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タイトルAsymmetric sheath coordination controls flagellar architecture and function in Leptospira spirochete.
ジャーナル・号・ページEmbo J., Vol. 45, Page 2882-2904, Year 2026
掲載日2025年10月18日
著者Akihiro Kawamoto / Toshiki Kuribayashi / Masatomo Morita / Shuichi Nakamura / Nobuo Koizumi /
PubMed 要旨Bacterial flagella are essential for motility, but their structure and how they generate movement vary greatly. Most motile bacteria use external helical flagella, whereas spirochetes have ...Bacterial flagella are essential for motility, but their structure and how they generate movement vary greatly. Most motile bacteria use external helical flagella, whereas spirochetes have periplasmic flagella (PFs) that distort the cell body to drive forward movement. Here, we generated sheath protein knockout mutants and used high-resolution cryo-electron microscopy to elucidate the mechanisms underlying PF assembly, curvature, and rigidity in Leptospira biflexa. The PF consists of a FlaB1-based core filament surrounded asymmetrically by sheath proteins. Weak but essential binding of FlaA2 to the core enables asymmetric localization of the coiling protein FcpA. FcpA alone can induce curvature, whereas FcpB acts as a structural wedge that reinforces PF rigidity and enables efficient swimming in liquid. Specific glycosylation of FlaB1 mediates sheath-core interactions and may guide the assembly of sheath components. We propose that sheath proteins interact transiently with the core and may be anchored to the outer membrane, allowing core rotation beneath a static sheath. These findings reveal how cooperative interactions among sheath components confer structural and mechanical specialization to spirochete flagella.
リンクEmbo J. / PubMed:41844841 / PubMed Central
手法EM (らせん対称) / EM (単粒子)
解像度2.3 - 4.35 Å
構造データ

EMDB-63347, PDB-9lry:
Straight and symmetrical filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.3 Å

EMDB-63348, PDB-9lrz:
Core filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.4 Å

EMDB-63349, PDB-9ls0:
Straight and symmetrical filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa deleted fcpB strain
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.4 Å

EMDB-63350, PDB-9ls1:
core filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa deleted fcpB strain
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.4 Å

EMDB-66641, PDB-9x7k:
core filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa wild type
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.35 Å

EMDB-66642, PDB-9x7l:
core filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa from the flaA2-complemented stain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.32 Å

EMDB-66643, PDB-9x7m:
core filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa from the deleted fcpB_CL13 strain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-66646, PDB-9x7s:
sheathed filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa from the flaA2-complemented stain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.83 Å

EMDB-66647, PDB-9x7v:
Sheathed filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa from the deleted fcpB_CL13 strain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.7 Å

EMDB-66649, PDB-9x80:
sheathed filament of the spirochete periplasmic flagella of Leptospira biflexa wild type
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.24 Å

由来
  • leptospira biflexa (バクテリア)
キーワードMOTOR PROTEIN / Filament / Flagellar motor

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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