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タイトルVip3C proteins from spp. for controlling lepidopteran crop pests.
ジャーナル・号・ページAppl Environ Microbiol, Page e0025325, Year 2025
掲載日2025年6月20日
著者Todd Ciche / William Moar / Aqeel Ahmad / David Bowen / Catherine Chay / Arlene Howe / Uma Kesanapalli / Jennifer Lutke / Gregory Bean / Jason Milligan / Michael Pleau / Yong Yin / Waseem Akbar / Marty Heppler / Cara Griffith / Kimberly Morrell / Katherine Dunkmann / Heather Anderson / Jeffrey Ahrens / Pacifica Sommers / E Sethe Burgie / Fred Zinnel / Meiying Zheng / James Fitzpatrick / Michael Rau / Timothy Rydel / Tommi White / David Kerns / James Roberts /
PubMed 要旨New proteins are needed to control insects not controlled with (Bt) crops, and those evolving resistance to Bt crops. These proteins are increasingly being reported from non-Bt organisms to control ...New proteins are needed to control insects not controlled with (Bt) crops, and those evolving resistance to Bt crops. These proteins are increasingly being reported from non-Bt organisms to control Bt-resistant insects. However, these proteins mostly control the corn rootworm, spp. (Coleoptera), whereas most Bt-resistant insects are lepidopteran. We hypothesized that diversifying our search for proteins into non-Bt organisms, such as those related to used to control Japanese beetle , could yield proteins with new insecticidal activities against Lepidoptera. Here, we identified Vip3Cb1 and Vip3Cc1 with broad lepidopteran activity, the first Vip3 proteins discovered from strains in the containing clade. Vip3Cb1 protected plants against cotton bollworm, and tobacco budworm and fall armyworm, , and Southwestern corn borer, , in cotton and maize, respectively, like commercial Vip3Aa. Distinct from Vip3Aa, Vip3Cb1 also protected maize against European corn borer, , the primary maize pest in the United States, with recent reports of resistance to Bt proteins. Consistent with previous reports, insects resistant to Vip3Aa were cross-resistant to Vip3Cb1. Cryo-electron microscopy demonstrated that Vip3Cb1 formed a pore-shaped tetramer upon proteolytic activation, in agreement with the pore-forming mechanism of action of Vip3Aa. Thus, diversifying the search beyond Bt has led to the discovery of the first Vip3 proteins from spp. with different activity spectra from Vip3Aa, providing additional tools to control pests, including those currently resistant to Bt Cry proteins.IMPORTANCENew insecticidal proteins are needed for controlling insect pests that can devastate crop yield if left uncontrolled. Diversifying our search for new insecticidal proteins in spp. resulted in the discovery of Vip3Cb1 and Vip3Cc1 insecticidal proteins active against lepidopteran crop pests. Structure and cross-resistance studies indicate overlap in the mechanism of action between Vip3Cb1 and commercial Vip3Aa. However, new activities, such as controlling European corn borer, make these proteins important new tools in the insect control toolbox.
リンクAppl Environ Microbiol / PubMed:40539778
手法EM (単粒子)
解像度2.61 - 3.04 Å
構造データ

47972

9efg

EMDB-47972, PDB-9efg:
VIP3Cb1 Toxin structure
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.04 Å

47974

9efi

EMDB-47974, PDB-9efi:
VIP3Cb1 Protoxin Structure
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.61 Å

化合物

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

由来
  • paenibacillus popilliae (バクテリア)
キーワードTOXIN / Tetramer / Lepidopteran / Protoxin

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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