC(n3cnc4c(N)ncnc43)C(O)C2O)C=2NC(=O)NC(=O)C1=2
• CACTVS 3.385: Cc1cc2N(C[CH](O)[CH](O)[CH](O)CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]3O[CH]([CH](O)[CH]3O)n4cnc5c(N)ncnc45)C6=C(N(C(=O)C=CCNC(N)=N)c2cc1C)C(=O)NC(=O)N6
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: Cc1cc2c(cc1C)N(C3=C(N2CC(C(C(COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC4C(C(C(O4)n5cnc6c5ncnc6N)O)O)O)O)O)NC(=O)NC3=O)C(=O)C=CCNC(=N)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Cc1cc2N(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n4cnc5c(N)ncnc45)C6=C(N(C(=O)\C=C\CNC(N)=N)c2cc1C)C(=O)NC(=O)N6
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [H]/N=C(/N)\NC/C=C/C(=O)N1c2cc(c(cc2N(C3=C1C(=O)NC(=O)N3)C[C@@H]([C@@H]([C@@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]4[C@H]([C@H]([C@@H](O4)n5cnc6c5ncnc6N)O)O)O)O)O)C)C

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C32H42N12O16P2/c1-13-6-15-16(7-14(13)2)44(20(47)4-3-5-36-31(34)35)22-28(40-32(52)41-29(22)51)42(15)8-17(45)23(48)18(46)9-57-61(53,54)60-62(55,56)58-10-19-24(49)25(50)30(59-19)43-12-39-21-26(33)37-11-38-27(21)43/h3-4,6-7,11-12,17-19,23-25,30,45-46,48-50H,5,8-10H2,1-2H3,(H,53,54)(H,55,56)(H2,33,37,38)(H4,34,35,36)(H2,40,41,51,52)/b4-3+/t17-,18+,19+,23-,24+,25+,30+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: UNPAMCKSCHHHHK-IGVXTPOKSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-{5-[(2E)-4-carbamimidamidobut-2-enoyl]-7,8-dimethyl-2,4-dioxo-1,3,4,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl}-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{S})-5-[5-[(~{E})-4-carbamimidamidobut-2-enoyl]-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-1~{H}-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-7rdf:
Crystal structure of Pseudomonas aeruginosa D-Arginine Dehydrogenase Y249F co-crystallized in the presence of D-arginine