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Structure paper

タイトルCryo-EM structure of a cell-free synthesized full-length human β1-adrenergic receptor in complex with G.
ジャーナル・号・ページStructure, Vol. 33, Issue 11, Page 1867-11877.e5, Year 2025
掲載日2025年11月6日
著者Felipe Merino / Zoe Köck / Utz Ermel / Philipp Dahlhaus / Anna Grimm / Anja Seybert / Jan Kubicek / Achilleas S Frangakis / Volker Dötsch / Daniel Hilger / Frank Bernhard /
PubMed 要旨The third intracellular loop (ICL3) of the β1-adrenergic receptor (β1AR) plays a critical role in regulating G protein coupling, yet the structural basis has remained unclear due to truncations of ...The third intracellular loop (ICL3) of the β1-adrenergic receptor (β1AR) plays a critical role in regulating G protein coupling, yet the structural basis has remained unclear due to truncations of ICL3 in all available structures of the β1AR in complex with G or a G protein mimetic nanobody. To address this, we used cell-free cotranslational insertion of full-length human β1AR into nanodiscs and determined its cryo-electron microscopy (cryo-EM) structure in complex with G. In this structure, ICL3 extends transmembrane helix 5, resulting in enhanced interactions with Gα and in a slight rotation of the engaged G protein. This repositioning enables new polar interactions between Gα, ICL2 and helix 8, while ICL1 and helix 8 form additional contacts with Gβ. These structural insights, supported by mutational analysis, demonstrate that ICL3 enhances G protein activation and downstream cAMP signaling by promoting more extensive interactions between the receptor and the heterotrimeric G protein.
リンクStructure / PubMed:40858117
手法EM (単粒子)
解像度3.3 Å
構造データ

19683

8s2t

EMDB-19683, PDB-8s2t:
Cryo-EM structure of cell-free synthesized Human beta-1 adrenergic receptor cotranslationally inserted into a lipidic nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

化合物

ChemComp-5FW:
ISOPRENALINE

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • lama glama (ラマ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / Signal transduction / GPCR / co-translational nanodisc insertion / G-protein

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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