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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Q. thermotolerans Engineered Encapsulin P3P4 | |||||||||
![]() | Sharp map from CryoSPARC refinement. | |||||||||
![]() |
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![]() | Encapsulin / Nanocage / Compartment / Storage / Complex / VIRUS LIKE PARTICLE | |||||||||
機能・相同性 | Type 1 encapsulin shell protein / Encapsulating protein for peroxidase / encapsulin nanocompartment / iron ion transport / intracellular iron ion homeostasis / Type 1 encapsulin shell protein![]() | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.1 Å | |||||||||
![]() | Satler T / Jerala R | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of engineered encapsulin P3P4 著者: Satler T / Jerala R | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 567.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.8 KB 14.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 17.8 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 283 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 600.7 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 4.1 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 300.8 MB 557.8 MB 557.8 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 27.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 36.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8rvjMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Sharp map from CryoSPARC refinement. | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.2 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Basic map from CryoSPARC refinement.
ファイル | emd_19521_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Basic map from CryoSPARC refinement. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map 1 from CryoSPARC reinement.
ファイル | emd_19521_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map 1 from CryoSPARC reinement. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map 2 from CryoSPARC reinement.
ファイル | emd_19521_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map 2 from CryoSPARC reinement. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Engineered Encapsulin P3P4
全体 | 名称: Engineered Encapsulin P3P4 |
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要素 |
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-超分子 #1: Engineered Encapsulin P3P4
超分子 | 名称: Engineered Encapsulin P3P4 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 0.8 mg/mL | |||||||||
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緩衝液 | pH: 7.5 構成要素:
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グリッド | モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY ARRAY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE | |||||||||
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 95 % / チャンバー内温度: 277.15 K |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS GLACIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 40.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.9 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.9 µm |