+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Tom20 subunits | |||||||||
![]() | ||||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | Tom20 / Cryo-EM / TRANSLOCASE | |||||||||
機能・相同性 | ![]() tRNA import into mitochondrion / TOM complex / mitochondrion targeting sequence binding / mitochondrial outer membrane translocase complex / migrasome / mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane contact site / protein import into mitochondrial matrix / protein-transporting ATPase activity / Mitochondrial protein import / protein targeting to mitochondrion ...tRNA import into mitochondrion / TOM complex / mitochondrion targeting sequence binding / mitochondrial outer membrane translocase complex / migrasome / mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane contact site / protein import into mitochondrial matrix / protein-transporting ATPase activity / Mitochondrial protein import / protein targeting to mitochondrion / protein insertion into mitochondrial outer membrane / sperm midpiece / PINK1-PRKN Mediated Mitophagy / cell periphery / unfolded protein binding / mitochondrial outer membrane / Ub-specific processing proteases / mitochondrion 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 13.0 Å | |||||||||
![]() | Liu DS / Sui SF | |||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Tom20 subunits 著者: Liu DS / Sui SF | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 59 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 8 KB 8 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 36 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4.5 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 401.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 401.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7vc9MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.0825 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-
試料の構成要素
-全体 : The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit
全体 | 名称: The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit
超分子 | 名称: The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog
分子 | 名称: Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 16.319862 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MVGRNSAIAA GVCGALFIGY CIYFDRKRRS DPNFKNRLRE RRKKQKLAKE RAGLSKLPDL KDAEAVQKFF LEEIQLGEEL LAQGEYEKG VDHLTNAIAV CGQPQQLLQV LQQTLPPPVF QMLLTKLPTI SQRIVSAQSL AEDDVE UniProtKB: Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
---|---|
糖包埋 | 材質: Digitonin |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: INSILICO MODEL |
---|---|
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 13.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 347600 |
初期 角度割当 | タイプ: COMMON LINE |
最終 角度割当 | タイプ: COMMON LINE |