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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||||||||
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タイトル | Caulobacter crescentus FljM flagellar filament (symmetrized) | ||||||||||||||||||
![]() | FljM (symmetrized) map | ||||||||||||||||||
![]() |
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![]() | flagellin / flagellar filament / STRUCTURAL PROTEIN | ||||||||||||||||||
機能・相同性 | Flagellin, C-terminal domain / Bacterial flagellin C-terminal helical region / Flagellin / Flagellin, N-terminal domain / Bacterial flagellin N-terminal helical region / bacterial-type flagellum / structural molecule activity / extracellular region / Flagellin FljM![]() | ||||||||||||||||||
生物種 | ![]() | ||||||||||||||||||
手法 | らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.11 Å | ||||||||||||||||||
![]() | Sanchez JC / Montemayor EJ / Ploscariu NT / Parrell D / Baumgardt JK / Yang JE / Sibert B / Cai K / Wright ER | ||||||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Direct evidence for multi-flagellin filament stabilization via atomic-level architecture of Caulobacter crescentus flagellar filaments 著者: Sanchez JC / Montemayor EJ / Ploscariu NT / Parrell D / Baumgardt JK / Yang JE / Sibert B / Cai K / Wright ER | ||||||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 53 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 17.2 KB 17.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 16.8 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 114.1 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 512 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 5.9 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 476 MB 476 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 980.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 980.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 26.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 34.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8uxnMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | FljM (symmetrized) map | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.834 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: FljM (symmetrized) half map 2
ファイル | emd_42770_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | FljM (symmetrized) half map 2 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: FljM (symmetrized) half map 1
ファイル | emd_42770_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | FljM (symmetrized) half map 1 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : FljM flagellar filament (symmetrized)
全体 | 名称: FljM flagellar filament (symmetrized) |
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要素 |
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-超分子 #1: FljM flagellar filament (symmetrized)
超分子 | 名称: FljM flagellar filament (symmetrized) / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 0.28 kDa/nm |
-分子 #1: Flagellin FljM
分子 | 名称: Flagellin FljM / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 44 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 27.95024 KDa |
配列 | 文字列: MALNSINTNS GALIALQNLN STNAELTQVQ QRINTGKKIG SAKDNGAIWA TAKNQSATAG SMNAVKDSLQ RGQSTIDVAL AAGDTITDL LGKMKEKALA ASDTSLNTAS FNALKSDFDS LRDQITKAAS NAKFNGVSIA DGTTTKLSFL ANSDGSAFTV T AKTLTLGG ...文字列: MALNSINTNS GALIALQNLN STNAELTQVQ QRINTGKKIG SAKDNGAIWA TAKNQSATAG SMNAVKDSLQ RGQSTIDVAL AAGDTITDL LGKMKEKALA ASDTSLNTAS FNALKSDFDS LRDQITKAAS NAKFNGVSIA DGTTTKLSFL ANSDGSAFTV T AKTLTLGG LGLTATSSFT TAAAAKTMIG TIDTALQTAT NKLASLGTSS TGLDTHLTFV GKLQDSLDAG VGNLVDADLA KE SAKLQSL QTKQQLGVQA LSIANQSSSS ILSLFR UniProtKB: Flagellin FljM |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | らせん対称体再構成法 |
試料の集合状態 | filament |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 / 構成要素 - 名称: phosphate buffered saline |
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グリッド | モデル: Quantifoil R2/1 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 95 % / チャンバー内温度: 293 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: GIF Bioquantum / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 45.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm / 倍率(公称値): 105000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |