ChemComp-16B: N-hydroxycytidine 5'-(dihydrogen phosphate)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 16B
• 名称: 名称: N-hydroxycytidine 5'-(dihydrogen phosphate); 日化辞名称: N-ヒドロキシシチジン5′-りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₄N₃O₉P / 原子数: 36 / 化学式量: 339.196 / 形式電荷: 0

その他

4hib

C

タイプ: RNA linking / PDB分類: ATOMN / 3文字コード: 16B / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4HIB / 親要素: C

履歴

作成	2012年10月18日
公開	2012年11月9日
Modify atom id	2021年7月27日
Modify atom id	2021年8月11日

• 外部リンク: UniChem / ChEMBL / 日化辞 / PubChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OCC1OC(N2C=CC(=NC2=O)NO)C(O)C1O
• CACTVS 3.385: ONC1=NC(=O)N(C=C1)[CH]2O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]2O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C1=CN(C(=O)N=C1NO)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: ONC1=NC(=O)N(C=C1)[C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C1=CN(C(=O)N=C1NO)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H14N3O9P/c13-6-4(3-20-22(17,18)19)21-8(7(6)14)12-2-1-5(11-16)10-9(12)15/h1-2,4,6-8,13-14,16H,3H2,(H,10,11,15)(H2,17,18,19)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: DYOUVDKCXLKHKY-XVFCMESISA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-hydroxycytidine 5'-(dihydrogen phosphate)
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-3,4-bis(oxidanyl)-5-[4-(oxidanylamino)-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-4hib:
Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with CMP-N4-OH

PDB-4hkp:
Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with CMP-N3-oxide