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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-31889 | |||||||||
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タイトル | Tom20 subunits | |||||||||
マップデータ | ||||||||||
試料 |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 tRNA import into mitochondrion / mitochondrion targeting sequence binding / mitochondrial outer membrane translocase complex / mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane contact site / migrasome / protein import into mitochondrial matrix / protein-transporting ATPase activity / Mitochondrial protein import / protein targeting to mitochondrion / protein insertion into mitochondrial outer membrane ...tRNA import into mitochondrion / mitochondrion targeting sequence binding / mitochondrial outer membrane translocase complex / mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane contact site / migrasome / protein import into mitochondrial matrix / protein-transporting ATPase activity / Mitochondrial protein import / protein targeting to mitochondrion / protein insertion into mitochondrial outer membrane / sperm midpiece / PINK1-PRKN Mediated Mitophagy / cell periphery / unfolded protein binding / mitochondrial outer membrane / Ub-specific processing proteases / ミトコンドリア 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 13.0 Å | |||||||||
データ登録者 | Liu DS / Sui SF | |||||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Tom20 subunits 著者: Liu DS / Sui SF | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_31889.map.gz | 59 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-31889-v30.xml emd-31889.xml | 8.2 KB 8.2 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
画像 | emd_31889.png | 36 KB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-31889 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-31889 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 7vc9MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_31889.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 64 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.0825 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-試料の構成要素
-全体 : The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit
全体 | 名称: The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit |
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要素 |
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-超分子 #1: The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit
超分子 | 名称: The translocase of the outer mitochondrial membrane of Tom20 subunit タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
組換発現 | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
-分子 #1: Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog
分子 | 名称: Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 16.319862 KDa |
組換発現 | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
配列 | 文字列: MVGRNSAIAA GVCGALFIGY CIYFDRKRRS DPNFKNRLRE RRKKQKLAKE RAGLSKLPDL KDAEAVQKFF LEEIQLGEEL LAQGEYEKG VDHLTNAIAV CGQPQQLLQV LQQTLPPPVF QMLLTKLPTI SQRIVSAQSL AEDDVE |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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糖包埋 | 材質: Digitonin |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-画像解析
初期 角度割当 | タイプ: COMMON LINE |
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最終 角度割当 | タイプ: COMMON LINE |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 13.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 347600 |