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タイトルStructures of the sheathed flagellum reveal mechanisms of assembly and rotation in Vibrio cholerae.
ジャーナル・号・ページNat Microbiol, Vol. 10, Issue 12, Page 3305-3314, Year 2025
掲載日2025年10月31日
著者Wangbiao Guo / Sarah Zhang / Jin Hwan Park / Venus Stanton / Merrill Asp / Helen Herrera / Jung-Shen Benny Tai / Jian Yue / Jiaqi Wang / Jiaqi Guo / Rajeev Kumar / Jack M Botting / Shenping Wu / Jing Yan / Karl E Klose / Fitnat H Yildiz / Jun Liu /
PubMed 要旨Motility promotes the complex life cycle and infectious capabilities of Vibrio cholerae and is driven by rotation of a single polar flagellum. The flagellar filament comprises four flagellin proteins ...Motility promotes the complex life cycle and infectious capabilities of Vibrio cholerae and is driven by rotation of a single polar flagellum. The flagellar filament comprises four flagellin proteins (FlaA-D) and is covered by a membranous sheath continuous with the outer membrane. Here we combine in situ cryo-electron microscopy single-particle analysis, fluorescence microscopy and molecular genetics to determine 2.92-3.43 Å structures of the sheathed flagellar filament from intact bacteria. Our data reveal the spatial arrangement of FlaA-D, showing that FlaA localizes at the cell pole and functions as a template for filament assembly involving multiple flagellins. Unlike unsheathed flagellar filaments, the sheathed filament from V. cholerae possesses a highly conserved core but a smooth, hydrophilic surface adjacent to the membranous sheath. A tiny conformational change at the single flagellin level results in a supercoiled filament and curved membranous sheath, supporting a model wherein the filament rotates separately from the sheath, enabling the distinct motility of V. cholerae.
リンクNat Microbiol / PubMed:41174224
手法EM (単粒子) / EM (らせん対称)
解像度2.45 - 3.43 Å
構造データ

49125

9n8a

EMDB-49125, PDB-9n8a:
In situ structure of the sheathed FlaD flagellar filament in Vibrio cholerae
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.92 Å

49126

9n8b

EMDB-49126, PDB-9n8b:
In situ unsheathed flagellar filament of Vibrio cholerae resolved with helical reconstruction.
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.45 Å

49128

9n8g

EMDB-49128, PDB-9n8g:
In situ sheathed FlaA flagellar filament of Vibrio cholerae
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.43 Å

49129

9n8h

EMDB-49129, PDB-9n8h:
In situ sheathed flagellar filament of Vibrio cholerae resolved with helical reconstruction.
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.73 Å

49131

9n8m

EMDB-49131, PDB-9n8m:
In situ sheathed flagellar FlaC filament in Vibrio cholerae.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.16 Å

71351

9p7r

EMDB-71351, PDB-9p7r:
In situ structure of the sheathed FlaB flagellar filament in Vibrio cholerae
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.16 Å

由来
  • vibrio cholerae o1 biovar el tor str. n16961 (コレラ菌)
  • vibrio cholerae o1 biovar el tor (コレラ菌)
キーワードMOTOR PROTEIN / In situ cryo-EM / sheathed flagellar filament / FlaD Vibrio cholerae. / unsheathed flagellar filament / FlaC / Vibrio cholerae. / FlaB Vibrio cholerae.

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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