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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Recombinant Ena3A L-Type endospore appendages | |||||||||
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![]() | Endospore / Pili / Protein / Fiber / Spore / Appendage / Bacillus paranthracis / PROTEIN FIBRIL / recombinant | |||||||||
機能・相同性 | Endospore appendages core / Endospore appendages / DUF3992 domain-containing protein![]() | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.32 Å | |||||||||
![]() | Sleutel M / Remaut H | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: A novel class of ultra-stable endospore appendages decorated with collagen-like tip fibrillae 著者: Sleutel M / Zegeye ED / Llarena AK / Pradhan B / Fislage M / O'Sullivan K / Aspholm M / Remaut H | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 50.5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14 KB 14 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 9.9 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 71.8 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 103 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 5.5 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 95.6 MB 95.6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 952.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 952.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8pdzMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.764 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_17627_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_17627_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Recombinant Ena3A L-type endospore appendage
全体 | 名称: Recombinant Ena3A L-type endospore appendage |
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要素 |
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-超分子 #1: Recombinant Ena3A L-type endospore appendage
超分子 | 名称: Recombinant Ena3A L-type endospore appendage / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 18.03 kDa/nm |
-分子 #1: DUF3992 domain-containing protein
分子 | 名称: DUF3992 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 28 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 11.58715 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MAQIGNCCTE QLCCVNDAVC CTIILDDTGG TALPIWDDAT TFVINGTIMV ENNGTVGVGP TAALTVNGTA VGGFVVAPGE CRSITMNDI NSIAIVGAGT GTSSVKISFS INYKF UniProtKB: DUF3992 domain-containing protein |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | らせん対称体再構成法 |
試料の集合状態 | filament |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 / 構成要素 - 式: miliQ |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | JEOL CRYO ARM 300 |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 実像数: 8528 / 平均電子線量: 62.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm / 倍率(公称値): 60000 |