[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルCryo-EM exposes diverse polymorphism in IAPP mutants to guide the rational design of peptide-based therapeutics.
ジャーナル・号・ページJ Mol Biol, Vol. 437, Issue 21, Page 169405, Year 2025
掲載日2025年11月1日
著者Saik Ann Ooi / Dylan Valli / Mikołaj I Kuska / Helena Marí / Himanshu Chaudhary / Weixiao Yuan Wahlgren / Sebastian Westenhoff / Alesia A Tietze / Anna Novials / Joan-Marc Servitja / Michał Maj /
PubMed 要旨In the pursuit of potential therapeutic agents for type 2 diabetes, non-amyloidogenic forms of the human Islet Amyloid Polypeptide (hIAPP) containing site-specific mutations are of significant ...In the pursuit of potential therapeutic agents for type 2 diabetes, non-amyloidogenic forms of the human Islet Amyloid Polypeptide (hIAPP) containing site-specific mutations are of significant interest. In the present study, we dissect the three proline mutations present in the core region of the non-amyloidogenic rat IAPP into single-point mutations at A25P, S28P, and S29P sites. We apply high-resolution cryo-electron microscopy and solve the structures of 6 polymorphs formed by these mutants, revealing the peptide's self-assembly patterns and identifying critical interactions that reinforce these structures in the presence of the β-sheet breaker. A unique trimeric aggregate with C3 symmetry was identified in the A25P mutant, which we resolved with a 3.05 Å resolution, while asymmetric trimeric assemblies were observed in the other mutants. Guided by the high-resolution structural models of A25P and S28P fibrils obtained in our study, we successfully designed novel non-amyloidogenic mutants of IAPP with potential therapeutic value. Our findings demonstrate the immense potential of structure-based approaches in developing effective therapeutics against amyloid diseases.
リンクJ Mol Biol / PubMed:40850490
手法EM (らせん対称)
解像度3.0 - 4.07 Å
構造データ

18441

8qj1

EMDB-18441, PDB-8qj1:
Cryo-EM structure of human islet amyloid polypeptide (hIAPP) mutant A25P, polymorph 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.06 Å

18671

8qvp

EMDB-18671, PDB-8qvp:
Cryo-EM structure of human islet amyloid polypeptide (hIAPP) mutant S29P, polymorph 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.75 Å

18672

8qvq

EMDB-18672, PDB-8qvq:
Cryo-EM structure of human islet amyloid polypeptide (hIAPP) mutant S29P, polymorph 2
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.07 Å

19353

8rm8

EMDB-19353, PDB-8rm8:
Cryo-EM structure of human islet amyloid polypeptide (hIAPP) mutant S28P, polymorph 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.0 Å

19354

8rm9

EMDB-19354, PDB-8rm9:
Cryo-EM structure of human islet amyloid polypeptide (hIAPP) mutant S28P, polymorph 2
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.06 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / amyloid

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る