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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1eup | |||||||||
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タイトル | X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF CYTOCHROME P450ERYF WITH ANDROSTENDIONE BOUND | |||||||||
![]() | CYTOCHROME P450ERYF | |||||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / cytochrome P450 / steroid / androstenedione / cytochrome P450eryF | |||||||||
機能・相同性 | ![]() 6-deoxyerythronolide B hydroxylase / erythromycin biosynthetic process / cholest-4-en-3-one 26-monooxygenase activity / steroid hydroxylase activity / cholesterol catabolic process / monooxygenase activity / iron ion binding / heme binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Cupp-Vickery, J.R. / Anderson, R. / Hatziris, Z. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of ligand complexes of P450eryF exhibiting homotropic cooperativity. 著者: Cupp-Vickery, J. / Anderson, R. / Hatziris, Z. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 100.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 75.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 558.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 568.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 44515.152 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: Q00441 | ||
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#2: 化合物 | ChemComp-HEM / | ||
#3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.39 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.56 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: PEG 4000 NaAc Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 詳細: used to seeding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 22 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS II / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1999年1月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.1→10 Å / Num. all: 24521 / Num. obs: 23549 / % possible obs: 95.5 % / Observed criterion σ(F): 1 / Observed criterion σ(I): 1 / Rmerge(I) obs: 0.082 / Net I/σ(I): 10 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 133137 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.1→10 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→10 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / 最低解像度: 10 Å / σ(F): 2 / Rfactor Rwork: 0.184 | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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