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タイトルMolecular basis of human taurine transporter uptake and inhibition.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 16, Issue 1, Page 7394, Year 2025
掲載日2025年8月11日
著者Bowen Du / Lili Cheng / Jiaying Xie / Ligong Chen / Kaige Yan /
PubMed 要旨The taurine transporter, TauT, regulates various taurine-mediated physiological and pathological functions by facilitating taurine uptake in a sodium- and chloride-dependent manner. Dysfunction of ...The taurine transporter, TauT, regulates various taurine-mediated physiological and pathological functions by facilitating taurine uptake in a sodium- and chloride-dependent manner. Dysfunction of TauT is associated with male infertility, retinal health and cancers. Despite extensive research efforts, the intricate structure of TauT, the molecular mechanisms underlying taurine transport, and the inhibition mechanisms involved, all remain elusive. Here, we present eleven cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of TauT. The structures TauT bound to substrate (taurine) and substrate analogues (β-alanine, guanidinoacetate, and γ-aminobutyric acid), are captured in distinct conformations. Combining with biochemical analyses, these structures reveal that amino acids Leu134 and Glu406 play a crucial role in substrate specificity within the GABA subfamily. Five distinct inhibitors, namely, piperidine-4-sulfonic acid, imidazole-4-acetatic acid, 5-aminovaleric acid, nipecotic acid and homotaurine, stabilize TauT in an inward-open conformation. Conversely, guanidinoethyl sulphonate stabilizes TauT in the occluded state. These structural insights offer a comprehensive understanding of how these inhibitors counteract taurine transport. Collectively, these findings advance our understanding of the substrate coordination and inhibitor recognition mechanisms of TauT.
リンクNat Commun / PubMed:40789850 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.92 - 3.45 Å
構造データ

EMDB-61943, PDB-9k0c:
Cryo-EM structural of human taurine transporter TauT in an apo state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.06 Å

EMDB-61948, PDB-9k0n:
Cryo-EM structure of human taurine transporter TauT bound with beta-alanine in an occluded state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.21 Å

EMDB-61949, PDB-9k0o:
Cryo-EM structure of human taurine transporter TauT bound with GAA in an intermediate state during the transport cycle
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.95 Å

EMDB-61970, PDB-9k1b:
Cryo-EM structure of human taurine transporter TauT bound with taurine in an occluded state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.34 Å

EMDB-61974, PDB-9k1f:
Cryo-EM structure of human taurine transporter TauT bound with GABA in an intermediate conformation in the transport cycle
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.43 Å

EMDB-61975, PDB-9k1h:
Cryo-EM structure of human taurine transporter TauT bound with P4S in an inward open state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.12 Å

EMDB-61976, PDB-9k1i:
Cryo-EM structure of huamn taurine transporter bound with I4AA in inward-open state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.92 Å

EMDB-61981, PDB-9k1v:
Cryo-EM structure of human taurine transporter bound with 5AVA in an inward-open state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.94 Å

EMDB-61983, PDB-9k1x:
Cryo-EM structure of human taurine transporter TauT bound with GES in an occluded state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.06 Å

EMDB-61985, PDB-9k1z:
Cryo-EM structure of human taurine transporter bound with nipecotic acid in an inward open state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.27 Å

EMDB-61987, PDB-9k21:
Cryo-EM structure of human taurine transporter TauT bound with homotaurine in an inward-open state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.45 Å

化合物

ChemComp-CL:
Unknown entry / クロリド

ChemComp-BAL:
BETA-ALANINE / β-アラニン

ChemComp-NA:
Unknown entry / ナトリウムカチオン

ChemComp-NMG:
GUANIDINO ACETATE / グアニジノ酢酸

ChemComp-TAU:
2-AMINOETHANESULFONIC ACID / タウリン

ChemComp-ABU:
GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID / GABA / 神経伝達物質, 阻害剤*YM

PDB-1ebd:
DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE COMPLEXED WITH THE BINDING DOMAIN OF THE DIHYDROLIPOAMIDE ACETYLASE

ChemComp-IZC:
2H-IMIDAZOL-4-YLACETIC ACID / 神経伝達物質*YM

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-KFB:
5-Aminovaleric Acid / 5-アミノ吉草酸

ChemComp-3S5:
Taurocyamine / タウロシアミン

ChemComp-ID7:
(3R)-piperidine-3-carboxylic acid / (R)-ニペコチン酸

ChemComp-A20:
3-aminopropane-1-sulfonic acid / ホモタウリン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードSTRUCTURAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / CL / TRANSPORT PROTEIN / STRUCTURAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / substrate / structural / protein / substrate protein transporter / Inhibitor

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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