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Structure paper

タイトルAn alternate receptor for adeno-associated viruses.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 188, Issue 18, Page 4924-4935.e23, Year 2025
掲載日2025年9月4日
著者Bijay P Dhungel / Hua Xu / Rajini Nagarajah / Joseph Vitale / Alex C H Wong / Divya Gokal / Yue Feng / Mehdi Sharifi Tabar / Cynthia Metierre / Chirag Parsania / Xiaohui Song / Guopeng Wang / Xiao-Dong Su / Charles G Bailey / John E J Rasko /
PubMed 要旨Systemic gene therapy using adeno-associated virus (AAV) vectors is approved for the treatment of several genetic disorders, but challenges and toxicities associated with high vector doses remain. We ...Systemic gene therapy using adeno-associated virus (AAV) vectors is approved for the treatment of several genetic disorders, but challenges and toxicities associated with high vector doses remain. We report an alternate receptor for AAV (AAVR2, carboxypeptidase D [CPD]), which is distinct from the multi-serotype AAV receptor (AAVR). AAVR2 enables the transduction of clade E AAVs, including AAV8, and determines an exclusive AAVR-independent transduction pathway for AAV11 and AAV12. We characterized direct binding between the AAV8 capsid and AAVR2 by cryo-electron microscopy (cryo-EM) and identified contact residues. We observed that AAV8 directly binds to the carboxypeptidase-like domain 1 of AAVR2 via its variable region VIII and demonstrated that AAV capsids that lack AAVR2 binding can be bioengineered to engage with AAVR2. Finally, we overexpressed a minimal functional AAVR2 to enhance AAV transduction in vivo. Our study provides insights into AAV biology and clinically deployable solutions to reduce dose-related toxicities associated with AAV vectors.
リンクCell / PubMed:40664211
手法EM (単粒子)
解像度2.32 - 3.02 Å
構造データ

61190

9j6z

EMDB-61190, PDB-9j6z:
Structure of AAV8 in complex with its receptor
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.02 Å

61205

9j7k

EMDB-61205, PDB-9j7k:
Structure of AAV8 in the complex of AAV8 with its receptor
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.32 Å

61206

9j7l

EMDB-61206, PDB-9j7l:
Structure of AAV8 capsid in complex with receptor
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.89 Å

由来
  • adeno-associated virus - 8 (アデノ随伴ウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードVIRAL PROTEIN/HYDROLASE / AAV8 / receptor / complex / VIRAL PROTEIN-HYDROLASE complex / VIRUS

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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