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万見
- EMDB-16841: S.cerevisiae THO complex from endogenous nuclear mRNPs -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-16841
タイトルS.cerevisiae THO complex from endogenous nuclear mRNPs
マップデータdimer masked map
試料
  • 複合体: THO complex dimer
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit HPR1
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit MFT1
    • タンパク質・ペプチド: Protein TEX1
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit THP2
キーワードComplex / Nuclear / Dimer / NUCLEAR PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


nucleoplasmic THO complex / cellular response to azide / THO complex / THO complex part of transcription export complex / transcription export complex / positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I / Cdc73/Paf1 complex / mRNA 3'-end processing / positive regulation of transcription by RNA polymerase I / transcription-coupled nucleotide-excision repair ...nucleoplasmic THO complex / cellular response to azide / THO complex / THO complex part of transcription export complex / transcription export complex / positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I / Cdc73/Paf1 complex / mRNA 3'-end processing / positive regulation of transcription by RNA polymerase I / transcription-coupled nucleotide-excision repair / mRNA export from nucleus / stress granule assembly / transcription elongation by RNA polymerase II / mRNA processing / DNA recombination / nucleic acid binding / chromosome, telomeric region / molecular adaptor activity / mRNA binding / nucleus
類似検索 - 分子機能
THO complex subunit Thp2 / Tho complex subunit THP2 / TREX component Tex1/THOC3 / THO complex subunit 7/Mft1 / THO complex, subunitTHOC2, C-terminal / THO complex, subunitTHOC2, N-terminal / THO complex subunit 2, N-terminal domain / THO complex subunit 2 / Tho complex subunit 7 / Transcription factor/nuclear export subunit protein 2 ...THO complex subunit Thp2 / Tho complex subunit THP2 / TREX component Tex1/THOC3 / THO complex subunit 7/Mft1 / THO complex, subunitTHOC2, C-terminal / THO complex, subunitTHOC2, N-terminal / THO complex subunit 2, N-terminal domain / THO complex subunit 2 / Tho complex subunit 7 / Transcription factor/nuclear export subunit protein 2 / Transcription- and export-related complex subunit / THO complex subunit 2 N-terminus / THO complex, subunit THOC1 / THO complex subunit 1 transcription elongation factor / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD domain, G-beta repeat / WD40 repeats / WD40 repeat / WD40-repeat-containing domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
THO complex subunit THP2 / THO complex subunit HPR1 / THO complex subunit MFT1 / THO complex subunit 2 / Protein TEX1
類似検索 - 構成要素
生物種Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) / Saccharomyces cerevisiae BY4741 (パン酵母)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 11.0 Å
データ登録者Bonneau F / Schaefer IB / Conti E
資金援助European Union, ドイツ, デンマーク, 3件
OrganizationGrant number国
European Research Council (ERC)101054447European Union
German Research Foundation (DFG)SFB1035 ドイツ
Novo Nordisk Foundation31199 デンマーク
引用ジャーナル: Genes Dev / 年: 2023
タイトル: Nuclear mRNPs are compact particles packaged with a network of proteins promoting RNA-RNA interactions.
著者: Fabien Bonneau / Jérôme Basquin / Barbara Steigenberger / Tillman Schäfer / Ingmar B Schäfer / Elena Conti /
要旨: Messenger RNAs (mRNAs) are at the center of the central dogma of molecular biology. In eukaryotic cells, these long ribonucleic acid polymers do not exist as naked transcripts; rather, they associate ...Messenger RNAs (mRNAs) are at the center of the central dogma of molecular biology. In eukaryotic cells, these long ribonucleic acid polymers do not exist as naked transcripts; rather, they associate with mRNA-binding proteins to form messenger ribonucleoprotein (mRNP) complexes. Recently, global proteomic and transcriptomic studies have provided comprehensive inventories of mRNP components. However, knowledge of the molecular features of distinct mRNP populations has remained elusive. We purified endogenous nuclear mRNPs from by harnessing the mRNP biogenesis factors THO and Sub2 in biochemical procedures optimized to preserve the integrity of these transient ribonucleoprotein assemblies. We found that these mRNPs are compact particles that contain multiple copies of Yra1, an essential protein with RNA-annealing properties. To investigate their molecular and architectural organization, we used a combination of proteomics, RNA sequencing, cryo-electron microscopy, cross-linking mass spectrometry, structural models, and biochemical assays. Our findings indicate that yeast nuclear mRNPs are packaged around an intricate network of interconnected proteins capable of promoting RNA-RNA interactions via their positively charged intrinsically disordered regions. The evolutionary conservation of the major mRNA-packaging factor (yeast Yra1 and Aly/REF in metazoans) points toward a general paradigm governing nuclear mRNP packaging.
履歴
登録2023年3月13日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年7月12日-
マップ公開2023年7月12日-
更新2023年7月26日-
現状2023年7月26日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_16841.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_16841.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 129.7 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈dimer masked map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.89 Å/pix.
x 324 pix.
= 610.74 Å		1.89 Å/pix.
x 324 pix.
= 610.74 Å		1.89 Å/pix.
x 324 pix.
= 610.74 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.885 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.17
最小 - 最大-0.19695333 - 0.71959984
平均 (標準偏差)-0.0006018533 (±0.028224897)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ324324324
Spacing324324324
セルA=B=C: 610.74 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_16841_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: dimer half map A

ファイルemd_16841_half_map_1.map
注釈dimer half map A
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: dimer half map B

ファイルemd_16841_half_map_2.map
注釈dimer half map B
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : THO complex dimer

全体名称: THO complex dimer
要素
  • 複合体: THO complex dimer
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit HPR1
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit MFT1
    • タンパク質・ペプチド: Protein TEX1
    • タンパク質・ペプチド: THO complex subunit THP2

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超分子 #1: THO complex dimer

超分子名称: THO complex dimer / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
詳細: From nuclear mRNPs isolated by bi-molecular affinity purification using Sub2 and Hpr1 as baits, then treated with Benzonase.
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) / 株: BY4741

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分子 #1: THO complex subunit 2

分子名称: THO complex subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae BY4741 (パン酵母)
配列文字列: MAEQTLLSKL NALSQKVIPP ASPSQASILT EEVIRNWPER SKTLCSDFTA LESNDEKEDW LRTLFIELFD FINKNDENSP LKLSDVASFT NELVNHERQV SQASIVGKMF IAVSSTVPNI NDLTTISLCK LIPSLHEELF KFSWISSKLL NKEQTTLLRH LLKKSKYELK ...文字列:
MAEQTLLSKL NALSQKVIPP ASPSQASILT EEVIRNWPER SKTLCSDFTA LESNDEKEDW LRTLFIELFD FINKNDENSP LKLSDVASFT NELVNHERQV SQASIVGKMF IAVSSTVPNI NDLTTISLCK LIPSLHEELF KFSWISSKLL NKEQTTLLRH LLKKSKYELK KYNLLVENSV GYGQLVALLI LAYYDPDNFS KVSAYLKEIY HIMGKYSLDS IRTLDVILNV SSQFITEGYK FFIALLRKSD SWPSSHVANN SNYSSLNEGG NMIAANIISF NLSQYNEEVD KENYERYMDM CCILLKNGFV NFYSIWDNVK PEMEFLQEYI QNLETELEEE STKGVENPLA MAAALSTENE TDEDNALVVN DDVNMKDKIS EETNADIESK GKQKTQQDIL LFGKIKLLER LLIHGCVIPV IHVLKQYPKV LYVSESLSRY LGRVFEYLLN PLYTSMTSSG ESKDMATALM ITRIDNGILA HKPRLIHKYK THEPFESLEL NSSYVFYYSE WNSNLTPFAS VNDLFENSHI YLSIIGPYLG RIPTLLSKIS RIGVADIQKN HGSESLHVTI DKWIDYVRKF IFPATSLLQN NPIATSEVYE LMKFFPFEKR YFIYNEMMTK LSQDILPLKV SFNKAEREAK SILKALSIDT IAKESRRFAK LISTNPLASL VPAVKQIENY DKVSELVVYT TKYFNDFAYD VLQFVLLLRL TYNRPAVQFD GVNQAMWVQR LSIFIAGLAK NCPNMDISNI ITYILKTLHN GNIIAVSILK ELIITVGGIR DLNEVNMKQL LMLNSGSPLK QYARHLIYDF RDDNSVISSR LTSFFTDQSA ISEIILLLYT LNLKANTQNS HYKILSTRCD EMNTLLWSFI ELIKHCLKGK AFEENVLPFV ELNNRFHLST PWTFHIWRDY LDNQLNSNEN FSIDELIEGA EFSDVDLTKI SKDLFTTFWR LSLYDIHFDK SLYDERKNAL SGENTGHMSN RKKHLIQNQI KDILVTGISH QRAFKKTSEF ISEKSNVWNK DCGEDQIKIF LQNCVVPRVL FSPSDALFSS FFIFMAFRTE NLMSILNTCI TSNILKTLLF CCTSSEAGNL GLFFTDVLKK LEKMRLNGDF NDQASRKLYE WHSVITEQVI DLLSEKNYMS IRNGIEFMKH VTSVFPVVKA HIQLVYTTLE ENLINEERED IKLPSSALIG HLKARLKDAL ELDEFCTLTE EEAEQKRIRE MELEEIKNYE TACQNEQKQV ALRKQLELNK SQRLQNDPPK SVASGSAGLN SKDRYTYSRN EPVIPTKPSS SQWSYSKVTR HVDDINHYLA TNHLQKAISL VENDDETRNL RKLSKQNMPI FDFRNSTLEI FERYFRTLIQ NPQNPDFAEK IDSLKRYIKN ISREPYPDTT SSYSEAAAPE YTKRSSRYSG NAGGKDGYGS SNYRGPSNDR SAPKNIKPIS SYAHKRSELP TRPSKSKTYN DRSRALRPTG PDRGDGFDQR DNRLREEYKK NSSQRSQLRF PEKPFQEGKD SSKANPYQAS SYKRDSPSEN EEKPNKRFKK DETIRNKFQT QDYRNTRDSG AAHRANENQR YNGNRKSNTQ ALPQGPKGGN YVSRYQR

UniProtKB: THO complex subunit 2

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分子 #2: THO complex subunit HPR1

分子名称: THO complex subunit HPR1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae BY4741 (パン酵母)
配列文字列: MSNTEELIQN SIGFLQKTFK ALPVSFDSIR HEPLPSSMLH ASVLNFEWEP LEKNISAIHD RDSLIDIILK RFIIDSMTNA IEDEEENNLE KGLLNSCIGL DFVYNSRFNR SNPASWGNTF FELFSTIIDL LNSPSTFLKF WPYAESRIEW FKMNTSVEPV SLGESNLISY ...文字列:
MSNTEELIQN SIGFLQKTFK ALPVSFDSIR HEPLPSSMLH ASVLNFEWEP LEKNISAIHD RDSLIDIILK RFIIDSMTNA IEDEEENNLE KGLLNSCIGL DFVYNSRFNR SNPASWGNTF FELFSTIIDL LNSPSTFLKF WPYAESRIEW FKMNTSVEPV SLGESNLISY KQPLYEKLRH WNDILAKLEN NDILNTVKHY NMKYKLENFL SELLPINEES NFNRSASISA LQESDNEWNR SARERESNRS SDVIFAADYN FVFYHLIICP IEFAFSDLEY KNDVDRSLSP LLDAILEIEE NFYSKIKMNN RTRYSLEEAL NTEYYANYDV MTPKLPVYMK HSNAMKMDRN EFWANLQNIK ESDDYTLRPT IMDISLSNTT CLYKQLTQED DDYYRKQFIL QLCFTTNLIR NLISSDETRN FYKSCYLREN PLSDIDFENL DEVNKKRGLN LCSYICDNRV LKFYKIKDPD FYRVIRKLMS SDEKFTTAKI DGFKEFQNFR ISKEKIPPPA FDETFKKFTF IKMGNKLINN VWKIPTGLDK IEQEVKKPEG VYEAAQAKWE SKISSETSGG EAKDEIIRQW QTLRFLRSRY LFDFDKVNEK TGVDGLFEEP RKVEALDDSF KEKLLYKINQ EHRKKLQDAR EYKIGKERKK RALEEEASFP EREQKIKSQR INSASQTEGD ELKSEQTQPK GEISEENTKI KSSEVSSQDP DSGVAGEFAP QNTTAQLENP KTEDNNAATS NISNGSSTQD MKGSGSGSGS GSSAWSHPQF EKGGGSGGGS GGSAWSHPQF EK

UniProtKB: THO complex subunit HPR1

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分子 #3: THO complex subunit MFT1

分子名称: THO complex subunit MFT1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae BY4741 (パン酵母)
配列文字列: MPLSQKQIDQ VRTKVHYSEV DTPFNKYLDI LGKVTKLTGS IINGTLSNDD SKIEKLTEQN ISQLKESAHL RFLDLQSSID TKKVADENWE TCQQETLAKL ENLKDKLPDI KSIHSKLLLR IGKLQGLYDS VQVINREVEG LSEGRTSLVV TRAEWEKELG TDLVKFLIEK ...文字列:
MPLSQKQIDQ VRTKVHYSEV DTPFNKYLDI LGKVTKLTGS IINGTLSNDD SKIEKLTEQN ISQLKESAHL RFLDLQSSID TKKVADENWE TCQQETLAKL ENLKDKLPDI KSIHSKLLLR IGKLQGLYDS VQVINREVEG LSEGRTSLVV TRAEWEKELG TDLVKFLIEK NYLKLVDPGL KKDSSEERYR IYDDFSKGPK ELESINASMK SDIENVRQEV SSYKEKWLRD AEIFGKITSI FKEELLKRDG LLNEAEGDNI DEDYESDEDE ERKERFKRQR SMVEVNTIEN VDEKEESDHE YDDQEDEENE EEDDMEVDVE DIKEDNEVDG ESSQQEDNSR QGNNEETDKE TGVIEEPDAV NDAEEADSDH SSRKLGGTTS DFSASSSVEE VK

UniProtKB: THO complex subunit MFT1

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分子 #4: Protein TEX1

分子名称: Protein TEX1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae BY4741 (パン酵母)
配列文字列: MSTIGAVDIL NQKTITSEVA ASVTSKYLQS TFSKGNTSHI EDKRFIHVSS RSHSRFTSTP ITPNEILSLK FHVSGSSMAY SRMDGSLTVW FIKDASFDKS VEVYIPDCCG SDKLATDLSW NPTSLNQIAV VSNSSEISLL LINEKSLTAS KLRTLSLGSK TKVNTCLYDP ...文字列:
MSTIGAVDIL NQKTITSEVA ASVTSKYLQS TFSKGNTSHI EDKRFIHVSS RSHSRFTSTP ITPNEILSLK FHVSGSSMAY SRMDGSLTVW FIKDASFDKS VEVYIPDCCG SDKLATDLSW NPTSLNQIAV VSNSSEISLL LINEKSLTAS KLRTLSLGSK TKVNTCLYDP LGNWLLAATK SEKIYLFDVK KDHSSVCSLN ISDISQEDND VVYSLAWSNG GSHIFIGFKS GYLAILKAKH GILEVCTKIK AHTGPITEIK MDPWGRNFIT GSIDGNCYVW NMKSLCCELI INDLNSAVTT LDVCHLGKIL GICTEDEMVY FYDLNSGNLL HSKSLANYKT DPVLKFYPDK SWYIMSGKND TLSNHFVKNE KNLITYWKDM FDNTMIEKRR KNNGGGNNHN KRTSKNTDRI GKDRPSRFNS KK

UniProtKB: Protein TEX1

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分子 #5: THO complex subunit THP2

分子名称: THO complex subunit THP2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae BY4741 (パン酵母)
配列文字列: MTKEEGRTYF ESLCEEEQSL QESQTHLLNI LDILSVLADP RSSDDLLTES LKKLPDLHRE LINSSIRLRY DKYQTREAQL LEDTKTGRDV AAGVQNPKSI SEYYSTFEHL NRDTLRYINL LKRLSVDLAK QVEVSDPSVT VYEMDKWVPS EKLQGILEQY CAPDTDIRGV ...文字列:
MTKEEGRTYF ESLCEEEQSL QESQTHLLNI LDILSVLADP RSSDDLLTES LKKLPDLHRE LINSSIRLRY DKYQTREAQL LEDTKTGRDV AAGVQNPKSI SEYYSTFEHL NRDTLRYINL LKRLSVDLAK QVEVSDPSVT VYEMDKWVPS EKLQGILEQY CAPDTDIRGV DAQIKNYLDQ IKMARAKFGL ENKYSLKERL STLTKELNHW RKEWDDIEML MFGDDAHSMK KMIQKIDSLK SEINAPSESY PVDKEGDIVL E

UniProtKB: THO complex subunit THP2

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 8
構成要素:
濃度名称
50.0 mMPotassium phosphate
0.01 %NP40
10.0 mMBiotin
グリッドモデル: Quantifoil R2/1 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 20 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR
凍結凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 95 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS GLACIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-40 / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 2258 / 平均露光時間: 16.0 sec. / 平均電子線量: 59.0 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.62 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 倍率（公称値）: 22000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL / In silico モデル: Ab initio generated by cryoSPARC
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 11.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4) / 使用した粒子像数: 37404
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4)
最終 3次元分類クラス数: 3 / 平均メンバー数/クラス: 30000 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4)
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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