[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルStructural determination of the human taurine transporter TauT reveals the mechanism of substrate and inhibitor recognition.
ジャーナル・号・ページCell Rep, Vol. 44, Issue 12, Page 116591, Year 2025
掲載日2025年11月19日
著者Yishuo Lu / Dian Ding / Hongyi Chen / Peijun Jiang / Juan Luo / Hui Shan / Guangxi Wang / Jianyuan Luo / Yuxin Yin /
PubMed 要旨Taurine, a sulfur-containing amino acid, is vital for human health because of its antioxidant, anti-inflammatory, and osmoregulatory properties. Its homeostasis is maintained by the Na/Cl-dependent ...Taurine, a sulfur-containing amino acid, is vital for human health because of its antioxidant, anti-inflammatory, and osmoregulatory properties. Its homeostasis is maintained by the Na/Cl-dependent taurine transporter (TauT). Here, we present five atomic structures of human TauT: apo, taurine bound, and complexes with three taurine-mimetic inhibitors, including β-alanine, γ-aminobutyric acid (GABA), and guanidinoethyl sulfonate (GES). The structures of taurine-, β-alanine-, and GABA-bound human TauT (hTauT) in complex with NaCl adopt an occluded conformation, with ligands binding in a central pocket. With KCl, GES-bound hTauT adopts an inward-facing conformation, with two GES positioned along the substrate translocation pathway in a bipartite manner: one in the deep central cavity and the other precluding structural transition to the occluded state. The radioactive taurine uptake analyses clearly demonstrate the impact of residues on taurine recognition and inhibitor selection. These structures provide insights into the overall architecture, substrate coordination, and inhibitor recognition mechanism of TauT.
リンクCell Rep / PubMed:41269860
手法EM (単粒子)
解像度2.9 - 3.3 Å
構造データ

62564

9kts

EMDB-62564, PDB-9kts:
Structure of TauT in the apo state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

62565

9ktt

EMDB-62565, PDB-9ktt:
Structure of TauT in complex with taurine
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

62566

9ktu

EMDB-62566: Structure of TauT in complex with taurine
PDB-9ktu: Structure of TauT in complex with beta-alanine
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

62567

9ktv

EMDB-62567, PDB-9ktv:
Structure of TauT in complex with GABA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

62569

9ktx

EMDB-62569, PDB-9ktx:
Structure of TauT in complex with Guanidinoethyl sulfonate
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

化合物

ChemComp-CL:
Unknown entry / クロリド

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-TAU:
2-AMINOETHANESULFONIC ACID / タウリン

ChemComp-NA:
Unknown entry / ナトリウムカチオン

ChemComp-BAL:
BETA-ALANINE / β-アラニン

ChemComp-ABU:
GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID / GABA / 神経伝達物質, 阻害剤*YM

ChemComp-3S5:
Taurocyamine / タウロシアミン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / TauT / SLC6A6 / taurine transporter

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る