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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-29537 | |||||||||
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タイトル | Hair Cell Stereocilia (NAD filtered, Rotated, Trimmed) | |||||||||
マップデータ | NAD denoised, rotated, Cryo-ET map of mouse utricle Pls1-/- hair cell stereocilia | |||||||||
試料 |
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生物種 | Mus (ネズミ) | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
データ登録者 | Auer M / Song J | |||||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Hair Cell Stereocilia (NAD filtered, Rotated, Trimmed) 著者: Auer M / Song J | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_29537.map.gz | 290.7 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-29537-v30.xml emd-29537.xml | 6.7 KB 6.7 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
画像 | emd_29537.png | 74.1 KB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-29537 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-29537 | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | emd_29537_validation.pdf.gz | 384.9 KB | 表示 | EMDB検証レポート |
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文書・詳細版 | emd_29537_full_validation.pdf.gz | 384.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | emd_29537_validation.xml.gz | 4.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | emd_29537_validation.cif.gz | 4.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-29537 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-29537 | HTTPS FTP |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_29537.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 382.8 MB / タイプ: IMAGE STORED AS SIGNED INTEGER (2 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | NAD denoised, rotated, Cryo-ET map of mouse utricle Pls1-/- hair cell stereocilia | ||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 これらの図は立方格子座標系で作成されたものです | ||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 9.47 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-試料の構成要素
-全体 : Hair Cell Stereocilia
全体 | 名称: Hair Cell Stereocilia |
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要素 |
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-超分子 #1: Hair Cell Stereocilia
超分子 | 名称: Hair Cell Stereocilia / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 詳細: Hair Cell Stereocilia Cryo-electron tomogram of Pls1-/- Mouse Utricle |
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由来(天然) | 生物種: Mus (ネズミ) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | tissue |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE |
切片作成 | その他: NO SECTIONING |
位置合わせマーカー | Manufacturer: Nanoprobes / 直径: 14 nm |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k) 平均電子線量: 80.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 4.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 3.5 µm |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 87 |
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