[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルThe architecture of Tetrahymena telomerase holoenzyme.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 496, Issue 7444, Page 187-192, Year 2013
掲載日2013年4月11日
著者Jiansen Jiang / Edward J Miracco / Kyungah Hong / Barbara Eckert / Henry Chan / Darian D Cash / Bosun Min / Z Hong Zhou / Kathleen Collins / Juli Feigon /
PubMed 要旨Telomerase adds telomeric repeats to chromosome ends using an internal RNA template and a specialized telomerase reverse transcriptase (TERT), thereby maintaining genome integrity. Little is known ...Telomerase adds telomeric repeats to chromosome ends using an internal RNA template and a specialized telomerase reverse transcriptase (TERT), thereby maintaining genome integrity. Little is known about the physical relationships among protein and RNA subunits within a biologically functional holoenzyme. Here we describe the architecture of Tetrahymena thermophila telomerase holoenzyme determined by electron microscopy. Six of the seven proteins and the TERT-binding regions of telomerase RNA (TER) have been localized by affinity labelling. Fitting with high-resolution structures reveals the organization of TERT, TER and p65 in the ribonucleoprotein (RNP) catalytic core. p50 has an unanticipated role as a hub between the RNP catalytic core, p75-p19-p45 subcomplex, and the DNA-binding Teb1. A complete in vitro holoenzyme reconstitution assigns function to these interactions in processive telomeric repeat synthesis. These studies provide the first view of the extensive network of subunit associations necessary for telomerase holoenzyme assembly and physiological function.
リンクNature / PubMed:23552895 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度25.0 - 35.0 Å
構造データ

EMDB-5804:
Three-dimensional structure of endogenously assembled Tetrahymena telomerase holoenzyme determined by negative-stain electron microscopy
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-5807:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation II)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5808:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation III)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5809:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation IV)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5810:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation V)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5811:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation VI)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5812:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation VII)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5813:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation VIII)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5814:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation IX)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5815:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, conformation X)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5816:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (TERT-f, stable conformation)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 35.0 Å

EMDB-5817:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (TERT-f, subcomplex lacking p65 N-terminus)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 35.0 Å

EMDB-5818:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (TERT-f, subcomplex lacking Teb1)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 35.0 Å

EMDB-5819:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (TERT-f, subcomplex lacking p75-p19-p45)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 35.0 Å

EMDB-5820:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (f-Teb1C, stable conformation)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5821:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (TERT-f, affinity labeled by anti-FLAG Fab)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5822:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (Teb1-f, affinity labeled by anti-FLAG Fab)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5823:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (f-p50, affinity labeled by two copies of anti-FLAG Fab)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-5824:
Negative-stain electron microscopy reconstruction of Tetrahymena telomerase (f-p50, affinity labeled by one copy of anti-FLAG Fab)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

由来
  • Tetrahymena thermophila (真核生物)
  • Mus musculus (ハツカネズミ)

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る