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タイトルStructural and functional characterization of the antigenicity of influenza A virus hemagglutinin subtype H15.
ジャーナル・号・ページCell Rep, Vol. 45, Issue 1, Page 116773, Year 2026
掲載日2026年1月27日
著者Disha Bhavsar / André Nicolás León / Wei-Li Hsu / Eduard Puente-Massaguer / James A Ferguson / Julianna Han / Patrick Wilson / Andrew B Ward / Florian Krammer /
PubMed 要旨Avian H15 influenza viruses are closely related to H7 viruses, but only 22 H15 sequences have been reported since 1987, suggesting both rarity and minimal antigenic variation. Here, we characterized ...Avian H15 influenza viruses are closely related to H7 viruses, but only 22 H15 sequences have been reported since 1987, suggesting both rarity and minimal antigenic variation. Here, we characterized a panel of mouse monoclonal antibodies (mAbs) raised against the A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979 ancestral strain, and a human mAb isolated from an H7N9 vaccinee. We found differences in binding and neutralization profiles against the ancestral strain and drifted strains of H15 isolated after 2008. mAbs exhibiting hemagglutination inhibition activity against the ancestral strain do not show binding to drifted strains, hinting at antigenic differences near the receptor binding site. We show that the mAbs protect in vivo and elucidate mAb-antigen interactions using negative stain and cryo-electron microscopy. The characterization of H15 antigenicity and the mechanisms of antibody-mediated neutralization expands our knowledge of this sparsely sampled avian influenza virus subtype and informs our understanding of immune pressures on viral surface glycoproteins.
リンクCell Rep / PubMed:41485218 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.14 - 25.0 Å
構造データ

71419

9p9q

EMDB-71419, PDB-9p9q:
KL-H15-3G11 Fab in complex with soluble A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979 H15 hemagglutinin trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

71420

9p9r

EMDB-71420, PDB-9p9r:
KL-H15-6H4 Fab in complex with soluble A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979 H15 hemagglutinin trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.14 Å

71421

9p9s

EMDB-71421, PDB-9p9s:
KL-H15-6G8 Fab in complex with soluble A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979 H15 hemagglutinin trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.41 Å

71422

9p9t

EMDB-71422, PDB-9p9t:
07-5G01 Fab in complex with soluble A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979 H15 hemagglutinin trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.33 Å

EMDB-71424: KL-H15-6F6 Fab in complex with soluble A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979 H15 hemagglutinin trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.34 Å

EMDB-71480: Negative stain map of H15 HA (A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979) in complex with monoclonal Fab 6G8
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-71481: Negative stain map of H15 HA (A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979) in complex with monoclonal Fab 3G11
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-71482: Negative stain map of H15 HA (A/wedge-tailed shearwater/Western Australia/2576/1979) in complex with monoclonal Fab 6F6
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

由来
  • influenza a virus (a/shearwater/west australia/2576/79(h15n9)) (A型インフルエンザウイルス)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードVIRAL PROTEIN/Immune System / influenza virus / hemagglutinin / avian influenza virus / antibody Fab complex / glycoprotein / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-Immune System complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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