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タイトルIn situ characterization of mitochondrial Hsp60-Hsp10 chaperone complex under folding stress.
ジャーナル・号・ページSci Adv, Vol. 11, Issue 43, Page eadw6064, Year 2025
掲載日2025年10月24日
著者Mingyu Jung / Minjung Kim / Su Jin Ham / Jongkyeong Chung / Soung-Hun Roh /
PubMed 要旨Mitochondrial proteostasis is critical for maintaining mitochondrial function, and its disruption induces mitochondrial unfolded protein response, which up-regulates chaperones to alleviate protein- ...Mitochondrial proteostasis is critical for maintaining mitochondrial function, and its disruption induces mitochondrial unfolded protein response, which up-regulates chaperones to alleviate protein-folding stress. However, how these chaperones mitigate protein-folding stress remains unclear. Here, using correlated cryo-electron tomography, we show that folding stress triggers marked mitochondrial morphological changes, including the accumulation of amorphous protein aggregates and increased abundance and spatial clustering of the mitochondrial heat shock protein 60-heat shock protein 10 (mtHsp60-Hsp10) complex. Subtomogram analysis revealed the in situ architecture and conformational heterogeneity of mtHsp60-Hsp10 under stress, which retains its canonical double-ring structure while adopting distinct football, half-football, and bullet-like states. Notably, the mtHsp60-Hsp10 complex encapsulates unstructured substrates through conserved hydrophobic interactions. We further demonstrate that knockdown of the mtHsp60-Hsp10 complex exacerbates folding stress, as evidenced by elevated cellular stress responses and activation of mitophagy. Our study defines the in situ structural properties of the mtHsp60-Hsp10 complex and provides mechanistic insight into how it safeguards mitochondrial proteostasis under folding stress.
リンクSci Adv / PubMed:41124257 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均)
解像度7.3 - 27.0 Å
構造データ

EMDB-62702: mthsp60-hsp10_consensus
PDB-9l8p: in situ structure of mtHsp60-Hsp10
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 7.3 Å

EMDB-62703: mthsp60-hsp10_without_symmetry
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.1 Å

EMDB-62704: mthsp60-hsp10_with_additional_interaction
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 9.8 Å

EMDB-62711: mthsp60-hsp10 with sparse substrate density
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.5 Å

EMDB-62713: mthsp60-hsp10 with bulky substrate density on single chamber
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.7 Å

EMDB-62714: mthsp60-hsp10 with bulky substrate density in both chamber
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.5 Å

EMDB-62747: mthsp60-hsp10 with U-shaped substrate density
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 9.3 Å

EMDB-65492: In situ structure of mtHsp60-Hsp10 bullet-like conformation
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 21.0 Å

EMDB-65493: in situ structure of mtHsp60-Hsp10 half-football conformation
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 27.0 Å

化合物

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM

ChemComp-K:
Unknown entry / カリウムカチオン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードCHAPERONE / mtHsp60-Hsp10

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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