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Structure paper

タイトルStructure-guided design of a peripherally restricted chemogenetic system.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 187, Issue 26, Page 7433-7449.e20, Year 2024
掲載日2024年12月26日
著者Hye Jin Kang / Brian E Krumm / Adrien Tassou / Matan Geron / Jeffrey F DiBerto / Nicholas J Kapolka / Ryan H Gumpper / Kensuke Sakamoto / D Dewran Kocak / Reid H J Olsen / Xi-Ping Huang / Shicheng Zhang / Karen L Huang / Saheem A Zaidi / MyV T Nguyen / Min Jeong Jo / Vsevolod Katritch / Jonathan F Fay / Grégory Scherrer / Bryan L Roth /
PubMed 要旨Designer receptors exclusively activated by designer drugs (DREADDs) are chemogenetic tools for remotely controlling cellular signaling, neural activity, behavior, and physiology. Using a structure- ...Designer receptors exclusively activated by designer drugs (DREADDs) are chemogenetic tools for remotely controlling cellular signaling, neural activity, behavior, and physiology. Using a structure-guided approach, we provide a peripherally restricted Gi-DREADD, hydroxycarboxylic acid receptor DREADD (HCAD), whose native receptor is minimally expressed in the brain, and a chemical actuator that does not cross the blood-brain barrier (BBB). This was accomplished by combined mutagenesis, analoging via an ultra-large make-on-demand library, structural determination of the designed DREADD receptor via cryoelectron microscopy (cryo-EM), and validation of HCAD function. Expression and activation of HCAD in dorsal root ganglion (DRG) neurons inhibit action potential (AP) firing and reduce both acute and tissue-injury-induced inflammatory pain. The HCAD chemogenetic system expands the possibilities for studying numerous peripheral systems with little adverse effects on the central nervous system (CNS). The structure-guided approach used to generate HCAD also has the potential to accelerate the development of emerging chemogenetic tools for basic and translational sciences.
リンクCell / PubMed:39631393 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.62 - 3.24 Å
構造データ

42538

8utd

EMDB-42538, PDB-8utd:
CryoEM Structure of HCA2-Gi1 in complex with MK-1903
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.24 Å

42587

8uuj

EMDB-42587, PDB-8uuj:
CryoEM Structure of HCA2 DREADD Gi1 in complex with FCH-2296413
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.62 Å

45616

9cib

EMDB-45616, PDB-9cib:
CryoEM Structure of HCA2 DREADD Gi1 in complex with FCH-2296413 (Local Refinement)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.62 Å

化合物


化合物 画像なし

ChemComp-XOT:
Unknown entry


化合物 画像なし

ChemComp-XI9:
Unknown entry

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • lama glama (ラマ)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / GPCR / HCA2 / MK 1903 / DREADD

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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