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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lbj | ||||||
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タイトル | NMR solution structure of motilin in phospholipid bicellar solution | ||||||
要素 | motilin | ||||||
キーワード | HORMONE/GROWTH FACTOR / a-helix / b-turn of type I / HORMONE-GROWTH FACTOR COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 motilin receptor binding / Peptide ligand-binding receptors / hormone activity / G alpha (q) signalling events / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing, molecular dynamics | ||||||
データ登録者 | Andersson, A. / Maler, L. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.BIOMOL.NMR / 年: 2002 タイトル: NMR solution structure and dynamics of motilin in isotropic phospholipid bicellar solution 著者: Andersson, A. / Maler, L. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1997 タイトル: Three-dimensional structure and position of porcine motilin in sodium dodecyl sulfate micelles determined by 1H NMR 著者: Jarvet, J. / Zdunek, J. / Damberg, P. / Graslund, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1lbj.cif.gz | 159.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1lbj.ent.gz | 112.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1lbj.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1lbj_validation.pdf.gz | 343.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1lbj_full_validation.pdf.gz | 455.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1lbj_validation.xml.gz | 8.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1lbj_validation.cif.gz | 14.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lb/1lbj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lb/1lbj | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2703.079 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: The peptide was chemically synthesized. The sequence of the motilin peptide is naturally found in Homo sapiens (human) 参照: UniProt: P12872 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: 2D NOESY |
NMR実験の詳細 | Text: this structure was determined using standard 2D homonuclear techniques |
-試料調製
詳細 | 内容: 3 mM motilin, 50mM KCl, 15% q=0.5 DMPC,DMPG/DHPC / 溶媒系: 90% H2O, 10% D20 |
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試料状態 | イオン強度: 50 mM KCl / pH: 5.5 / 圧: ambient / 温度: 310 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M |
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放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing, molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: structure based on total of 200 distance and 8 torsion angle constraints | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations,structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 24 |