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データを開く
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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Prefusion-stabilized Langya virus F protein, variant G99C/I109C | |||||||||
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![]() | Langya / Langya virus / LayV / fusion / F / LayV F / VIRAL PROTEIN / disulfide / prefusion / prefusion-stabilized / vaccine design / VIRUS | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.6 Å | |||||||||
![]() | Byrne PO / McLellan JS | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Prefusion-stabilized Langya virus F protein, variant G99C/I109C 著者: Byrne PO / Blade EG / McLellan JS | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 59.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.5 KB 15.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 8.4 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 84.3 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 64 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 5.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 31.8 MB 59.3 MB 59.3 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 933.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 932.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 21.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.94 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: #1
ファイル | emd_41825_additional_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_41825_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_41825_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Prefusion-stabilized Langya virus F protein, variant G99C/I109C
全体 | 名称: Prefusion-stabilized Langya virus F protein, variant G99C/I109C |
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要素 |
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-超分子 #1: Prefusion-stabilized Langya virus F protein, variant G99C/I109C
超分子 | 名称: Prefusion-stabilized Langya virus F protein, variant G99C/I109C タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Fusion glycoprotein F
分子 | 名称: Fusion glycoprotein F / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 詳細: Prefusion-stabilized Langya virus F protein, variant G99C/I109C コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 60.590789 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MAFLKSAIIC YLLFYPHIVK SSLHYDSLSK VGIIKGLTYN YKIKGSPSTK LMVVKLIPNI DGVRNCTQKQ FDEYKNLVKN VLEPVKLAL NAMLDNVKSC NNKYRFAGAC MAGVALGVAT AATVTAGIAL HRSNENAQAI ANMKNAIQNT NEAVKQLQLA N KQTLAVID ...文字列: MAFLKSAIIC YLLFYPHIVK SSLHYDSLSK VGIIKGLTYN YKIKGSPSTK LMVVKLIPNI DGVRNCTQKQ FDEYKNLVKN VLEPVKLAL NAMLDNVKSC NNKYRFAGAC MAGVALGVAT AATVTAGIAL HRSNENAQAI ANMKNAIQNT NEAVKQLQLA N KQTLAVID TIRGEINNNI IPVINQLSCD TIGLSVGIKL TQYYSEILTA FGPALQNPVN TRITIQAISS VFNRNFDELL KI MGYTSGD LYEILHSGLI RGNIIDVDVE AGYIALEIEF PNLTLVPNAV VQELMPISYN VDGDEWVTLV PRFVLTRTTL LSN IDTSRC TVTESSVICD NDYALPMSYE LIGCLQGDTS KCAREKVVSS YVPRFALSDG LVYANCLNTI CRCMDTDTPI SQSL GTTVS LLDNKKCLVY QVGDILISVG SYLGEGEYSA DNVELGPPVV IDKIDIGNQL AGINQTLQNA EDYIEKSEEG GSGYI PEAP RDGQAYVRKD GEWVLLSTFL GRSLEVLFQG PGHHHHHHHH SAWSHPQFEK GGGSGGGGSG GSAWSHPQFE K |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS GLACIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 44.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.5 µm |