登録情報 | データベース: PDB / ID: 1c0a |
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE : TRNAASP : ASPARTYL-ADENYLATE COMPLEX |
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要素 | - ASPARTYL TRNA
- ASPARTYL TRNA SYNTHETASE
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キーワード | LIGASE/RNA / PROTEIN-RNA COMPLEX / LIGASE-RNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
aspartate-tRNA ligase / aspartate-tRNA ligase activity / aspartyl-tRNA aminoacylation / nucleic acid binding / ATP binding / cytosol類似検索 - 分子機能 GAD-like domain / : / : / Aspartate-tRNA ligase, type 1 / GAD domain / GAD domain / GAD-like domain superfamily / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) ...GAD-like domain / : / : / Aspartate-tRNA ligase, type 1 / GAD domain / GAD domain / GAD-like domain superfamily / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Gyrase A; domain 2 / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ASPARTYL-ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / ADENOSINE MONOPHOSPHATE / : / RNA / RNA (> 10) / Aspartate--tRNA ligase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 2.4 Å |
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データ登録者 | Eiler, S. / Dock-Bregeon, A.-C. / Moulinier, L. / Thierry, J.-C. / Moras, D. |
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引用 | ジャーナル: EMBO J. / 年: 1999 タイトル: Synthesis of aspartyl-tRNA(Asp) in Escherichia coli--a snapshot of the second step. 著者: Eiler, S. / Dock-Bregeon, A. / Moulinier, L. / Thierry, J.C. / Moras, D. |
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履歴 | 登録 | 1999年7月15日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 1999年11月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月27日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2024年2月7日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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