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Structure paper

タイトルStructurally exclusive Teneurin complexes orchestrate divergent programs in early cortical development.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 17, Issue 1, Year 2026
掲載日2026年4月16日
著者Miguel Berbeira-Santana / Claudia Peregrina / Kosuke Okuda / Jin Chuan Zhou / Maria Carrasquero-Ordaz / Amy V Roberts / Anne E Thomas / Evert Haanappel / Matthieu Chavent / Kamel El Omari / Lindsay A Baker / Daniel T Pederick / Els Pardon / Jan Steyaert / U Valentin Nägerl / Daniel Del Toro / Elena Seiradake /
PubMed 要旨Cortical migration is a complex process in which neurons migrate along radial glial cells (RGC) to form functional layers. Teneurins (Ten1-4) play a role by interacting with Latrophilins (Lphn/ADGRL1- ...Cortical migration is a complex process in which neurons migrate along radial glial cells (RGC) to form functional layers. Teneurins (Ten1-4) play a role by interacting with Latrophilins (Lphn/ADGRL1-3). Teneurins are also known as cell adhesion molecules, but how homophilic and heterophilic Teneurin interactions are integrated is unknown. Here, single-particle-cryo-EM data of Ten2 shows that canonical Latrophilin-binding is sterically incompatible with Ten2-dimerisation, making these interactions exclusive. We engineered surface mutations that specifically disrupt Ten2-Ten2 or Ten2-Latrophilin interactions. These are transferrable to Ten4, suggesting conserved binding mechanisms. Proteomics, in-vivo-gene-editing and super-resolution-microscopy show that Ten4 is expressed along RGC fibres and that migrating neurons switch from low-to-high Ten4-expression. Ten4 expression is highest in the cortical plate where Ten4-Ten4 interactions reduce RGC-attachment. In the intermediate zone, Ten4-Latrophilin interactions are required to promote neuron-RGC association. The results show how Ten4 orchestrates different stages of cortical migration by using a structural/functional switch between high-affinity Lphn interactions and low-affinity homophilic interactions, underpinning the integration of distinct migration programmes.
リンクNat Commun / PubMed:41991904 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.55 - 3.48 Å
構造データ

50975

9g2f

EMDB-50975, PDB-9g2f:
Mouse Teneurin2 dimer variant A1B1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

50976

9g2h

EMDB-50976, PDB-9g2h:
Mouse Teneurin2 dimer variant A1B0
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.55 Å

51021

9g41

EMDB-51021, PDB-9g41:
Mouse Teneurin2 dimer variant A0B1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.48 Å

51022

9g42

EMDB-51022, PDB-9g42:
Mouse Teneurin2 dimer variant A0B0
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.82 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

由来
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードCELL ADHESION / cell adhesion molecule / complex / homodimer

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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