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タイトルEnhanced B cell priming induces broadly neutralizing HIV-1 apex antibodies.
ジャーナル・号・ページNature, Year 2026
掲載日2026年6月30日
著者Lorie Marchitto / Kshitij Wagh / Ryan S Roark / Severin Coleon / Hui Li / Ashwin N Skelly / Michael P Hogarty / Rumi Habib / Wenge Ding / Kasirajan Ayyanathan / Weimin Liu / Zizhang Sheng / Yicheng Guo / Joena Bal / Lena M Smith / Laura L Sutherland / Younghoon Park / Andrew J Connell / Frederic Bibollet-Ruche / Emily Lewis / Samantha J Plante / Macy J Akeley / Jinery Lora / Chengyan Zhao / John W Carey / Christian L Martella / Yingying Li / Mary S Campion / Melinda G Lituchy / Rebecca A Osbaldeston / Colette G Gordon / Amie Albertus / Justin Su / Chiaki Noguchi / Ying K Tam / Christopher Barbosa / Bo Liang / Khaled Amereh / Xuduo Li / Agnes A Walsh / Darrell J Irvine / Raiees Andrabi / Robert J Edwards / Edward F Kreider / Drew Weissman / Lawrence Shapiro / Peter D Kwong / Bette T Korber / Barton F Haynes / Kevin O Saunders / Beatrice H Hahn / George M Shaw /
PubMed 要旨Efficient priming of B cell precursors is a rate-limiting step in the induction of V2 apex broadly neutralizing antibodies (bNAbs). Here, we describe a novel germline-targeted HIV-1 Env (CAP256.OPT4) ...Efficient priming of B cell precursors is a rate-limiting step in the induction of V2 apex broadly neutralizing antibodies (bNAbs). Here, we describe a novel germline-targeted HIV-1 Env (CAP256.OPT4) that increases the efficiency of V2 apex bNAb precursor priming by 30-400 fold compared with wild-type HIV-1 Envs and induces - in >90% of macaques - neutralization breadth that includes N130-containing viruses. Using three different delivery platforms - persistently replicating simian human immunodeficiency viruses (SHIVs), protein nanoparticles, and mRNA - we show bNAb priming as early as 4 weeks post-infection or immunization, and neutralization breadth in plasma by 12 weeks. In 14 SHIV-infected macaques, neutralization breadth reached as high as 90% on a 21-virus panel with potency as great as 1:20,000 (50% inhibitory dilution, ID). Monoclonal bNAbs isolated from these animals were similarly broad and potent, with cryo-EM structures representing three distinct lineages revealing canonical needle-like HCDR3 binding. Env-Ab coevolution and structural analyses identified five key residues and loop features under positive selection and temporally associated with neutralization breadth. Importantly, prime-boost immunogens designed to capture these features induced broad and potent neutralization of globally diverse viruses including those containing N130 glycan. Further, rhesus bNAbs were not restricted to IGHD3-15*01 heavy chain alleles. These results expand the utility of the rhesus model for HIV-1 vaccine design and provide a molecular blueprint for inducing V2 apex bNAbs in rhesus and humans.
リンクNature / PubMed:42380659
手法EM (単粒子)
解像度2.9 - 3.3 Å
構造データ

74654

9zrx

EMDB-74654, PDB-9zrx:
Cryo-EM structure of SHIV-elicited CE79-1571 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

74655

9zry

EMDB-74655, PDB-9zry:
Cryo-EM structure of SHIV-elicited CN81-2029 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

74656

9zrz

EMDB-74656, PDB-9zrz:
Cryo-EM structure of SHIV-elicited CI93-1365 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

由来
  • macaca mulatta (アカゲザル)
  • human immunodeficiency virus (ヒト免疫不全ウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / Neutralizing antibody / HIV V2 apex / SHIV-elicited / Immune complex / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / SHIV / neutralization

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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