[日本語] English
文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルTransgenic mouse-derived human monoclonal antibodies targeting EBV gp350 and gp42 provide basis for therapeutic development.
ジャーナル・号・ページCell Rep Med, Vol. 7, Issue 2, Page 102618, Year 2026
掲載日2026年2月17日
著者Crystal B Chhan / Kevin Lang / Amelia R Davis / Yu-Hsin Wan / Nicholas T Aldridge / Gargi Kher / Samuel C Scharffenberger / Samantha R Hardy / Roman Iureniev / Natalia V Giltiay / Kristina R Edwards / Stefan Radtke / Hans-Peter Kiem / Marie Pancera / Andrew T McGuire /
PubMed 要旨Epstein-Barr virus (EBV) causes infectious mononucleosis and contributes to neurodegenerative disorders and malignancies, particularly in immune-compromised hosts. Transplant patients face high risk ...Epstein-Barr virus (EBV) causes infectious mononucleosis and contributes to neurodegenerative disorders and malignancies, particularly in immune-compromised hosts. Transplant patients face high risk of post-transplant lymphoproliferative disease, a life-threatening EBV-driven lymphoma. There are no EBV-specific vaccines or treatments; however, neutralizing antibodies against EBV glycoproteins may offer utility as therapeutic agents. EBV entry into B cells involves gp350, which binds complement receptors, and gp42, which engages HLA class II to trigger fusion. Most existing monoclonal antibodies (mAbs) against these antigens are non-human, limiting clinical use. Using a transgenic mouse model, we generate two gp350 and eight gp42 genetically human neutralizing mAbs that block receptor binding. Structural analyses reveal extended sites of vulnerability relevant to vaccine development. Delivery of a gp42 mAb protects humanized mice from EBV challenge, while a gp350 mAb provides partial protection. These mAbs highlight the utility of transgenic mice to produce therapeutic mAbs for preventing EBV-driven disease.
リンクCell Rep Med / PubMed:41707657 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度3.93 - 16.16 Å
構造データ

EMDB-71585: Negative stain EM map of EBV glycoprotein gH/gL in complex with glycoprotein gp42 and FAB ATX-42-1.1 open conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 9.86 Å

EMDB-71586: Negative stain EM map of EBV glycoprotein gH/gL in complex with glycoprotein gp42 and FAB ATX-42-2 Open conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 8.45 Å

EMDB-71587: Negative stain EM map of EBV glycoprotein gH/gL in complex with glycoprotein gp42 and FAB ATX-42-1.1 partially open conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 16.16 Å

EMDB-71588: Negative stain EM map of EBV glycoprotein gH/gL in complex with glycoprotein gp42 and FAB ATX-42-2 closed conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 11.6 Å

EMDB-71589: Negative stain EM map of EBV glycoprotein gH/gL in complex with glycoprotein gp42 and HLA-DR1 Beta chain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 11.62 Å

EMDB-71590: Negative Stain EM map of EBV glycoprotein gp350 in complex with ATX-350-1 FAB and 72A1 FAB
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.69 Å

EMDB-71592: Negative Stain EM map of EBV glycoprotein gp350 in complex with ATX-350-2 FAB
手法: EM (単粒子) / 解像度: 7.67 Å

EMDB-71593: Negative Stain EM map of EBV glycoprotein gp350 in complex with ATX-350-1 FAB
手法: EM (単粒子) / 解像度: 12.84 Å

EMDB-71594: Negative Stain EM map of EBV glycoprotein gp350 in complex with 72A1 FAB
手法: EM (単粒子) / 解像度: 9.88 Å

PDB-9pf9:
X-ray crystal structure of ATX-350-2 Fab bound to Epstein-Barr virus glycoprotein 350
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.93 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • human gammaherpesvirus 4 (ヘルペスウイルス)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • Homo sapiens (ヒト)
キーワードIMMUNE SYSTEM / Viral protein / Complex / Antibody / EBV

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る