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タイトルComparative immunogenic and structural analysis of virus-like particle and inactivated whole-virion vaccines against enterovirus D68.
ジャーナル・号・ページMol Ther Nucleic Acids, Vol. 37, Issue 2, Page 102957, Year 2026
掲載日2026年6月16日
著者Kota Senpuku / Yuta Kunishima / Mika Hirose / Tatsuya Karaki / Kotaro Taniguchi / Chikako Kataoka-Nakamura / Toshiro Hirai / Koubun Yasuda / Etsushi Kuroda / Takayuki Kato / Taiki Ito / Yasuo Yoshioka /
PubMed 要旨Enterovirus D68 (EV-D68) primarily causes respiratory illnesses and has been implicated in acute flaccid myelitis. Although virus-like particle (VLP) and traditional inactivated whole-virion (IWV) ...Enterovirus D68 (EV-D68) primarily causes respiratory illnesses and has been implicated in acute flaccid myelitis. Although virus-like particle (VLP) and traditional inactivated whole-virion (IWV) vaccines have demonstrated efficacy in mice, their immunological differences remain undetermined. Here, we directly compared the immunogenic and structural properties of VLP and IWV vaccines derived from the same EV-D68 strain under identical conditions. Although VLP induced significantly lower levels of EV-D68-specific IgG than IWV, neutralizing antibody titers and protective effects against viral challenge were comparable between the two groups in mice. Passive transfer experiments in neonatal mice further confirmed protection against lethal infection for both vaccine groups. Notably, in contrast to the IWV vaccine, the VLP vaccine elicited antibodies that preferentially recognized a limited subset of epitopes. Cryo-electron microscopy analyses revealed that VLPs structurally resemble the native virus but display distinct features in regions corresponding to epitopes that show differential antibody reactivity between VLP and IWV vaccines. By integrating structural and immunological analyses, we established a mechanistic framework linking capsid architecture to vaccine-induced antibody specificity. These findings suggest that VLP is a promising EV-D68 vaccine antigen with distinct epitope recognition profiles driven by structural characteristics.
リンクMol Ther Nucleic Acids / PubMed:42293247 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.57 Å
構造データ

65634

9w4i

EMDB-65634, PDB-9w4i:
Cryo-EM structure of Enterovirus-D68 MO strain virus-like particle
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.57 Å

由来
  • enterovirus d68 (エンテロウイルス)
キーワードVIRUS LIKE PARTICLE / Enterovirus-D68 / MO strain / viral structural proteins

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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