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タイトルSeeded assembly in vitro does not replicate the structures of α-synuclein filaments from multiple system atrophy.
ジャーナル・号・ページFEBS Open Bio, Vol. 11, Issue 4, Page 999-991013, Year 2021
掲載日2021年2月24日
著者Sofia Lövestam / Manuel Schweighauser / Tomoyasu Matsubara / Shigeo Murayama / Taisuke Tomita / Takashi Ando / Kazuko Hasegawa / Mari Yoshida / Airi Tarutani / Masato Hasegawa / Michel Goedert / Sjors H W Scheres /
PubMed 要旨The propagation of conformational strains by templated seeding is central to the prion concept. Seeded assembly of α-synuclein into filaments is believed to underlie the prion-like spreading of ...The propagation of conformational strains by templated seeding is central to the prion concept. Seeded assembly of α-synuclein into filaments is believed to underlie the prion-like spreading of protein inclusions in a number of human neurodegenerative diseases, including Parkinson's disease, dementia with Lewy bodies (DLB) and multiple system atrophy (MSA). We previously determined the atomic structures of α-synuclein filaments from the putamen of five individuals with MSA. Here, we used filament preparations from three of these brains for the in vitro seeded assembly of recombinant human α-synuclein. We find that the structures of the seeded assemblies differ from those of the seeds, suggesting that additional, as yet unknown, factors play a role in the propagation of the seeds. Identification of these factors will be essential for understanding the prion-like spreading of α-synuclein proteinopathies.
リンクFEBS Open Bio / PubMed:33548114 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.18 - 4.23 Å
構造データ

12264

7nca

EMDB-12264, PDB-7nca:
Type 1A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.47 Å

12265

7ncg

EMDB-12265, PDB-7ncg:
Type 2A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.43 Å

12266

7nch

EMDB-12266, PDB-7nch:
Type 1B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.84 Å

12267

7nci

EMDB-12267, PDB-7nci:
Type 2B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.55 Å

12268

7ncj

EMDB-12268, PDB-7ncj:
Type 2AB alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.23 Å

12269

7nck

EMDB-12269, PDB-7nck:
Type 3 alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 5
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.18 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Amyloid (アミロイド) / Multiple System Atrophy (多系統萎縮症) / Neurodegeneration (神経変性疾患) / alpha-synuclein (Α-シヌクレイン) / filament

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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