登録情報 | データベース: PDB / ID: 1il2 |
---|
タイトル | Crystal Structure of the E. coli Aspartyl-tRNA Synthetase:Yeast tRNAasp:aspartyl-Adenylate Complex |
---|
要素 | - ASPARTYL TRANSFER RNA
- ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE
|
---|
キーワード | LIGASE/RNA / protein-rna complex / LIGASE-RNA COMPLEX |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
aspartate-tRNA ligase / aspartyl-tRNA aminoacylation / aspartate-tRNA ligase activity / nucleic acid binding / ATP binding / cytosol類似検索 - 分子機能 GAD-like domain / : / : / Aspartate-tRNA ligase, type 1 / GAD domain / GAD domain / GAD-like domain superfamily / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) ...GAD-like domain / : / : / Aspartate-tRNA ligase, type 1 / GAD domain / GAD domain / GAD-like domain superfamily / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Gyrase A; domain 2 / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ASPARTYL-ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / : / RNA / RNA (> 10) / Aspartate--tRNA ligase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌)
![](img/tx_yeast.gif) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.6 Å |
---|
データ登録者 | Moulinier, L. / Eiler, S. / Eriani, G. / Gangloff, J. / Thierry, J.C. / Gabriel, K. / McClain, W.H. / Moras, D. |
---|
引用 | ジャーナル: EMBO J. / 年: 2001 タイトル: The structure of an AspRS-tRNA(Asp) complex reveals a tRNA-dependent control mechanism. 著者: Moulinier, L. / Eiler, S. / Eriani, G. / Gangloff, J. / Thierry, J.C. / Gabriel, K. / McClain, W.H. / Moras, D. |
---|
履歴 | 登録 | 2001年5月7日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2001年9月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2008年4月27日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.3 | 2022年12月21日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / diffrn_source ...database_2 / diffrn_source / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
改定 1.4 | 2024年4月3日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
---|
|
---|