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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
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タイトル | Human cytomegalovirus portal vertex, non-infectious enveloped particle (NIEP) configuration 1 (NC1) | ||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | Post-processed map used for real space refinement. | ||||||||||||||||||||||||||||||
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![]() | tegument / portal / DNA packaging / intracellular transport / VIRUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() host cell viral assembly compartment / T=16 icosahedral viral capsid / viral tegument / viral DNA genome packaging / viral capsid assembly / host cell cytoplasmic vesicle / chromosome organization / viral process / viral penetration into host nucleus / viral capsid ...host cell viral assembly compartment / T=16 icosahedral viral capsid / viral tegument / viral DNA genome packaging / viral capsid assembly / host cell cytoplasmic vesicle / chromosome organization / viral process / viral penetration into host nucleus / viral capsid / host cell / symbiont-mediated perturbation of host ubiquitin-like protein modification / ubiquitinyl hydrolase 1 / host cell cytoplasm / cysteine-type deubiquitinase activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / host cell perinuclear region of cytoplasm / symbiont entry into host cell / host cell nucleus / structural molecule activity / proteolysis / DNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||||||||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.26 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | Jih J / Liu YT / Liu W / Zhou H | ||||||||||||||||||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: The incredible bulk: Human cytomegalovirus tegument architectures uncovered by AI-empowered cryo-EM. 著者: Jonathan Jih / Yun-Tao Liu / Wei Liu / Z Hong Zhou / ![]() 要旨: The compartmentalization of eukaryotic cells presents considerable challenges to the herpesvirus life cycle. The herpesvirus tegument, a bulky proteinaceous aggregate sandwiched between ...The compartmentalization of eukaryotic cells presents considerable challenges to the herpesvirus life cycle. The herpesvirus tegument, a bulky proteinaceous aggregate sandwiched between herpesviruses' capsid and envelope, is uniquely evolved to address these challenges, yet tegument structure and organization remain poorly characterized. We use deep-learning-enhanced cryogenic electron microscopy to investigate the tegument of human cytomegalovirus virions and noninfectious enveloped particles (NIEPs; a genome packaging-aborted state), revealing a portal-biased tegumentation scheme. We resolve atomic structures of portal vertex-associated tegument (PVAT) and identify multiple configurations of PVAT arising from layered reorganization of pUL77, pUL48 (large tegument protein), and pUL47 (inner tegument protein) assemblies. Analyses show that pUL77 seals the last-packaged viral genome end through electrostatic interactions, pUL77 and pUL48 harbor a head-linker-capsid-binding motif conducive to PVAT reconfiguration, and pUL47/48 dimers form 45-nm-long filaments extending from the portal vertex. These results provide a structural framework for understanding how herpesvirus tegument facilitates and evolves during processes spanning viral genome packaging to delivery. | ||||||||||||||||||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 166.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 31.1 KB 31.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 12.8 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 189.4 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 10.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 140.4 MB 140.4 MB 140.6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Post-processed map used for real space refinement. | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.36 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: Primary map.
ファイル | emd_41201_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Primary map. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map 1.
ファイル | emd_41201_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map 1. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map 2.
ファイル | emd_41201_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map 2. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Human herpesvirus 5 strain AD169
全体 | 名称: ![]() ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Human herpesvirus 5 strain AD169
超分子 | 名称: Human herpesvirus 5 strain AD169 / タイプ: virus / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all / NCBI-ID: 10360 / 生物種: Human herpesvirus 5 strain AD169 / ウイルスタイプ: VIRION / ウイルス・単離状態: STRAIN / ウイルス・エンベロープ: Yes / ウイルス・中空状態: No |
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宿主 | 生物種: ![]() |
ウイルス殻 | Shell ID: 1 / 名称: Virion capsid / T番号(三角分割数): 16 |
-分子 #1: Large tegument protein deneddylase
分子 | 名称: Large tegument protein deneddylase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ubiquitinyl hydrolase 1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 253.541141 KDa |
配列 | 文字列: MKVTQASCHQ GDIARFGARA GNQCVCNGIM FLHALHLGGT SAVLQTEALD AIMEEGARLD ARLERELQKK LPAGGRLPVY RLGDEVPRR LESRFGRTVH ALSRPFNGTT ETCDLDGYMC PGIFDFLRYA HAKPRPTYVL VTVNSLARAV VFTEDHMLVF D PHSSAECH ...文字列: MKVTQASCHQ GDIARFGARA GNQCVCNGIM FLHALHLGGT SAVLQTEALD AIMEEGARLD ARLERELQKK LPAGGRLPVY RLGDEVPRR LESRFGRTVH ALSRPFNGTT ETCDLDGYMC PGIFDFLRYA HAKPRPTYVL VTVNSLARAV VFTEDHMLVF D PHSSAECH NAAVYHCEGL HQVLMVLTGF GVQLSPAFYY EALFLYMLDV ATVPEAEIAA RLVSTYRDRD IDLTGVVRES AD TAATTTT AAPSLPPLPD PIVDPGCPPG VAPSIPVYDP SSSPKKTPEK RRKDLSGSKH GGKKKPPSTT SKTLATASSS PSA IAAASS SSAVPPSYSC GEGALPALGR YQQLVDEVEQ ELKALTLPPL PANTSAWTLH AAGTESGANA ATATAPSFDE AFLT DRLQQ LIIHAVNQRS CLRRPCGPQS AAQQAVRAYL GLSKKLDAFL LNWLHHGLDL QRMHDYLSHK TTKGTYSTLD RALLE KMQV VFDPYGRQHG PALIAWVEEM LRYVESKPTN ELSQRLQRFV TKRPMPVSDS FVCLRPVDFQ RLTQVIEQRR RVLQRQ REE YHGVYEHLAG LITSIDIHDL DASDLNRREI LKALQPLDDN AKQELFRLGN AKMLELQMDL DRLSTQLLTR VHNHILN GF LPVEDLKQME RVVEQVLRLF YDLRDLKLCD GSYEEGFVVI REQLSYLMTG TVRDNVPLLQ EILQLRHAYQ QATQQNEG R LTQIHDLLHV IETLVRDPGS RGSALTLALV QEQLAQLEAL GGLQLPEVQQ RLQNAQLALS RLYEEEEETQ RFLDGLSYD DPPNEQTIKR HPQLREMLRR DEQTRLRLIN AVLSMFHTLV MRLARDESPR PTFFDAVSLL LQQLPPDSHE REDLRAANAT YAQMVKKLE QIEKAGTGAS EKRFQALREL VYFFRNHEYF FQHMVGRLGV GPQVTELYER YQHEMEEQHL ERLEREWQEE A GKLTVTSV EDVQRVLARA PSHRVMHQMQ QTLTTKMQDF LDKEKRKQEE QQRQLLDGYQ KKVQQDLQRV VDAVKGEMLS TI PHQPLEA TLELLLGLDQ RAQPLLDKFN QDLLSALQQL SKKLDGRINE CLHGVLTGDV ERRCHPHREA AMQTQASLNH LDQ ILGPQL LIHETQQALQ HAVHQAQFIE KCQQGDPTTA ITGSEFEGDF ARYRSSQQKM EEQLQETRQQ MTETSERLDR SLRQ DPGSS SVTRVPEKPF KGQELAGRIT PPPADFQQPV FKTLLDQQAD AARKALSDEA DLLNQKVQTQ LRQRDEQLST AQNLW TDLV TRHKMSGGLD VTTPDAKALM EKPLETLREL LGKATQQLPY LSAERTVRWM LAFLEEALAQ ITADPTHPHH GSRTHY RNL QQQAVESAVT LAHQIEQNAA CENFIAQHQE ATANGASTPR VDMVQAVEAV WQRLEPGRVA GGAARHQKVQ ELLQRLG QT LGDLELQETL ATEYFALLHG IQTFSYGLDF RSQLEKIRDL RTRFAELAKR RGTRLSNEGV LPNPRKPQAT TSLGAFTR G LNALERHVQL GHQYLLNKLN GSSLVYRLED IPSVLPATHE TDPALIMRDR LRRLCFARHH DTFLEVVDVF GMRQIVTQA GEPIHLVTDY GNVAFKYLAL RDDGRPLAWR RRCSGGGLKN VVTTRYKAIT VAVAVCQTLR TFWPQISQYD LRPYLTQHQS HTHPAETHT LHNLKLFCYL VSTAWHQRID TQQELTAADR VGSGEGGDVG EQRPGRGTVL RLSLQEFCVL IAALYPEYIY T VLKYPVQM SLPSLTAHLH QDVIHAVVNN THKMPPDHLP EQVKAFCITP TQWPAMQLNK LFWENKLVQQ LCQVGPQKST PP LGKLWLY AMATLVFPQD MLQCLWLELK PQYAETYASV SELVQTLFQI FTQQCEMVTE GYTQPQLPTG EPVLQMIRVP RQD TTTTDT NTTTEPGLLD VFIQTETALD YALGSWLFGI PVCLGVHVAD LLKGQRILVA RHLEYTSRDR DFLRIQRSRD LNLS QLLQD TWTETPLEHC WLQAQIRRLR DYLRFPTRLE FIPLVIYNAQ DHTVVRVLRP PSTFEQDHSR LVLDEAFPTF PLYDQ DDNS SADNIAASGA APTPPVPFNR VPVNIQFLRE NPPPIARVQQ PPRRHRHRAA AAADDDGQID HVQDDTSRTA DSALVS TAF GGSVFQENRL GETPLCRDEL VAVAPGAAST SFASPPITVL TQNVLSALEI LRLVRLDLRQ LAQSVQDTIQ HMRFLYL L UniProtKB: Large tegument protein deneddylase |
-分子 #2: Capsid vertex component 2
分子 | 名称: Capsid vertex component 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 71.26957 KDa |
配列 | 文字列: MSLLHTFWRL PVAVFFEPHE ENVLRCPERV LRRLLEDAAV TMRGGGWRED VLMDRVRKRY LRQELRDLGH RVQTYCEDLE GRVSEAEAL LNQQCELDEG PSPRTLLQPP CRPRSSSPGT GVAGASAVPH GLYSRHDAIT GPAAAPSDVV APSDAVAASA A AGASSTWL ...文字列: MSLLHTFWRL PVAVFFEPHE ENVLRCPERV LRRLLEDAAV TMRGGGWRED VLMDRVRKRY LRQELRDLGH RVQTYCEDLE GRVSEAEAL LNQQCELDEG PSPRTLLQPP CRPRSSSPGT GVAGASAVPH GLYSRHDAIT GPAAAPSDVV APSDAVAASA A AGASSTWL AQCAERPLPG NVPSYFGITQ NDPFIRFHTD FRGEVVNTMF ENASTWTFSF GIWYYRLKRG LYTQPRWKRV YH LAQMDNF SISQELLLGV VNALENVTVY PTYDCVLSDL EAAACLLAAY GHALWEGRDP PDSVATVLGE LPQLLPRLAD DVS REIAAW EGPVAAGNNY YAYRDSPDLR YYMPLSGGRH YHPGTFDRHV LVRLFHKRGV IQHLPGYGTI TEELVQERLS GQVR DDVLS LWSRRLLVGK LGRDVPVFVH EQQYLRSGLT CLAGLLLLWK VTNADSVFAP RTGKFTLADL LGSDAVAGGG LPGGR AGGE EEGYGGRHGR VRNFEFLVRY YIGPWYARDP AVTLSQLFPG LALLAVTESV RSGWDPSRRE DSAGGGDGGG AVLMQL SKS NPVADYMFAQ SSKQYGDLRR LEVHDALLFH YEHGLGRLLS VTLPRHRVST LGSSLFNVND IYELLYFLVL GFLPSVA VL UniProtKB: Capsid vertex component 2 |
-分子 #3: Capsid vertex component 1
分子 | 名称: Capsid vertex component 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 68.567211 KDa |
配列 | 文字列: METHLYSDLA FEARFADDEQ LPLHLVLDQE VLSNEEAETL RYVYYRNVDS AGRSTGRAPG GDEDDAPASD DAEDAVGGDR AFDRERRTW QRACFRVLPR PLELLDYLRQ SGLTVTLEKE QRVRMFYAVF TTLGLRCPDN RLSGAQTLHL RLVWPDGSYR D WEFLARDL ...文字列: METHLYSDLA FEARFADDEQ LPLHLVLDQE VLSNEEAETL RYVYYRNVDS AGRSTGRAPG GDEDDAPASD DAEDAVGGDR AFDRERRTW QRACFRVLPR PLELLDYLRQ SGLTVTLEKE QRVRMFYAVF TTLGLRCPDN RLSGAQTLHL RLVWPDGSYR D WEFLARDL LREEMEANKR DRQHQLATTT NHRRRGGLRN NLDNGSDRRL PEAAVASLET AVSTPFFEIP NGAGTSSANG DG RFSNLEQ RVARLLRGDE EFIYHAGPLE PPSKIRGHEL VQLRLDVNPD LMYATDPHDR DEVARTDEWK GAGVSRLREV WDV QHRVRL RVLWYVNSFW RSRELSYDDH EVELYRALDA YRARIAVEYV LIRAVRDEIY AVLRRDGGAL PQRFACHVSR NMSW RVVWE LCRHALALWM DWADVRSCII KALTPRLSRG AAAAAQRARR QRERSAPKPQ ELLFGPRNES GPPAEQTWYA DVVRC VRAQ VDLGVEVRAA RCPRTGLWIV RDRRGRLRRW LSQPEVCVLY VTPDLDFYWV LPGGFAVSSR VTLHGLAQRA LRDRFQ NFE AVLARGMHVE AGRQEPETPR VSGRRLPFDD L UniProtKB: Capsid vertex component 1 |
-分子 #4: Major capsid protein
分子 | 名称: Major capsid protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 154.048906 KDa |
配列 | 文字列: MENWSALELL PKVGIPTDFL THVKTSAGEE MFEALRIYYG DDPERYNIHF EAIFGTFCNR LEWVYFLTSG LAAAAHAIKF HDLNKLTTG KMLFHVQVPR VASGAGLPTS RQTTIMVTKY SEKSPITIPF ELSAACLTYL RETFEGTILD KILNVEAMHT V LRALKNTA ...文字列: MENWSALELL PKVGIPTDFL THVKTSAGEE MFEALRIYYG DDPERYNIHF EAIFGTFCNR LEWVYFLTSG LAAAAHAIKF HDLNKLTTG KMLFHVQVPR VASGAGLPTS RQTTIMVTKY SEKSPITIPF ELSAACLTYL RETFEGTILD KILNVEAMHT V LRALKNTA DAMERGLIHS FLQTLLRKAP PYFVVQTLVE NATLARQALN RIQRSNILQS FKAKMLATLF LLNRTRDRDY VL KFLTRLA EAATDSILDN PTTYTTSSGA KISGVMVSTA NVMQIIMSLL SSHITKETVS APATYGNFVL SPENAVTAIS YHS ILADFN SYKAHLTSGQ PHLPNDSLSQ AGAHSLTPLS MDVIRLGEKT VIMENLRRVY KNTDTKDPLE RNVDLTFFFP VGLY LPEDR GYTTVESKVK LNDTVRNALP TTAYLLNRDR AVQKIDFVDA LKTLCHPVLH EPAPCLQTFT ERGPPSEPAM QRLLE CRFQ QEPMGGAARR IPHFYRVRRE VPRTVNEMKQ DFVVTDFYKV GNITLYTELH PFFDFTHCQE NSETVALCTP RIVIGN LPD GLAPGPFHEL RTWEIMEHMR LRPPPDYEET LRLFKTTVTS PNYPELCYLV DVLVHGNVDA FLLIRTFVAR CIVNMFH TR QLLVFAHSYA LVTLIAEHLA DGALPPQLLF HYRNLVAVLR LVTRISALPG LNNGQLAEEP LSAYVNALHD HRLWPPFV T HLPRNMEGVQ VVADRQPLNP ANIEARHHGV SDVPRLGAMD ADEPLFVDDY RATDDEWTLQ KVFYLCLMPA MTNNRACGL GLNLKTLLVD LFYRPAFLLM PAATAVSTSG TTSKESTSGV TPEDSIAAQR QAVGEMLTEL VEDVATDAHT PLLQACRELF LAVQFVGEH VKVLEVRAPL DHAQRQGLPD FISRQHVLYN GCCVVTAPKT LIEYSLPVPF HRFYSNPTIC AALSDDIKRY V TEFPHYHR HDGGFPLPTA FAHEYHNWLR SPFSRYSATC PNVLHSVMTL AAMLYKISPV SLVLQTKAHI HPGFALTAVR TD TFEVDML LYSGKSCTSV IINNPIVTKE ERDISTTYHV TQNINTVDMG LGYTSNTCVA YVNRVRTDMG VRVQDLFRVF PMN VYRHDE VDRWIRHAAG VERPQLLDTE TISMLTFGSM SERNAAATVH GQKAACELIL TPVTMDVNYF KIPNNPRGRA SCML AVDPY DTEAATKAIY DHREADAQTF AATHNPWASQ AGCLSDVLYN TRHRERLGYN SKFYSPCAQY FNTEEIIAAN KTLFK TIDE YLLRAKDCIR GDTDTQYVCV EGTEQLIENP CRLTQEALPI LSTTTLALME TKLKGGAGAF ATSETHFGNY VVGEII PLQ QSMLFNS UniProtKB: Major capsid protein |
-分子 #5: Small capsomere-interacting protein
分子 | 名称: Small capsomere-interacting protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 8.495924 KDa |
配列 | 文字列: MSNTAPGPTV ANKRDEKHRH VVNVVLELPT EISEATHPVL ATMLSKYTRM SSLFNDKCAF KLDLLRMVAV SRTRR UniProtKB: Small capsomere-interacting protein |
-分子 #6: Triplex capsid protein 1
分子 | 名称: Triplex capsid protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 33.07127 KDa |
配列 | 文字列: MDARAVAKRP RDPADEDNEL VTALKAKREV NTISVRYLYH ADHQALTARF FVPEGLVEFE AQPGALLIRM ETGCDSPRHL YISLYLLGI RASNVSASTR CLLESVYTAS AARAALQWLD LGPHLLHRRL ETLGCVKTVS LGITSLLTCV MRGYLYNTLK T EVFALMIP ...文字列: MDARAVAKRP RDPADEDNEL VTALKAKREV NTISVRYLYH ADHQALTARF FVPEGLVEFE AQPGALLIRM ETGCDSPRHL YISLYLLGI RASNVSASTR CLLESVYTAS AARAALQWLD LGPHLLHRRL ETLGCVKTVS LGITSLLTCV MRGYLYNTLK T EVFALMIP KDMYLTWEET RGRLQYVYLI IVYDYDGPET RPGIYVLTSS IAHWQTLVDV ARGKFARERC SFVNRRITRP RQ IPLCTGV IQKLGWCLAD DIHTSFLVHK ELKLSVVRLD NFSVELGDFR EFV UniProtKB: Triplex capsid protein 1 |
-分子 #7: Triplex capsid protein 2
分子 | 名称: Triplex capsid protein 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 34.63575 KDa |
配列 | 文字列: MAAMEANIFC TFDHKLSIAD VGKLTKLVAA VVPIPQRLHL IKHYQLGLHQ FVDHTRGYVR LRGLLRNMTL TLMRRVEGNQ ILLHVPTHG LLYTVLNTGP VTWEKGDALC VLPPLFHGPL ARENLLTLGQ WELVLPWIVP MPLALEINQR LLIMGLFSLD R SYEEVKAA ...文字列: MAAMEANIFC TFDHKLSIAD VGKLTKLVAA VVPIPQRLHL IKHYQLGLHQ FVDHTRGYVR LRGLLRNMTL TLMRRVEGNQ ILLHVPTHG LLYTVLNTGP VTWEKGDALC VLPPLFHGPL ARENLLTLGQ WELVLPWIVP MPLALEINQR LLIMGLFSLD R SYEEVKAA VQQLQTITFR DATFTIPDPV IDQHLLIDMK TACLSMSMVA NLASELTMTY VRKLALEDSS MLLVKCQELL MR LDRERSV GEPRTPARPQ HVSPDDEIAR LSALFVMLRQ LDDLIREQVV FTVCDVSPDN KSATCIFKG UniProtKB: Triplex capsid protein 2 |
-分子 #8: Large structural phosphoprotein
分子 | 名称: Large structural phosphoprotein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 112.829102 KDa |
配列 | 文字列: MSLQFIGLQR RDVVALVNFL RHLTQKPDVD LEAHPKILKK CGEKRLHRRT VLFNELMLWL GYYRELRFHN PDLSSVLEEF EVRCVAVAR RGYTYPFGDR GKARDHLAVL DRTEFDTDVR HDAEIVERAL VSAVILAKMS VRETLVTAIG QTEPIAFVHL K DTEVQRIE ...文字列: MSLQFIGLQR RDVVALVNFL RHLTQKPDVD LEAHPKILKK CGEKRLHRRT VLFNELMLWL GYYRELRFHN PDLSSVLEEF EVRCVAVAR RGYTYPFGDR GKARDHLAVL DRTEFDTDVR HDAEIVERAL VSAVILAKMS VRETLVTAIG QTEPIAFVHL K DTEVQRIE ENLEGVRRNM FCVKPLDLNL DRHANTALVN AVNKLVYTGR LIMNVRRSWE ELERKCLARI QERCKLLVKE LR MCLSFDS NYCRNILKHA VENGDSADTL LELLIEDFDI YVDSFPQSAH TFLGARSPSL EFDDDANLLS LGGGSAFSSV PKK HVPTQP LDGWSWIASP WKGHKPFRFE AHGSLAPAAE AHAARSAAVG YYDEEEKRRE RQKRVDDEVV QREKQQLKAW EERQ QNLQQ RQQQPPPPAR KPSASRRLFG SSADEDDDDD DDEKNIFTPI KKPGTSGKGA ASGGGVSSIF SGLLSSGSQK PTSGP LNIP QQQQRHAAFS LVSPQVTKAS PGRVRRDSAW DVRPLTETRG DLFSGDEDSD SSDGYPPNRQ DPRFTDTLVD ITDTET SAK PPVTTAYKFE QPTLTFGAGV NVPAGAGAAI LTPTPVNPST APAPAPTPTF AGTQTPVNGN SPWAPTAPLP GDMNPAN WP RERAWALKNP HLAYNPFRMP TTSTASQNTV STTPRRPSTP RAAVTQTASR DAADEVWALR DQTAESPVED SEEEDDDS S DTGSVVSLGH TTPSSDYNND VISPPSQTPE QSTPSRIRKA KLSSPMTTTS TSQKPVLGKR VATPHASARA QTVTSTPVQ GRLEKQVSGT PSTVPATLLQ PQPASSKTTS SRNVTSGAGT SSASSARQPS ASASVLSPTE DDVVSPATSP LSMLSSASPS PAKSAPPSP VKGRGSRVGV PSLKPTLGGK AVVGRPPSVP VSGSAPGRLS GSSRAASTTP TYPAVTTVYP PSSTAKSSVS N APPVASPS ILKPGASAAL QSRRSTGTAA VGSPVKSTTG MKTVAFDLSS PQKSGTGPQP GSAGMGGAKT PSDAVQNILQ KI EKIKNTE E UniProtKB: Large structural phosphoprotein |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均露光時間: 8.0 sec. / 平均電子線量: 47.2 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 3.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |