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タイトルAn antidepressant mechanism underlying the allosteric inhibition of GluN2D-incorporated NMDA receptors at GABAergic interneurons.
ジャーナル・号・ページSci Adv, Vol. 11, Issue 10, Page eadq0444, Year 2025
掲載日2025年3月7日
著者Jilin Zhang / Jinjin Duan / Wei Li / Xian Wang / Shimin Ren / Luyu Ye / Fang Liu / Xiaoting Tian / Yang Xie / Yiming Huang / Yidi Sun / Nan Song / Tianyu Li / Xiang Cai / Zhiqiang Liu / Hu Zhou / Chenggang Huang / Yang Li / Shujia Zhu / Fei Guo /
PubMed 要旨-methyl-d-aspartate receptors (NMDARs), key excitatory ion channels, have gained attention as anti-depression targets. NMDARs consist of two GluN1 and two GluN2 subunits (2A-2D), which determine ...-methyl-d-aspartate receptors (NMDARs), key excitatory ion channels, have gained attention as anti-depression targets. NMDARs consist of two GluN1 and two GluN2 subunits (2A-2D), which determine their pharmacological properties. Few compounds selectively targeting GluN2 subunits with antidepressant effects have been identified. Here, we present YY-23, a compound that selectively inhibits GluN2C- or GluN2D-containing NMDARs. Cryo-EM analysis revealed that YY-23 binds to the transmembrane domain of the GluN2D subunit. YY-23 primarily affects GluN2D-containing NMDARs on GABAergic interneurons in the prefrontal cortex, suppressing GABAergic neurotransmission and enhancing excitatory transmission. Behavioral assays demonstrate YY-23's rapid antidepressant effects in both stress-naïve and stress-exposed models, which are lost in mice with global or selective knockout of the gene in parvalbumin-positive interneurons. These findings highlight GluN2D-containing NMDARs on GABAergic interneurons as potential depression treatment targets.
リンクSci Adv / PubMed:40043126 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度4.2 Å
構造データ

38847

8y1v

EMDB-38847: GluN1b-GluN2D NMDA receptor in complex with competitive antagonist R-CPP and allosteric inhibitor YY-23
PDB-8y1v: Structure of GluN1b-GluN2D NMDA receptor in complex with competitive antagonist R-CPP and allosteric inhibitor YY-23
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.2 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose


PDB 未公開エントリ

PDB-1lw8: Unknown entry

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN/INHIBITOR / ion channel / calcium permeable / glutamate receptor / neuronal expression / MEMBRANE PROTEIN / MEMBRANE PROTEIN-INHIBITOR complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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