ChemComp-2OM: 5,6-dihydroorotidine 5'-monophosphate

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 2OM
• 名称: 名称: 5,6-dihydroorotidine 5'-monophosphate

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₅N₂O₁₁P / 原子数: 39 / 化学式量: 370.207 / 形式電荷: 0

その他

3g1f

U

タイプ: RNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: U / 3文字コード: 2OM / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3G1F / 親要素: U

履歴

作成	2009年2月6日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O)C1N(C(=O)NC(=O)C1)C2OC(C(O)C2O)COP(=O)(O)O
• CACTVS 3.341: O[CH]1[CH](O)[CH](O[CH]1CO[P](O)(O)=O)N2[CH](CC(=O)NC2=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1C(N(C(=O)NC1=O)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)O)O)O)C(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@@H]1CO[P](O)(O)=O)N2[C@H](CC(=O)NC2=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1[C@@H](N(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)O)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H15N2O11P/c13-5-1-3(9(16)17)12(10(18)11-5)8-7(15)6(14)4(23-8)2-22-24(19,20)21/h3-4,6-8,14-15H,1-2H2,(H,16,17)(H,11,13,18)(H2,19,20,21)/t3-,4-,6-,7-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ZVESSEXVBFSYOC-NFTAXOAUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 6-carboxyuridine 5'-(dihydrogen phosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (4R)-3-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]-2,6-dioxo-1,3-diazinane-4-carboxylic acid

PDBエントリ

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PDB-3g1f:
Crystal structure of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with 5,6-dihydroorotidine 5'-monophosphate