+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | AhCS-3Mg2+-FSPP | |||||||||
![]() | ||||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | (-)-cyperene synthase / directed evolution / Alphafold2 / PLANT PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.1 Å | |||||||||
![]() | Yu SS / Zhu P / Liu YB / Ma SG / Ye D / Shao YZ / Li WR / Cui ZJ | |||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Characterisation and engineering of two highly paralogous sesquiterpene synthases reveal a regioselective reprotonation switch. 著者: Ye D / Shao YZ / Li WR / Cui ZJ / Gong T / Yang JL / Wang HQ / Dai JG / Feng KP / Ma M / Ma SG / Liu YB / Zhu P / Yu SS | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 49.6 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 9.5 KB 9.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 84.3 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4.8 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 489.4 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 488.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7xkwM M: このマップから作成された原子モデル |
---|
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.81 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-
試料の構成要素
-全体 : AhCS-3Mg2+-FSPP
全体 | 名称: AhCS-3Mg2+-FSPP |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: AhCS-3Mg2+-FSPP
超分子 | 名称: AhCS-3Mg2+-FSPP / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: (-)-cyperene synthase
分子 | 名称: (-)-cyperene synthase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MMGRSSANFH PNVWGDRFVM MPSKEMETDA STKQRAEMLK QEVKKMLHDV SGSLQELNLI NEIQRLGVAY HFEAEISNAL ERIYNREKNE NGINDCDLHA VALRFRLLRQ HGYNVSSDVF KKFKDENGEF EARFRNDVRG LLSLYEAAYF ...文字列: MGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MMGRSSANFH PNVWGDRFVM MPSKEMETDA STKQRAEMLK QEVKKMLHDV SGSLQELNLI NEIQRLGVAY HFEAEISNAL ERIYNREKNE NGINDCDLHA VALRFRLLRQ HGYNVSSDVF KKFKDENGEF EARFRNDVRG LLSLYEAAYF GTQEDGHLDE AIAFTTKHLK SLLPHLSSPL SDLVKLALDL PLLKRIERLQ SKHFISIYQQ DEDRNNVLLE FAKIDFNILQ ALHRKELNEI TRWWNESDLP RKLPFIRDRL VECYIWMLEL YYEPQYSQSR RMTTILLILT SSMDDIYDVY GKLEELERYT VAVERWEREA LDQLPDYMRV HLGVLLTVVE NFEDELGKEG KSFHLAYVKK AFAELTKAYI KEARWANAEH VPALEEYVDN AVVSSAYPLI TTMSLLGMGK VATKEAFEWT ISLPNAVRQC SMICRLVNDI MSNQSEQERV HVASAVQCCM KEFSTTYEEA CKILQEKIAR AWKDLNKECL HPIPVSLELI RRPLNLARAI EFYYQCRDGY SDSAFEIKDY ITMLLVEPAV V |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
濃度 | 3 mg/mL |
---|---|
緩衝液 | pH: 7.5 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
---|---|
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 283635 |
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |