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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of DIP-2I8I polymorph 2 | |||||||||
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![]() | Iodinated peptide / PROTEIN FIBRIL | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.75 Å | |||||||||
![]() | Li DN / Ma YY / Li D / Dai B / Liu C | |||||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of DIP-2I8I fibril polymorph 2 著者: Li DN / Ma YY / Li D / Dai B / Liu C | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 26.7 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12 KB 12 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 14.8 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 114.7 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4.2 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 218.4 MB 218.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 897.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 897.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 22.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 29.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.83 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_35878_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_35878_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Cryo-EM structue of DIP-2I8I fibril polymorph 2
全体 | 名称: Cryo-EM structue of DIP-2I8I fibril polymorph 2 |
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要素 |
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-超分子 #1: Cryo-EM structue of DIP-2I8I fibril polymorph 2
超分子 | 名称: Cryo-EM structue of DIP-2I8I fibril polymorph 2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: GLY-PHI-GLY-ASN-GLY-ASN-GLY-PHI-GLY
分子 | 名称: GLY-PHI-GLY-ASN-GLY-ASN-GLY-PHI-GLY / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 22 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 1.077621 KDa |
配列 | 文字列: G(PHI)GNGNG(PHI)G |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | らせん対称体再構成法 |
試料の集合状態 | filament |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |