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タイトルStructural determinants of G protein subtype selectivity at the serotonin receptor 5-HT1A.
ジャーナル・号・ページSci Adv, Vol. 11, Issue 31, Page eadu9851, Year 2025
掲載日2025年8月1日
著者Audrey L Warren / Gregory Zilberg / Anwar Abbassi / Alejandro Abraham / Shifan Yang / Daniel Wacker /
PubMed 要旨Activation of the serotonin receptor 5-HT1A has been shown to regulate mood and cognition, making 5-HT1A an important target in the treatment of anxiety, depression, and psychosis. Although the ...Activation of the serotonin receptor 5-HT1A has been shown to regulate mood and cognition, making 5-HT1A an important target in the treatment of anxiety, depression, and psychosis. Although the receptor signals through inhibitory G proteins, more work is necessary to understand differences in transducer coupling and its relation to functional activity. To develop a molecular understanding of the differences underlying transducer coupling and activation, we performed structure-activity relationship studies of 5-HT1A with distinct G proteins. Through a combination of in vitro assays, we identified a potent partial agonist that selectively engages a G protein subtype. We further investigated the differences in G protein engagement at 5-HT1A with cryo-electron microscopy, determining structures of 5-HT1A bound to distinct ligands and G protein subtypes. Combined with subsequent structure-guided mutagenesis and signaling assays, our studies uncover both orthosteric and allosteric determinants of agonist-specific stimulation of distinct transducers.
リンクSci Adv / PubMed:40749070
手法EM (単粒子)
解像度2.74 - 3.03 Å
構造データ

47300

9dyd

EMDB-47300, PDB-9dyd:
Asenapine-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Goa protein complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.96 Å

47301

9dye

EMDB-47301, PDB-9dye:
Buspirone-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Goa protein complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

47302

9dyf

EMDB-47302, PDB-9dyf:
Asenapine-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gi1 protein complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.74 Å

48164

9md1

EMDB-48164, PDB-9md1:
Buspirone-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gz protein complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.03 Å

化合物

PDB-1bir:
RIBONUCLEASE T1, PHE 100 TO ALA MUTANT COMPLEXED WITH 2' GMP

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル

ChemComp-J40:
[(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate


化合物 画像なし

ChemComp-YLX:
Unknown entry

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • escherichia coli (大腸菌)
キーワードSIGNALING PROTEIN / GPCR Signaling Complex / Serotonin Receptor

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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