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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4bcl | |||||||||
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タイトル | FMO protein from Prosthecochloris aestuarii 2K at Room Temperature | |||||||||
![]() | BACTERIOCHLOROPHYLL A PROTEIN![]() | |||||||||
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機能・相同性 | ![]() | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Tronrud, D.E. / Matthews, B.W. | |||||||||
![]() | ジャーナル: Photosynthetic Reaction Center / 年: 1993 タイトル: Refinement of the Structure of a Water-Soluble Antenna Complex from Green Photosynthetic Bacteria by Incorporation of the Chemically Determined Amino Acid Sequence 著者: Tronrud, D.E. / Matthews, B.W. #1: ![]() タイトル: Structure and X-Ray Amino Acid Sequence of a Bacteriochlorophyll a Protein from Prosthecochloris Aestuarii Refined at 1.9 A Resolution 著者: Tronrud, D.E. / Schmid, M.F. / Matthews, B.W. #2: ![]() タイトル: Structural Studies of a Bacteriochlorophyll-Containing Protein 著者: Schmid, M.F. / Tronrud, D.E. / Matthews, B.W. #3: ![]() タイトル: Lipid-Protein Interactions in a Bacteriochlorophyll-Containing Protein 著者: Matthews, B.W. #4: ![]() タイトル: Structure of a Green Bacteriochlorophyll Protein 著者: Matthews, B.W. / Fenna, R.E. #5: ![]() タイトル: Structure of a Bacteriochlorophyll A-Protein from the Green Photosynthetic Bacterium Prosthecochloris Aestuarii 著者: Matthews, B.W. / Fenna, R.E. / Bolognesi, M.C. / Schmid, M.F. / Olson, J.M. #6: ![]() タイトル: Bacteriochlorophyll A-Protein from Green Bacteria 著者: Olson, J.M. #7: ![]() タイトル: Atomic Coordinates for the Chlorophyll Core of a Bacteriochlorophyll A-Protein from Green Photosynthetic Bacteria 著者: Fenna, R.E. / Ten Eyck, L.F. / Matthews, B.W. #8: ![]() タイトル: An Evaluation of Electron Micrographs of Bacteriochlorophyll A-Protein Crystals in Terms of the Structure Determined by X-Ray Crystallography 著者: Matthews, B.W. / Fenna, R.E. / Remington, S.J. #9: ![]() タイトル: Structure of a Bacteriochlorophyll A-Protein from Prosthecochloris Aestuarii 著者: Fenna, R.E. / Matthews, B.W. #10: ![]() タイトル: Chlorophyll Arrangement in a Bacteriochlorophyll Protein from Chlorobium Limicola 著者: Fenna, R.E. / Matthews, B.W. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 97 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 75.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 40282.168 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 細胞内の位置: LIGHT GATHERING ANTENNA COMPLEX / 参照: UniProt: P11741 | ||
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#2: 化合物 | ChemComp-BCL / ![]() #3: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 70 % |
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結晶化![]() | pH: 7.8 詳細: PROTEIN CRYSTALLIZES FROM SOLUTION OF 14MG/ML OF PROTEIN IN 10MM TRIS.HCL BUFFER, PH 7.8, AND 1M NACL AND 5% (W/V) NH4 SO4 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 290 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: KODAK FILM / 検出器: FILM / 詳細: ADJUSTABLE COLLIMATOR |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.84→22.2 Å / Num. obs: 46456 / % possible obs: 73 % / 冗長度: 2.7 % / Biso Wilson estimate: 16.9 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.116 / Rsym value: 0.046 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: BABINET SCALING / Bsol: 212.3 Å2 / ksol: 0.826 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→20 Å
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拘束条件 |
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